| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 850,996 | C→A | 16.9% | intergenic (+31/+18) | ompX → / ← opgE | outer membrane protein X/OPG biosynthetic transmembrane phosphoethanolamine transferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 850,996 | 0 | C | A | 16.9% | 404.0 / 64.1 | 152 | intergenic (+31/+18) | ompX/opgE | outer membrane protein X/OPG biosynthetic transmembrane phosphoethanolamine transferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (67/59); new base A (9/17); total (76/76) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.31e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.91e-01 | |||||||||||
Only 100 of 160 total aligned reads displayed.
TACGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCG > NC_000913/850897‑851093 | tACGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCtctc > 2:1664312/1‑100 (MQ=255)tACGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCtctc > 1:926629/1‑100 (MQ=255) aGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCgggg > 1:204603/1‑100 (MQ=255) cAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCg < 2:2247556/100‑1 (MQ=255) gCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGAtt < 2:2981124/100‑1 (MQ=255) catATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCTCTTTGGTGATATAAAAAGACCGCCCCTAGAGGCGGAtttt < 1:1193730/98‑1 (MQ=255) cGTATTCGTAGTGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttt < 1:478691/100‑1 (MQ=38) cGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttt < 2:3597255/100‑1 (MQ=38) gTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttt < 2:1710451/99‑1 (MQ=38) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTg < 2:2183950/100‑1 (MQ=255) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTg < 2:1319071/100‑1 (MQ=255) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTg < 2:2176079/100‑1 (MQ=255) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttt < 1:1917009/100‑2 (MQ=38) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttt < 1:3165290/100‑2 (MQ=38) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttt < 1:2636931/100‑2 (MQ=38) tATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttt < 2:1238639/100‑2 (MQ=38) aTTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttta < 2:3552258/100‑3 (MQ=38) ttCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGtt > 2:2389786/1‑100 (MQ=255) ttCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAtttttta < 1:826632/99‑3 (MQ=38) tCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttata < 1:1986454/100‑5 (MQ=37) tCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttata < 2:52879/100‑5 (MQ=37) gTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGttttt > 1:2788273/1‑100 (MQ=255) gTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGttttt > 1:369443/1‑100 (MQ=255) aGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCTGTGTTGGTTGCCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttatatc < 1:1943063/98‑7 (MQ=25) gCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAg > 2:739387/1‑100 (MQ=255) gCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCCCGAGAGGCGGAttttttatatcacc < 2:2381265/100‑10 (MQ=25) cGTTGGCGGAGGCACCTGGATTGCCGTTGGTGGTTGCCTCTTCTATTCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAg < 2:159186/99‑1 (MQ=255) aCGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCg < 2:1127161/100‑1 (MQ=255) cGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCgg > 2:538379/1‑100 (MQ=255) aGGCACCTGGATTGCCGGGGTTGGTTACCGCTTCTAATCGCATTGGTAATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTGTAAgat > 1:3154/1‑90 (MQ=255) ggCACCTGGGTTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCg < 1:1000607/100‑1 (MQ=255) ggCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCg > 1:3364660/1‑100 (MQ=255) ggCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCg < 2:1736161/100‑1 (MQ=255) gCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGa > 2:3520300/1‑100 (MQ=255) gCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTAGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGCTTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGa > 2:133552/1‑100 (MQ=255) cACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCGGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGaa > 1:1442149/1‑100 (MQ=255) aCCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGACATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGaaa < 2:662515/100‑1 (MQ=255) cTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAat < 2:3274134/100‑1 (MQ=255) ggATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAata < 1:1189972/99‑1 (MQ=255) gATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTTATATAAAAAATCCGCCTCTCGGAGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATc < 1:960822/100‑1 (MQ=255) aTTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCg > 2:3815230/1‑100 (MQ=255) ttGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCgg < 2:1574395/100‑1 (MQ=255) ttGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCgg < 2:441665/100‑1 (MQ=255) gCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGtt > 2:3648105/1‑100 (MQ=255) ggTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCg < 1:1725941/100‑1 (MQ=255) ggTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCg < 1:2153449/100‑1 (MQ=255) gtgtTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCga < 2:3325697/100‑1 (MQ=255) gtTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCATCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTGAGGTTTCGGGTGGCAAATATCGGTTc > 1:3759823/1‑95 (MQ=255) gtTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCAGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCgaga > 1:727682/1‑100 (MQ=255) ttGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGAt < 1:3496242/100‑1 (MQ=255) ttGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCAGAGAt > 1:360613/1‑100 (MQ=255) gTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGt < 1:3499293/100‑1 (MQ=255) ttACCGCTTCTAATCATTTTGTTGATATAAAAAATCCGACTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGtt < 1:3651950/100‑1 (MQ=255) tACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTg < 2:3261478/100‑1 (MQ=255) ccGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTa > 1:1749342/1‑100 (MQ=255) cGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAACATATCGGTTCCGAGATGGTTGTaa > 1:553400/1‑100 (MQ=255) gCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAAt < 2:391016/100‑1 (MQ=255) cTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCAc > 2:234322/1‑100 (MQ=255) tAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCAcc > 2:140602/1‑100 (MQ=255) aTCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCtt > 2:2448677/1‑100 (MQ=255) tCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTc > 2:1163468/1‑100 (MQ=255) cACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCt > 1:67859/1‑100 (MQ=255) cTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTTAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGt < 1:515570/100‑1 (MQ=255) cTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGt > 1:280545/1‑100 (MQ=255) tttGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTa < 2:3013380/100‑1 (MQ=255) tGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAAc > 2:2042047/1‑100 (MQ=255) tGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAAc < 1:1620217/100‑1 (MQ=255) gTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTg < 2:1669719/100‑1 (MQ=255) gTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTg < 1:327985/100‑1 (MQ=255) gTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTg < 1:2136872/100‑1 (MQ=255) tGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAGGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTgg < 1:3781259/100‑1 (MQ=255) tGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTgg > 2:1532715/1‑100 (MQ=255) gATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGa < 1:2469754/100‑1 (MQ=255) aaaacaaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGaa > 2:128125/6‑100 (MQ=37) aaaacaaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGaa > 1:3395961/6‑100 (MQ=37) tataAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAg < 2:3207665/100‑1 (MQ=255) tataAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAg > 1:2170325/1‑100 (MQ=255) ataAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGt > 2:2968345/1‑100 (MQ=255) aacaaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGt > 1:2882733/4‑100 (MQ=37) taAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGt > 1:1041679/1‑99 (MQ=255) acaaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTACTCCACCTTCTGTAACTGGAAGtt > 1:3041362/3‑100 (MQ=37) acaaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGtt > 2:1826005/3‑100 (MQ=38) caaaaaTCCGCCCCGAGAGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTg > 2:3025277/2‑100 (MQ=38) aaaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTgg > 1:1572220/1‑94 (MQ=255) aaaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTg > 2:671827/1‑100 (MQ=255) aaaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCAGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAg > 1:3028457/1‑97 (MQ=255) aaaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTATTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGCTTCCTAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTg > 2:2672225/1‑100 (MQ=255) aaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTgg < 2:1181510/100‑1 (MQ=255) aaaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTgg < 2:1058382/100‑1 (MQ=255) aaaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGt < 2:3732336/100‑1 (MQ=255) aaaTCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTg < 2:3630718/100‑1 (MQ=255) ccGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGt < 1:1290555/100‑1 (MQ=255) cGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGTTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGta < 2:3069356/100‑1 (MQ=255) cGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGta < 1:1214634/100‑1 (MQ=255) cGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGta > 1:2166052/1‑100 (MQ=255) gCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGtat > 2:1646304/1‑100 (MQ=255) ccTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGtata < 2:3779550/100‑1 (MQ=255) ctctCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTatat < 2:198753/100‑1 (MQ=255) tctcGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTatat > 1:1386611/1‑99 (MQ=255) ctcGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCg > 2:3234697/1‑100 (MQ=255) | TACGAGCAGAGCCGTATTCGTAGCGTTGACGTAGGCACCTGGATTGCCGGTGTTGGTTACCGCTTCTAATCACTTTGGTGATATAAAAAATCCGCCTCTCGGGGCGGATTTTTGTTTTTAAGGTTTCGGGTCGAAAATATCGGTTCCGAGATGGTTGTAATCCACCTTCTGTAACTGGAAGTTGGTGATGTATATCG > NC_000913/850897‑851093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |