| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3313290 | NA (NA) | 13 (0.100) | 9/164 | NT | NA | noncoding (39/77 nt) | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 3313328 | NA (NA) | noncoding (77/77 nt) | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP242 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
TTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGA > NC_000913/3313229‑3313427 | tttCAGGAGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGCTAAGCCGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGCAGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGG < 1:190239‑M2/100‑1 (MQ=255) ttCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGa < 1:1105167‑M2/100‑2 (MQ=255) ttCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGa < 2:3603442‑M2/100‑2 (MQ=255) cAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAc > 1:1621031/1‑100 (MQ=255) ngTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAAccc > 1:1830142/2‑100 (MQ=255) gTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCt < 2:2805901/100‑1 (MQ=255) gAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTaaa > 2:2088617/1‑100 (MQ=255) aaGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTaaaa > 1:3073914/1‑100 (MQ=255) gggCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAc > 1:1965258/1‑100 (MQ=255) ggCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAcc < 2:1029863/100‑1 (MQ=255) ggCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAAcc < 2:1726066/100‑1 (MQ=255) cTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCtt < 1:601573/100‑1 (MQ=255) tGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa < 1:3489548/100‑1 (MQ=255) gTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTaa < 2:1421260/100‑1 (MQ=255) gTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCAGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTa > 1:1512326/1‑99 (MQ=255) aCGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATACCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCaa > 2:1485116/1‑100 (MQ=255) cGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAAt < 2:2607855/100‑1 (MQ=255) gACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTa < 1:507188/100‑1 (MQ=255) aCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTAc > 1:1084517/1‑100 (MQ=255) aCCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTAc > 1:2054920/1‑100 (MQ=255) ccTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACg > 2:2024664/1‑100 (MQ=255) cTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGt > 2:87812/1‑100 (MQ=255) tGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGtt > 1:2157843/1‑100 (MQ=255) gATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTg > 2:255570/1‑100 (MQ=255) aTAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTgg < 1:2541147/100‑1 (MQ=255) tAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGa < 1:1184274/100‑1 (MQ=255) aaGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGa < 2:1312668/99‑1 (MQ=255) aaGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAt > 2:2263251/1‑100 (MQ=255) aGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtc > 2:3216245/1‑100 (MQ=255) gACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtct > 2:1936361/1‑100 (MQ=255) gACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtct > 1:801317/1‑100 (MQ=255) aCGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGAtctc < 1:286312/100‑1 (MQ=255) cgcgCCAGCGTCACATCAGGCAATCTATGCCGGATGCATCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCg < 1:2315887/100‑1 (MQ=255) gcgcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCga < 2:906058/100‑1 (MQ=255) gcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgatg < 1:2454940/100‑1 (MQ=255) gcCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCgatg < 2:560952/100‑1 (MQ=255) gCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGAttt > 2:762638/1‑100 (MQ=255) cacaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGaa > 2:1816320/1‑100 (MQ=255) cacaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGaa < 2:649492/100‑1 (MQ=255) cacaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTAGCCCGCATGGAACCCTAAACTCCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGaa < 1:103598/100‑1 (MQ=255) acaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAACACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt > 1:1157868/1‑100 (MQ=255) acaTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt > 1:224571/1‑100 (MQ=255) acaTCAGACAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt > 2:2005973/1‑100 (MQ=255) caTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATa > 1:1698644/1‑100 (MQ=255) aTCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATAc > 2:682987/1‑100 (MQ=255) aGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTc > 2:1854245/1‑100 (MQ=255) aGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTc > 2:1368738/1‑100 (MQ=255) ggCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccac < 2:3578967‑M2/100‑57 (MQ=255) ggCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCg > 1:1719978/1‑100 (MQ=255) ggCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCg < 2:1276835/100‑1 (MQ=255) gCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacc < 2:3500256‑M2/100‑58 (MQ=255) gCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacc < 1:1737424‑M2/100‑58 (MQ=255) cAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGAt < 1:477823/100‑1 (MQ=255) gttCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 2:466548/98‑1 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctg < 1:1243325‑M2/100‑60 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 2:2149017/100‑1 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 2:1360774/100‑1 (MQ=255) aaTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATc < 1:605860/100‑1 (MQ=255) aTCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATTGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATca < 1:2040522/100‑1 (MQ=255) tCCATGTCTTATGCAGCGTAATCGTTTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAATCTTATGCATTGTTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAAt < 1:1336767/89‑1 (MQ=255) ccATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATcaca < 1:1131957/100‑1 (MQ=255) aTGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATc > 2:83112/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGc > 1:3552451/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGc > 1:3329380/1‑100 (MQ=255) ccGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGcc > 1:2964302/1‑100 (MQ=255) ggATGCAGCGTAGACGCGTTATCCAGCATGGAAGCCTAAAAACCTGAAGCCATGGTACGCTGGATCTCGATGACTTCGAATACTTCGATCAAATCGCCAg < 1:382565/100‑1 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2:2513165/1‑100 (MQ=255) cccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCtt > 1:404772/1‑100 (MQ=255) ccGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTa > 2:3269440/1‑100 (MQ=255) gCATGGattggctgatgtgacgctgtcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagcccctttt > 1:2399505‑M2/1‑6 (MQ=255) gCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagcccctttt > 2:2613699‑M2/1‑6 (MQ=255) gCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttct > 2:2586423‑M2/1‑6 (MQ=255) gCATGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcagctcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagcccctttt > 1:2678052‑M2/1‑6 (MQ=255) gCATGGattgcctgatgtgacgctggagcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagcccctttt < 2:2324300‑M2/100‑95 (MQ=255) cATGGagtgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttt > 2:3293372‑M2/1‑5 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagcccctttttaa > 1:281438‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 2:2454952‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg > 1:3143067‑M2/1‑3 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGTAGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGcc > 2:3415814/1‑100 (MQ=255) tGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGcc < 2:1763257/100‑1 (MQ=255) ggattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttgt > 2:3336007‑M2/1‑2 (MQ=255) ggattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttgt < 1:674851‑M2/100‑99 (MQ=255) ggattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcacttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttg < 1:1305798‑M2/99‑98 (MQ=255) gattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctgttagcccctttttaaaa > 1:144353‑M2/1‑1 (MQ=255) gattgcctgatgtgacgctggcgcgtcttatcaggtcaacgtgaacagcccttccacctgaaattaattttaaaaaggggctaacagccccttttttgtc > 2:3698555‑M2/1‑1 (MQ=255) gAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGa < 2:3061991/100‑1 (MQ=255) | TTTCAGGTGGAAGGGCTGTTCACGTTGACCTGATAAGACGCGCCAGCGTCACATCAGGCAATCCATGCCGGATGCAGCGTAAACGCCTTATCCCGCATGGAACCCTAAAAACCTTAAGCAATGGTACGTTGGATCTCGATGATTTCGAATACTTCGATCACATCGCCAGTGCGGACGTCGTTGTAGTTCTTAACGCCGA > NC_000913/3313229‑3313427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |