| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 721,011 | T→A | 15.7% | intergenic (+171/+45) | ybfK → / ← kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 721,011 | 0 | T | A | 15.7% | 362.2 / 53.5 | 139 | intergenic (+171/+45) | ybfK/kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/72); new base A (10/12); total (55/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.36e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.64e-01 | |||||||||||
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGC > NC_000913/720912‑721108 | cAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat > 1:3688690/1‑100 (MQ=255)cAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat < 2:150535/100‑1 (MQ=255)cAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat < 2:2801879/100‑1 (MQ=255) tCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTAc < 2:2056249/100‑1 (MQ=255) cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACg < 2:1151129/100‑1 (MQ=255) cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACg < 1:3815168/100‑1 (MQ=255) atttatttAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt < 2:2718972/100‑1 (MQ=255) atttatttAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt < 1:175456/100‑1 (MQ=255) tttatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCttt < 1:1050899/100‑1 (MQ=38) ttatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttt < 2:1972432/100‑2 (MQ=38) tatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaa < 2:1679223/100‑1 (MQ=255) atttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTAGTTTAAGATATAAAGCCGTATTTATTATTATGGCTtta > 1:2980570/1‑98 (MQ=255) tttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttat < 2:540267/100‑5 (MQ=37) ttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaatta < 2:1185407/100‑1 (MQ=255) taATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTttaattaa > 1:3155778/1‑100 (MQ=255) taATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatct < 2:2771065/100‑7 (MQ=37) taATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatct < 2:3590021/100‑7 (MQ=37) attgatgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTtaattaat < 2:90108/98‑1 (MQ=255) aaTGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTtaattaat < 2:3342864/100‑1 (MQ=255) aaTGAGGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAAAATGGAATTGTTATTTTTGTGTGTGGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatctt < 1:3245187/100‑8 (MQ=21) atgatgAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata < 2:3197637/100‑1 (MQ=255) atgatgAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata > 1:2546662/1‑100 (MQ=255) atgatgAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata < 1:1728791/100‑1 (MQ=255) atgatgAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata < 2:2546674/100‑1 (MQ=255) atgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaaa > 1:2581732/1‑100 (MQ=255) tgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTCTTATTACGGCTTTAATTAATaaaa > 1:3754029/1‑99 (MQ=255) tgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaatagatc > 1:1297859/1‑96 (MQ=255) gCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggca < 2:2460327/100‑1 (MQ=255) cTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcag > 2:290545/1‑100 (MQ=255) cTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTa < 2:1119096/99‑1 (MQ=255) cTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTAt > 1:2232432/1‑100 (MQ=255) cTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTAt < 1:738800/100‑1 (MQ=255) tCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTAtt > 2:1245996/1‑100 (MQ=255) cAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTa > 2:2446576/1‑100 (MQ=255) cAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTa > 2:2446920/1‑100 (MQ=255) cAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTa > 2:1309675/1‑100 (MQ=255) tAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTaaaa < 2:1080694/100‑1 (MQ=255) tAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTaaaa < 1:979386/100‑1 (MQ=255) aaTATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTa < 1:152874/96‑1 (MQ=255) atatAAAATATTGAATTGTTATTTTTTTGTTTTGTTTAAAATAAAAAGCTGTATTTATTATTACGCCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAAt < 1:1563410/99‑1 (MQ=255) atatAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAAtt < 2:1026794/100‑1 (MQ=255) atatAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAAtt > 2:1551012/1‑100 (MQ=255) atatAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGCTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAATGAAATAATGTATTaaaact > 1:3171001/1‑98 (MQ=255) gccaacatatTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAACAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTa < 1:2447824/94‑1 (MQ=255) cttccgatctGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTaa < 2:2054091/91‑1 (MQ=255) ataAAATATTGACTTCTTATTTTTGTGTGTTGTTTAACATACAAAGCCGTATTTATTATTACGGTTTTAATTAATAAAAGTGAGGCTGTATTAAAATTaa > 1:1318935/1‑100 (MQ=255) taAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAat < 2:1669943/100‑1 (MQ=255) taAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAat < 2:2626091/100‑1 (MQ=255) aaaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGTCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata < 1:296554/100‑1 (MQ=255) aaaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata > 2:1339915/1‑100 (MQ=255) aaaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata > 1:831636/1‑100 (MQ=255) aaaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata > 1:3246181/1‑100 (MQ=255) aaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATAtt > 1:1070043/1‑100 (MQ=255) tatTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCa < 1:2100905/100‑1 (MQ=255) ttGAATTGTTATTTTTTTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTATGTTTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCaaa > 1:199747/1‑100 (MQ=255) tGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg < 2:2835220/100‑1 (MQ=255) tGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg < 2:2062985/100‑1 (MQ=255) aatttctATTTTTGTTTATTGTTAAAGATAAAAAGCCGAATTTACTATTACGACTTTAATTAATAAAAGGCAGTCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg < 1:2939660/92‑1 (MQ=255) aaTTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGc < 1:2794293/99‑1 (MQ=255) ttGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCAt > 1:921035/1‑99 (MQ=255) aTTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCg < 2:436590/100‑1 (MQ=255) ttttttTGTGTTGTTTAAAATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAcc < 1:2366110/98‑1 (MQ=255) tttttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGa < 2:3804109/100‑1 (MQ=255) tttttGAGTGTTGGTTAAGATAAAAAGGCGTATTTATTATTACGGCTTGAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAACGa < 1:1850343/100‑1 (MQ=255) tttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGAtn < 2:1898860/100‑2 (MQ=255) gtgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAg < 1:2397361/98‑1 (MQ=255) gtgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc < 2:3814963/100‑1 (MQ=255) gtgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc < 1:85930/100‑1 (MQ=255) gtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa > 1:503401/1‑100 (MQ=255) tgttgtTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAAt < 1:210895/100‑1 (MQ=255) ttgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATAc < 2:2221638/100‑1 (MQ=255) gttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCg > 1:3778573/1‑100 (MQ=255) tttattaattaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg > 2:703858/11‑100 (MQ=25) tttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg > 1:2237979/1‑100 (MQ=255) ttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGt > 2:221269/1‑100 (MQ=255) aaGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGttt > 1:3015393/1‑100 (MQ=255) aaGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGttt > 2:2754069/1‑100 (MQ=255) aaGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGttt > 2:512413/1‑100 (MQ=255) aGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTc < 2:1823829/100‑1 (MQ=255) gATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCTAATATCGGTTTCa > 1:3471942/1‑100 (MQ=255) gATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCa > 2:2303013/1‑100 (MQ=255) gATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCa < 1:1245989/100‑1 (MQ=255) aattaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCa > 1:1472886/5‑99 (MQ=37) aTAAAAAGCCGTATTTATTATTCCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTTAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg < 2:921042/100‑1 (MQ=255) tAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGt > 2:3385213/1‑100 (MQ=255) tAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGt < 2:1426109/100‑1 (MQ=255) attaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGt > 2:3101077/4‑100 (MQ=37) taaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTaa > 1:165849/2‑100 (MQ=37) aaaaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTaa < 1:2861600/100‑1 (MQ=255) aaaaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTaa > 2:1458491/1‑100 (MQ=255) aaaaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTaa < 2:1289358/100‑1 (MQ=255) aaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGAATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAAt > 1:1186892/1‑100 (MQ=37) aaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATg < 2:3733476/100‑1 (MQ=255) aaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGACTGTATAAAAATTAATATTCAAAACATAAAACCATAACCAATAACGGTTTCAGCAATg > 1:1315174/1‑100 (MQ=255) gCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGaa < 2:2258819/100‑1 (MQ=255) cGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAAt < 1:3584641/100‑1 (MQ=255) gTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATg < 1:259925/100‑1 (MQ=255) tttattATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTAAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCg > 1:437336/1‑100 (MQ=255) ttattattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATGCCGGTTTCAGTAACGAAATAGc > 1:3114054/1‑98 (MQ=255) attattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTgg < 1:3486777/100‑1 (MQ=255) | CAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGC > NC_000913/720912‑721108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |