| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 228022 | NA (NA) | 26 (0.200) | 9/164 | NT | NA | noncoding (2264/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | = 228033 | NA (NA) | noncoding (2275/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/227917‑228022‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctcctccGTTACTCTTTAGGAGGAGACCGCCCCAGTCAAACTACCCACCAGACACTGTCCGCAACCCGGATTACGGGTCAACGTTAGAACATCAAACATTAAAGGG < NC_000913/228033‑227935 GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 1:1412082/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 1:1412541/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC > 2:3733479/1‑100GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:954692/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:889147/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:2316885/100‑1GCCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGCAGTTTGACTGGGGCGGTC < 1:397344/100‑1 CCGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCTGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCT < 2:314698/100‑1 CGACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTC > 1:1061500/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:1912581/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:3030406/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC > 1:3774088/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:3839210/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 2:3810183/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC > 1:567085/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC > 2:199112/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 2:651565/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC > 2:1652101/1‑100 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 1:1464930/100‑1 GACCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCC < 2:1498205/100‑1 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CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTC > 1:1571798/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTC > 2:3782123/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTATGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTC > 2:464322/1‑100 CCTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCGAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTCGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTC > 2:2374193/1‑100 CTTGAGATAACATCCTTTACTGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTCATCCGGGTTGCTGACACTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC < 2:3288328/100‑1 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGTGGACAGTGTCGGGTGGGTAGTTTGACTGTGGCGGTCTCCTtc < 1:2663912/100‑3 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCn < 1:3559308/100‑2 CTTGAAATACCACCCTTTAATGTTTGATGTTCTAACGTTGACCCGTAATCCGGGTTGCGGACAGTGTCTGGTGGGTAGTTTGACTGGGGCGGTCTCCTCC > 2:1504456/1‑100 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |