| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,298,284 | T→A | 16.0% | intergenic (‑163/‑314) | adhE ← / → ychE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase/iron‑dependent alcohol dehydrogenase/pyruvate‑formate lyase deactivase/UPF0056 family inner membrane protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,298,284 | 0 | T | A | 16.0% | 316.9 / 51.5 | 125 | intergenic (‑163/‑314) | adhE/ychE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase/iron‑dependent alcohol dehydrogenase/pyruvate‑formate lyase deactivase/UPF0056 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (53/52); new base A (10/10); total (63/62) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.33e-01 | |||||||||||
Only 100 of 136 total aligned reads displayed.
AGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCA > NC_000913/1298186‑1298383 | aGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTAtc > 2:64449/1‑100 (MQ=255)aGTGCAGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTAtc > 2:603072/1‑100 (MQ=255) tGCAGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAAACAAAAACTTACTCGGACTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTAtctc < 1:368172/100‑1 (MQ=255) gCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTAtctc < 1:2427368/99‑1 (MQ=255) gCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATctct < 2:1149965/100‑1 (MQ=255) gCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATctct < 2:1711843/100‑1 (MQ=255) cGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTa < 2:691389/100‑1 (MQ=255) ggTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTaa > 2:2757071/1‑100 (MQ=255) gTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAAt > 1:1327354/1‑100 (MQ=255) gTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAAt < 1:1441277/100‑1 (MQ=255) gTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAAt > 1:2187337/1‑100 (MQ=255) tgatgaTTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATg > 2:3193268/1‑100 (MQ=255) gatgatTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGc > 1:3056424/1‑100 (MQ=255) atgatTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGATAATAACTCTAATgtt < 2:3563802/100‑3 (MQ=255) atgatTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGATAATAACTCTAATgtt < 2:1657092/100‑3 (MQ=255) gatTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGt > 1:2252526/1‑99 (MQ=255) gatTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGATAATAACTCTAATgttta < 2:1775262/100‑5 (MQ=38) gatTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGATCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGATAATAACTCTAATgttta < 1:3620263/100‑5 (MQ=38) atTTGCTTACCCTATGAAGTTCAAATGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAGAGAGTTTAAACATTATAGATAGGAACTCTAATgtttaa < 1:357233/100‑6 (MQ=255) atTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCa > 1:2940673/1‑100 (MQ=255) tttGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCAc < 2:300696/100‑1 (MQ=255) ttGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGATAATAACTCTAATgtttaaac < 2:1836673/100‑8 (MQ=37) ttGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGATAATAACTCTAATgtttaaac < 1:1676709/100‑8 (MQ=38) ttGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGATAATAACTCTAATgtttaaac < 2:1359079/100‑8 (MQ=38) tGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGATAATAACTCTAATgtttaaact < 2:2158454/100‑9 (MQ=37) gCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTc > 1:1548292/1‑100 (MQ=255) ttAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCa < 1:1187194/100‑1 (MQ=255) tAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTAACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAg > 2:3623163/1‑100 (MQ=255) ccTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTg > 2:1092095/1‑100 (MQ=255) cTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTgg < 1:2729050/100‑1 (MQ=255) aTGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCg < 2:595584/100‑1 (MQ=255) tGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGt > 2:2147904/1‑100 (MQ=255) tGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGt > 1:1611661/1‑100 (MQ=255) gAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTa < 2:3454085/100‑1 (MQ=255) aaaaTCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTaa < 1:2082783/100‑1 (MQ=255) aaaaTCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTaa > 1:3402751/1‑100 (MQ=255) aaaTCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTCAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGACGTacg > 1:1778545/1‑98 (MQ=255) aaaTCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAg < 1:3717370/100‑1 (MQ=255) aaaTCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAg < 2:2429695/100‑1 (MQ=255) aaTCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGc > 2:2216258/1‑100 (MQ=255) tCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCaa > 2:2663320/1‑100 (MQ=255) aaaaGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGGCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAg > 1:724802/1‑99 (MQ=255) cTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACt < 2:3436425/100‑1 (MQ=255) ttACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTc < 1:3299011/100‑1 (MQ=255) ttACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTc < 1:2249178/100‑1 (MQ=255) ttACTCGCGCTCAAACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTc < 1:2461902/100‑1 (MQ=255) tACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACGTTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCa < 1:437288/100‑1 (MQ=255) aCTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCAc < 2:276702/100‑1 (MQ=255) cgcgCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTc > 1:3132741/1‑100 (MQ=255) cgcgCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTc > 1:2901883/1‑100 (MQ=255) cgcgCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTACAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTc > 1:212417/1‑100 (MQ=255) cgcTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTg < 2:1139517/100‑1 (MQ=255) cgcTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTg > 1:344725/1‑100 (MQ=255) cactcactGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACt < 1:64447/100‑1 (MQ=255) ctcactGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGa > 1:1194332/1‑100 (MQ=255) ctcactGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGa > 1:18640/1‑100 (MQ=255) actGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTa < 1:2817982/100‑1 (MQ=255) ctGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTAc < 2:3666011/100‑1 (MQ=255) gtgATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATACGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGAAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACg > 1:2456055/1‑99 (MQ=255) ttACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATcc < 1:256127/100‑1 (MQ=255) tACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCca < 2:3559544/100‑1 (MQ=255) aCTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCcaa < 1:1067987/100‑1 (MQ=255) cTAAAAGGGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCcaaa > 2:1248217/1‑100 (MQ=255) cTAAAAGAGTTTAAACATTAGACTTATCATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGAGTAAGTGATCcaaa > 1:2555200/1‑100 (MQ=255) tAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCcaaat < 2:3341351/100‑1 (MQ=255) tAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCcaaat > 2:2463799/1‑100 (MQ=255) aaaaGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCcaaatc < 2:1980271/100‑1 (MQ=255) ggaagtgacgcATTAGAGATAATAACTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCcaaatcaaa > 2:600875/11‑100 (MQ=37) gTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAAttt > 1:1035626/1‑100 (MQ=255) tttAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAATATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATTAAAttt > 1:941151/1‑99 (MQ=255) ttAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAAttttt < 2:775115/100‑1 (MQ=255) ttAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAAttttt < 2:1194339/100‑1 (MQ=255) tAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTCCTGATTACGTGATCCAAATCAAAttttt > 2:1005056/1‑99 (MQ=255) tAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAAttttt < 2:3599512/99‑1 (MQ=255) tAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTg < 2:795981/100‑1 (MQ=255) tAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTg < 2:3690951/100‑1 (MQ=255) tAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTg < 1:805582/100‑1 (MQ=255) gacgcATTAGAGATAATAACTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTg > 2:3113661/5‑100 (MQ=38) gacgcATTAGAGATAATAACTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTg > 1:687604/5‑100 (MQ=38) gacgcATTAGAGATAATAACTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTg > 1:1395974/5‑100 (MQ=38) acgcATTAGAGATAATAACTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGc > 1:3442548/4‑100 (MQ=38) aaaCATTAGAGTTATTATCTCTAACGCGTCAATTACAGGTGGCGAAAGCAAGATTACTCACTTCTGTGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGc < 1:397957/100‑1 (MQ=255) cgcATTAGAGATAATAACTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCa > 2:2392156/3‑100 (MQ=255) cgcATTAGAGATAATAACTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCa > 2:71588/3‑100 (MQ=255) aaCATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCa < 1:1991071/100‑1 (MQ=255) aaCATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACATCTGGGCACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCa > 1:2676872/1‑100 (MQ=255) cATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCaaa < 2:1742459/100‑1 (MQ=255) cATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCaaa > 2:3742314/1‑100 (MQ=255) cATTAGAGATAATAACTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCaaa > 2:2856669/1‑100 (MQ=255) ttAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGc < 2:1790922/100‑1 (MQ=255) ttAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGc < 1:1006383/100‑1 (MQ=255) agagTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTg > 2:2442274/1‑100 (MQ=255) gagTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGa > 2:2553152/1‑100 (MQ=255) gTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGaca > 1:682439/1‑100 (MQ=255) attatCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCt > 2:571655/1‑100 (MQ=255) attatCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCt > 2:379787/1‑100 (MQ=255) tatCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCttt > 2:3611772/1‑100 (MQ=255) atCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTc > 1:3429891/1‑100 (MQ=255) atCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTc > 2:1690143/1‑100 (MQ=255) tctcTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGCGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCa < 1:2042239/100‑1 (MQ=255) | AGTGCGGTGATGATTTGCTTAACCTATGAAAATCAAAAGCTTACTCGCGCTCACACTCACTGTGATTTACTAAAAGAGTTTAAACATTAGAGTTATTATCTCTAATGCGTCACTTCCAGGTGGCGTAAGCAAGATTACTCACTTCTGGGTACTGATTACGTGATCCAAATCAAATTTTTGCAAAGCTGACACCTTTCA > NC_000913/1298186‑1298383 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |