| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2304400 = | NA (NA) | 25 (0.210) +AGCGGTGTAG |
8/158 | NT | 77.9% | intergenic (+7/+708) | eco/mqo | ecotin, a serine protease inhibitor/malate dehydrogenase, FAD/NAD(P)‑binding domain |
| ? | NC_000913 | 2304923 = | 8 (0.060) | noncoding (507/655 nt) | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | REP161 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 12 REP sequences | |||||
TGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAAC > NC_000913/2304824‑2305022 | gccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagg < 2:914630‑M2/1‑1 (MQ=255)gccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagg < 2:3326383‑M2/1‑1 (MQ=255)gccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagg > 2:3092521‑M2/100‑100 (MQ=255) ccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGc > 1:1788589‑M2/99‑100 (MQ=255) ccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGc > 2:2001235‑M2/99‑100 (MQ=255) ccagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGc < 2:315449‑M2/2‑1 (MQ=255) cagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacgggttgccgcacttcacagcggtgtagGcc < 2:2317209‑M2/3‑1 (MQ=255) cagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGcc < 2:1639530‑M2/3‑1 (MQ=255) cagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGcc < 2:1714286‑M2/3‑1 (MQ=255) cagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGcc < 2:3551487‑M2/3‑1 (MQ=255) cagcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGcc < 2:2210826‑M2/3‑1 (MQ=255) agcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCt < 2:2507729‑M2/4‑1 (MQ=255) agcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCt < 1:3530172‑M2/4‑1 (MQ=255) agcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCt > 2:922345‑M2/97‑100 (MQ=255) gcgtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTg < 2:824389‑M2/5‑1 (MQ=255) gtcgcatcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGAt < 2:78358‑M2/7‑1 (MQ=255) catcaggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagggatcataaga > 1:3531049‑M2/90‑90 (MQ=255) ggcaaccggctcgggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgagctacggggtgacgcacttcacagccgtatagGCCTGCtacgatgtg > 1:600669‑M2/85‑95 (MQ=255) gggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATc < 1:1366043‑M2/28‑1 (MQ=255) gggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATc < 2:2016458‑M2/28‑1 (MQ=255) ggcgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCa < 1:2583243‑M2/29‑1 (MQ=255) cgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgg < 2:671755‑M2/31‑1 (MQ=255) cgttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgg < 1:558859‑M2/31‑1 (MQ=255) cgttggatgtcggatgcggcgtccccgccttgtccgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgg < 1:3581909‑M2/31‑1 (MQ=255) gttggatgtgggatgcggcgtaaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgg < 1:3636286‑M2/31‑1 (MQ=255) gttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 1:1359223‑M2/32‑1 (MQ=255) gttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 1:3267712‑M2/32‑1 (MQ=255) gttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 2:240799‑M2/32‑1 (MQ=255) gttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 2:1749250‑M2/32‑1 (MQ=255) gttggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 2:2232193‑M2/32‑1 (MQ=255) gttggatgtcggatgcggcgtaaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 1:3346772‑M2/32‑1 (MQ=255) gttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCaggn < 1:883867‑M2/32‑2 (MQ=255) gttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 1:45324‑M2/32‑1 (MQ=255) gttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 1:71805‑M2/32‑1 (MQ=255) ggtggatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGc < 2:350784‑M2/32‑1 (MQ=255) ttgtatgtcggatgcggcgtaaccgccttatctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAgg < 1:3142204‑M2/31‑1 (MQ=255) ttggatgtcggatgcggcgtgaccggcttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGcc < 2:1053373‑M2/33‑1 (MQ=255) ttagatgtcggatgcggcgtaaccgccttatccgacctacggggtggagcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGcc < 2:2114523‑M2/33‑1 (MQ=255) gatgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGcc < 1:2608564‑M2/33‑1 (MQ=255) atgtcggatgcggcgtaaccgccttatccaacctacggggtggagcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTaca < 1:1464164‑M2/37‑1 (MQ=255) tgtcggatgcggcgtgaccgccttgtctgacctacggggtgccgcacttcacagcggtgtagGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTacac < 2:259154‑M2/38‑1 (MQ=255) aaGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCa < 2:1079442/100‑1 (MQ=11) aaGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCa < 2:2947250/100‑1 (MQ=11) aGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCaa > 2:3640985/1‑100 (MQ=31) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAAc < 2:3142221/99‑1 (MQ=32) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACa < 2:1974897/100‑1 (MQ=32) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACa < 1:24460/100‑1 (MQ=32) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACa < 2:2437450/100‑1 (MQ=32) ccGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACa < 2:3704111/100‑1 (MQ=32) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACAGCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGAATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATc > 1:3780380/1‑100 (MQ=12) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATc > 2:3348605/1‑100 (MQ=33) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATc > 2:1609267/1‑100 (MQ=33) ggTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATc > 2:1874117/1‑100 (MQ=33) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCt < 2:3024110/100‑1 (MQ=35) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCt > 2:2331420/1‑100 (MQ=35) gTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTCTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCt > 2:2603798/1‑100 (MQ=25) tGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTaa > 1:1652884/1‑100 (MQ=38) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAAc < 2:1374145/100‑1 (MQ=38) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAAc > 2:759329/1‑100 (MQ=38) gCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAAc < 2:1990306/100‑1 (MQ=38) | TGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTCGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCGACATCTAACGCCCAAGCCGGTTGCCTGATGCGACGCTGGCGCGTCTTATCAGGCCTACACCGCTGTGAAGTGCTCCACCCCGTAGGTTGGATAAGGCGGTTACGCCGCATCCAACATCTAAC > NC_000913/2304824‑2305022 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |