| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 481,225 | T→G | 18.5% | intergenic (‑517/+29) | tomB ← / ← acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 481,225 | 0 | T | G | 18.5% | 420.4 / 79.2 | 176 | intergenic (‑517/+29) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (68/75); new base G (19/14); total (87/89) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
GAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACC > NC_000913/481127‑481323 | gAATTTTATCCGTGGTTAATACTTGTTTTCGTATGATATCCTGAGTTTGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCtt < 1:3410342/100‑1 (MQ=255) aaTTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTa > 2:387750/1‑100 (MQ=255) aTTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAc < 2:48129/100‑1 (MQ=255) ttttATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAcg < 2:2473729/100‑1 (MQ=255) ttATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAcgcg < 1:2053536/100‑1 (MQ=255) ttATCAGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTCCAAGTACTCCTTAATGCTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAcgcg < 1:2810973/100‑1 (MQ=255) ccGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGcc < 2:2924837/99‑1 (MQ=255) cGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCtt < 2:3528510/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCtt < 1:2249829/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCtt > 1:1868812/1‑100 (MQ=255) cGTGGTTAATACTGGATTTCGTATGGGAGCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCtt < 1:687561/100‑1 (MQ=255) gTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCtt > 1:3696038/1‑99 (MQ=255) gTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttt < 1:1016569/100‑2 (MQ=255) gTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGAGCCTGAGTTGGTGGTTAAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGcc < 1:2641166/97‑1 (MQ=255) tGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAg < 2:84815/100‑1 (MQ=255) ggTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGt > 2:3690521/1‑100 (MQ=255) gTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGATTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTg < 2:313512/100‑1 (MQ=255) gTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGTTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttttt < 1:2073242/99‑4 (MQ=255) gTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGt < 1:3606751/99‑1 (MQ=255) ttAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCtttttta < 2:223734/100‑6 (MQ=255) tAATATTGGTTTTCGTATGAGATCTTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGAt < 1:872233/100‑1 (MQ=255) aaTACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGAtt < 1:1190156/100‑1 (MQ=255) aaTACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttttttatg < 2:101478/100‑8 (MQ=38) tACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTac > 1:1832556/1‑100 (MQ=255) tACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTac > 2:1521811/1‑100 (MQ=255) tACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTac < 1:2158575/100‑1 (MQ=255) tACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTac < 2:1731168/100‑1 (MQ=255) aCTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTaca < 1:1960042/100‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACCCGGCCTTAGTGATTacac > 1:3143173/1‑100 (MQ=255) tGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACg < 2:2317020/100‑1 (MQ=255) ttttCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCAGAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTg < 2:3279950/100‑1 (MQ=255) tttCGTATGAGATCCTGAGTTGGTTGTTCAATTACTCCCTATTGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGTCGCGTAAGCGGCCttttttat < 1:3466757/90‑7 (MQ=255) tttCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGt > 2:3383931/1‑100 (MQ=255) tttCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGt < 1:1714982/100‑1 (MQ=255) gTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCa > 1:1614136/1‑100 (MQ=255) gTATGAGATCCTGAGATGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGCTTACACGTTGTATCa > 1:3057143/1‑100 (MQ=255) tATGAGATCCTGAGTTGGTTGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGTTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCaa < 1:3139807/100‑1 (MQ=255) aTGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAat < 2:3041241/100‑1 (MQ=255) aTGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAat > 1:1614022/1‑100 (MQ=255) tGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGATCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAatg > 1:2035898/1‑100 (MQ=255) tCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATgatgat < 1:541466/100‑1 (MQ=255) cTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCg > 1:2977519/1‑100 (MQ=255) tggtggTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTa < 1:753975/100‑1 (MQ=255) tggtggTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTa < 1:1781639/100‑1 (MQ=255) ggtggtTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTAt > 2:3745740/1‑100 (MQ=255) ggtggtTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTAt > 2:1715644/1‑100 (MQ=255) ggtTCAATTACTCGTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCCCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACAGTGTATCAATGATGAACTACAGTATGGc > 1:2112685/1‑100 (MQ=255) ggtTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGc < 1:1242285/100‑1 (MQ=255) ggtTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGc > 1:2238855/1‑100 (MQ=255) ttCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCtg < 2:203443/100‑1 (MQ=255) cAATTACTCCTTAATGTTCGTAGTTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACACGGCCTTAGTGATTAAACGTTGTATCAATAATGAGCGACAGTATGGCtgtg > 1:1166308/1‑100 (MQ=255) aTTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCt > 2:1622545/1‑100 (MQ=255) aCTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGa < 1:3757504/100‑1 (MQ=255) tCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGata < 1:2782392/100‑1 (MQ=255) ccTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGatat > 2:964386/1‑100 (MQ=255) ccTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGatat > 1:2824269/1‑100 (MQ=255) ccTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTATGCTCGatat > 1:1216431/1‑100 (MQ=255) cTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATc > 1:1415604/1‑100 (MQ=255) tAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCtt < 1:341693/100‑1 (MQ=255) tAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCtt < 2:3533988/100‑1 (MQ=255) gTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCAtt > 2:2981538/1‑100 (MQ=255) gTTCGGAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACTCGGCCTGATTGTTTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCAt < 1:3612478/99‑1 (MQ=255) gcaGGTTATGCATTAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTg > 2:2591269/3‑100 (MQ=255) tAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGc > 1:2403328/1‑100 (MQ=255) aGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCg < 2:983564/100‑1 (MQ=255) aGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCg > 1:2298150/1‑100 (MQ=255) aGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCg < 1:3383911/100‑1 (MQ=255) gTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGc > 2:510631/1‑100 (MQ=255) tATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCt > 2:2815787/1‑99 (MQ=255) tATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTa < 1:3558668/100‑1 (MQ=255) cATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgc > 1:253681/1‑100 (MQ=255) cATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgc > 1:3253209/1‑100 (MQ=255) cATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgc > 1:247163/1‑100 (MQ=255) cATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgc > 1:3726219/1‑100 (MQ=255) aTAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcg > 1:2275069/1‑100 (MQ=255) tcactaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcgg > 1:1214683/6‑100 (MQ=255) tAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCCATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATCTCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcgg > 1:819315/1‑100 (MQ=255) tAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcgg > 2:3082294/1‑100 (MQ=255) tAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcgg > 2:3337197/1‑100 (MQ=255) cactaaGGCGGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGCCAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggc > 1:3604110/5‑100 (MQ=255) cactaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggc > 2:2180128/5‑100 (MQ=255) actaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg > 1:2314175/4‑100 (MQ=255) actaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg > 1:657903/4‑100 (MQ=255) aaaaaGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg < 2:115260/100‑1 (MQ=255) aaaaaGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg > 1:115258/1‑100 (MQ=255) aaaaaGGCCGCTTACGCGGACTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTATGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg > 1:874288/1‑100 (MQ=255) ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcgg > 1:2478875/3‑100 (MQ=255) ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcgg > 2:2316995/3‑100 (MQ=255) ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcgg > 1:2387621/3‑100 (MQ=255) ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcgg > 1:2146105/3‑100 (MQ=255) ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGATGTCTCAATGATGATCGACAGTCTGGCTGTGCTCGATATATTCATTCTTGCCGCTAAAgc > 1:3343145/3‑95 (MQ=255) aaaaGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcgg < 1:498860/100‑1 (MQ=255) taaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggaag > 1:199950/2‑96 (MQ=255) aaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcggcg > 1:3793372/1‑100 (MQ=255) aaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcggc > 1:423246/1‑99 (MQ=255) ggCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGaa > 1:1919240/1‑100 (MQ=255) ggCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGaa < 2:1565617/100‑1 (MQ=255) gCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAaccac < 1:1351069/100‑1 (MQ=255) gCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAaccac > 2:1496575/1‑100 (MQ=255) cTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAaccacc < 1:950995/100‑1 (MQ=255) | GAATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACC > NC_000913/481127‑481323 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |