| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,335,655 | T→A | 16.6% | intergenic (‑65/+39) | eptA ← / ← adiC | lipid A phosphoethanolamine transferase/arginine:agmatine antiporter |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,335,655 | 0 | T | A | 16.6% | 443.5 / 70.6 | 173 | intergenic (‑65/+39) | eptA/adiC | lipid A phosphoethanolamine transferase/arginine:agmatine antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (56/88); new base A (14/15); total (70/103) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.08e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAAT > NC_000913/4335557‑4335752 | cAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTc > 2:1100946/1‑99 (MQ=255) agagGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCAAACAAAGTGCGCATATGCTCGAAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTaa > 2:665323/1‑100 (MQ=255) gggTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGt > 2:1739319/1‑100 (MQ=255) ggTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACCTCACGGTGTTTCCATCGAACACAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGtt < 1:2508958/100‑1 (MQ=255) gTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTg < 2:2853499/100‑1 (MQ=255) tCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCGTCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTgg > 2:2730371/1‑100 (MQ=255) tCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTgg < 2:1750018/100‑1 (MQ=255) cTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGc > 2:1240289/1‑100 (MQ=255) cTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTg < 2:3439428/98‑1 (MQ=255) cTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGc < 2:1932287/100‑1 (MQ=255) tttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCt < 2:3639181/100‑1 (MQ=255) tttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCt > 2:1027769/1‑100 (MQ=255) tttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCt < 1:673531/100‑1 (MQ=255) tttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCt < 2:2600546/100‑1 (MQ=255) ttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCt > 1:2180959/1‑99 (MQ=255) ttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTCGCt > 1:2760188/1‑99 (MQ=255) ttttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCtt < 2:3257507/100‑1 (MQ=255) gcttatggggCGCTTCAACATCACGGTGGTTCCATCGAACAAAGTGCGCAGATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTgg < 1:3371539/89‑1 (MQ=37) ttcggtacGCGTTTCAATATCACGGTGTGTCCATACAACAAAGTTCGTATATTTTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCtta < 1:3789233/96‑2 (MQ=16) ttAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCtt‑‑tt < 2:2840070/100‑1 (MQ=255) tagtagGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTa < 2:2992959/100‑1 (MQ=255) gtagGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATg > 2:1874820/1‑100 (MQ=255) gtagGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATg > 2:3297458/1‑100 (MQ=255) agGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑tt > 1:3051267/1‑100 (MQ=255) agGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCttaattttg < 2:1796773/100‑8 (MQ=37) gcgcTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTg < 2:1428504/100‑1 (MQ=255) cgcTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGc < 1:3407938/100‑1 (MQ=255) cgcTTCAACATCACGGTGTTTCCATAGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑ttt > 1:2985452/1‑98 (MQ=255) cAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTgg > 2:229837/1‑98 (MQ=255) cAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGAt < 2:373701/100‑1 (MQ=255) aaCATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGAtt < 1:3677751/100‑1 (MQ=255) aaCATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGAtt > 2:454832/1‑100 (MQ=255) aCATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTa < 1:3111282/100‑1 (MQ=255) aCATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAAACTTAAGGTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTa > 1:2721759/1‑100 (MQ=255) cACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAggg < 1:90544/100‑1 (MQ=255) gtgtTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAAt < 1:3661879/100‑1 (MQ=255) tgtTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAAtt < 2:705393/100‑1 (MQ=255) gtTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTa > 2:192304/1‑100 (MQ=255) gtTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTa < 1:1547844/100‑1 (MQ=255) tCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATc < 2:3142149/100‑1 (MQ=255) cATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCtt > 1:3301364/1‑100 (MQ=255) aTCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCttt > 2:1511473/1‑100 (MQ=255) tCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTg < 2:3220600/100‑1 (MQ=255) gAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCt < 2:2193130/100‑1 (MQ=255) aaCAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCtt > 2:2648193/1‑100 (MQ=255) aaaGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGAAATTAATCTTTGTTTAtt > 1:1040004/1‑100 (MQ=255) aaGTGCGCATATGCTCGCAAAGCGAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTg < 1:505314/100‑1 (MQ=255) aaGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAGAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTGAGGTTGGCGT‑‑TGATG‑TTTGCTGGGTTAAGGGTAATTAATCTTTGCTTATTg > 1:768079/1‑100 (MQ=255) aGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTgg < 2:1720374/100‑1 (MQ=255) tGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTg < 1:1716397/100‑1 (MQ=255) tGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTg < 2:2721780/100‑1 (MQ=255) gcgcATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGc < 2:593600/100‑1 (MQ=255) gcgcATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGc < 1:3433332/100‑1 (MQ=255) gcgcATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGACAACCTCAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGATGGATAAAGAGGAATTAATCTTTGCTTATTg > 1:3559499/1‑96 (MQ=255) cATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATc < 1:3741516/100‑1 (MQ=255) atatGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAATGTTAGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCt < 1:1079382/100‑1 (MQ=255) tatGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTa < 1:1257440/100‑1 (MQ=255) ttcTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAg < 1:2609130/98‑1 (MQ=255) tGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAg < 2:1323088/100‑1 (MQ=255) tGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAg > 2:2061839/1‑100 (MQ=255) gCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAgg > 1:1316314/1‑100 (MQ=255) cTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAggg < 1:200803/100‑1 (MQ=255) tCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGa > 2:1373155/1‑100 (MQ=255) cGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGAt > 2:3315164/1‑100 (MQ=255) gtaaagcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTACTTAAGGTTGACTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTAGTGCAGGTAAGGGa < 1:1678486/96‑1 (MQ=255) gcaaagcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCGTATTGGTGCATCTAAGGGATa > 2:2572823/1‑100 (MQ=255) aaagcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACg < 2:385363/100‑1 (MQ=255) aagcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACgg > 2:1224087/1‑100 (MQ=255) aagcaaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACgg > 1:3515217/1‑100 (MQ=255) caaaATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGtt > 2:3678985/1‑100 (MQ=255) cataaaaGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGtttt > 1:3316449/6‑100 (MQ=38) ataaaaGCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGttttt > 2:936910/5‑100 (MQ=38) aaTTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGttttt < 1:1551271/100‑1 (MQ=255) aTTAAGCCAGCCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATGGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 1:1099159/100‑1 (MQ=255) aTTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATATGGGTTTTTa < 1:3870473/100‑1 (MQ=255) aTTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 1:2572805/100‑1 (MQ=255) ttAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGTTTGTCTT‑‑TTATT‑TTTGCTGGATTAAGGAGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTa < 1:2746585/99‑1 (MQ=255) ttAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTGTG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAt < 2:2783865/100‑1 (MQ=255) ttAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAt < 2:1048552/100‑1 (MQ=255) tAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATg < 2:2312631/100‑1 (MQ=255) tAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATg < 2:2791778/100‑1 (MQ=255) aaGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGTGGAATTTATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTAt > 1:2771015/1‑98 (MQ=255) aGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTa < 1:988117/100‑1 (MQ=255) gCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAg > 1:2947033/1‑100 (MQ=255) gCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTTAATTTTGCTTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATg > 2:507642/1‑100 (MQ=21) gCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAg > 2:3062755/1‑100 (MQ=255) gCCAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGC‑T‑‑TAAT‑‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATGTTTGATTATTGATGCATCAAAGGGATACGGGTATTTATGTa > 1:424770/1‑97 (MQ=18) ccAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGc > 2:3797057/1‑100 (MQ=255) ccAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGC‑T‑‑TAAT‑‑TTTGCTGGATTAAGGTCAATTAATCTTTGCGTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGGTTTTa > 1:3612990/1‑92 (MQ=18) cAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGcc > 1:3866018/1‑100 (MQ=255) cAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGTGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGCTTTTATGTAGc > 1:662317/1‑99 (MQ=38) cAACCTTAAGAACTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGcc > 1:2005454/1‑100 (MQ=255) ccTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGt < 2:3105572/100‑1 (MQ=255) cTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGtt > 1:1348618/1‑100 (MQ=255) ttAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTg > 1:2759747/1‑100 (MQ=255) ttAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTg < 2:3858173/100‑1 (MQ=255) ttAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTg < 1:1781719/100‑1 (MQ=255) ttAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTg < 2:235893/100‑1 (MQ=255) tAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGt > 2:2846713/1‑100 (MQ=255) aGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTaa < 2:3574871/100‑1 (MQ=255) | TCAAAGAGGGTCTTTTTAGTAGGCGCTTCAACATCACGGTGTTTCCATCGAACAAAGTGCGCATATGCTCGCAAAGCAAAATTAAGCCAACCTTAAGTTCTTAAGGTTGGCTT‑‑TTATG‑TTTGCTGGATTAAGGGGAATTAATCTTTGCTTATTGGTGCATCTAAGGGATACGGGTTTTTATGTAGCCGGTTGTAAT > NC_000913/4335557‑4335752 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |