| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 481,228 | C→A | 18.5% | intergenic (‑520/+26) | tomB ← / ← acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 481,228 | 0 | C | A | 18.5% | 453.7 / 72.8 | 175 | intergenic (‑520/+26) | tomB/acrB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein/multidrug efflux system protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (69/73); new base A (19/14); total (88/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 180 total aligned reads displayed.
ATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACA > NC_000913/481129‑481326 | aTTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAc < 2:48129/100‑1 (MQ=255) ttATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAcgcg > 1:3730392/1‑100 (MQ=255) ttATCAGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTCCAAGTACTCCTTAATGCTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTAcgcg < 1:2810973/100‑1 (MQ=255) cGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCtt > 2:336048/1‑100 (MQ=255) gTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCtt > 1:3696038/1‑99 (MQ=255) gTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttt < 1:1016569/100‑2 (MQ=255) tGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAg < 2:84815/100‑1 (MQ=255) ggggaataatGGTTTTCTTATGAGATCATGAATAAGAGGTTAAATTACTCCTTTTTGTTCGAAAAAAAAAAAAAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAg < 1:2628417/95‑1 (MQ=255) ggTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttttt < 2:354868/100‑4 (MQ=255) gTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGATTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTg < 2:313512/100‑1 (MQ=255) gTTAATACTGGTATTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTg > 2:2505339/1‑100 (MQ=255) gTTAATACTAGTTTTCGTATGAGTTCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGTTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCtttttt < 1:3709502/100‑5 (MQ=255) ttAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCtttttta < 2:223734/100‑6 (MQ=255) tAATATTGGTTTTCGTATGAGATCTTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGAt < 1:872233/100‑1 (MQ=255) aaTACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGAtt < 1:1190156/100‑1 (MQ=255) aaTACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttttttatg < 2:101478/100‑8 (MQ=38) aaTACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttttttatg < 2:2234409/100‑8 (MQ=38) aaTACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttttttatg < 1:2189853/100‑8 (MQ=38) tACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTac > 2:1521811/1‑100 (MQ=255) tACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTac < 2:1731168/100‑1 (MQ=255) tACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTac > 1:1832556/1‑100 (MQ=255) tACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCGTAAGCGGCCttttttatgca < 1:2257359/100‑10 (MQ=38) aCTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTaca < 1:1960042/100‑1 (MQ=255) cTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACCCGGCCTTAGTGATTacac > 1:3143173/1‑100 (MQ=255) tGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACg < 1:301118/100‑1 (MQ=255) ggTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGt < 1:424176/100‑1 (MQ=255) ggTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGt < 1:1940396/100‑1 (MQ=255) tttCGTATGAGATCCTGAGTTGGTTGTTCAATTACTCCCTATTGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGTCGCGTAAGCGGCCttttttat < 1:3466757/90‑7 (MQ=255) tttCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGt < 1:1714982/100‑1 (MQ=255) tttCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGt > 2:341698/1‑100 (MQ=255) tttCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGt < 2:1611819/100‑1 (MQ=255) cGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATc < 2:2178181/100‑1 (MQ=255) gTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATc > 1:3347430/1‑99 (MQ=255) tATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCaa > 1:3259126/1‑100 (MQ=255) aTGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAat > 1:1614022/1‑100 (MQ=255) tGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGATCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAatg > 1:2035898/1‑100 (MQ=255) gagaTCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTAGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAatga < 1:2069418/100‑1 (MQ=255) agaTCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAatgat > 1:2732739/1‑100 (MQ=255) tCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATgatgat < 1:541466/100‑1 (MQ=255) ccTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATc < 2:3001628/100‑1 (MQ=255) ccTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATc > 1:2410169/1‑100 (MQ=255) cTGTGTTGGTAGTTCAATTAGTCCTTACTGTTCGTGGGTAATGCTTAAAAATGGCCGCTTGCGCGGGCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATgatgattg < 1:2242775/100‑3 (MQ=255) cTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCAGAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCg > 2:1178525/1‑100 (MQ=255) aGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACa < 2:2410181/100‑1 (MQ=255) tggtggTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTa < 1:1781639/100‑1 (MQ=255) gtggtTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATg > 2:3069172/1‑100 (MQ=255) ggtTCAATTACTCGTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCCCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACAGTGTATCAATGATGAACTACAGTATGGc > 1:2112685/1‑100 (MQ=255) ggtTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCCTAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGc < 1:3237273/100‑1 (MQ=255) ggtTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGc < 1:1242285/100‑1 (MQ=255) ggtTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGc < 2:3780538/100‑1 (MQ=255) ttCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCtg < 2:203443/100‑1 (MQ=255) tCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCtgt < 1:2098582/100‑1 (MQ=255) cAATTACTCCTTAATGTTCGTAGTTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACACGGCCTTAGTGATTAAACGTTGTATCAATAATGAGCGACAGTATGGCtgtg > 1:1166308/1‑100 (MQ=255) cAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCtgt > 2:3306610/1‑99 (MQ=255) tACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCg > 2:58311/1‑100 (MQ=255) cTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGat < 2:3127826/100‑1 (MQ=255) tCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGata < 1:2782392/100‑1 (MQ=255) tCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATAGACAGTATGGCTGTGCGCGata < 1:3581777/100‑1 (MQ=255) ccTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGatat > 2:964386/1‑100 (MQ=255) ccTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGatat > 1:2392863/1‑100 (MQ=255) ccTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGata > 1:1216558/1‑99 (MQ=255) cTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATc > 1:1415604/1‑100 (MQ=255) tAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCtt < 2:3533988/100‑1 (MQ=255) tAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCtt < 1:341693/100‑1 (MQ=255) aaTGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTc > 1:3482539/1‑100 (MQ=255) gTTCGGAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACTCGGCCTGATTGTTTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCAt < 1:3612478/99‑1 (MQ=255) aGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCg < 2:983564/100‑1 (MQ=255) aGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCg < 2:3730416/100‑1 (MQ=255) aGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCg > 1:2298150/1‑100 (MQ=255) gTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGc < 1:1676791/100‑1 (MQ=255) tATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCt > 2:2815787/1‑99 (MQ=255) cATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgc > 1:247163/1‑100 (MQ=255) cATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgc > 2:2696458/1‑100 (MQ=255) aatccctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGAGGATCGACAGTATGGGTGTGCAGGATATATTGATTCTTGCGGATa > 1:890440/8‑96 (MQ=255) aTAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcg > 1:2275069/1‑100 (MQ=255) tcactaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcgg > 1:1214683/6‑100 (MQ=255) tAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCCATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATCTCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcgg > 1:819315/1‑100 (MQ=255) aaaaaaGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggc > 2:1687579/1‑100 (MQ=255) actaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg > 1:750474/4‑100 (MQ=255) actaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg > 1:657903/4‑100 (MQ=255) actaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg > 1:2933309/4‑100 (MQ=255) aaaaaGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcg > 1:115258/1‑100 (MQ=255) ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcgg > 1:2146105/3‑100 (MQ=255) ctaaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcgg > 2:2316995/3‑100 (MQ=255) aaaaGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcgg < 1:498860/100‑1 (MQ=255) taaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggaag > 1:199950/2‑96 (MQ=255) aaaGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcggc < 2:2948173/100‑1 (MQ=255) aaGGCCGCGTAAGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAgcggcggcg > 1:3793372/1‑100 (MQ=255) aaGGCCGCGTAAGCGGCCTAAGCGATTACACGTTGTATCAATGATCAGCCACAGTACGCCTGTGCGCGATATCTTCATTCATGCTGCTAAAg > 1:3605207/1‑92 (MQ=255) aGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGa < 1:3108069/100‑1 (MQ=255) ggCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGaa < 2:1565617/100‑1 (MQ=255) gCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAac < 1:1914924/100‑1 (MQ=255) ccGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAacc > 2:1133003/1‑100 (MQ=255) cccTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGGTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTATAGCGGCGGCGAac < 1:2359335/96‑1 (MQ=255) cGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAacca < 1:806823/100‑1 (MQ=255) gCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTGATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAaccac < 1:2505327/100‑1 (MQ=255) gCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAaccac < 1:1351069/100‑1 (MQ=255) tACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACcaccac > 1:968207/1‑100 (MQ=255) tACGCGGCCTTAGGGATTACACGTTGTATCACTGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCGAAAGCGGCGGCGAACcaccac > 1:421492/1‑100 (MQ=255) aCGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACcaca < 2:630863/100‑1 (MQ=255) | ATTTTATCCGTGGTTAATACTGGTTTTCGTATGAGATCCTGAGTTGGTGGTTCAATTACTCCTTAATGTTCGTAGGTTATGCATAAAAAAGGCCGCTTACGCGGCCTTAGTGATTACACGTTGTATCAATGATGATCGACAGTATGGCTGTGCTCGATATCTTCATTCTTGCGGCTAAAGCGGCGGCGAACCACCACA > NC_000913/481129‑481326 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |