| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,866,903 | C→T | 100% | E217K (GAG→AAG) | rpoS ← | RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,866,903 | 0 | C | T | 98.8% | 552.3 / ‑2.9 | 164 | E217K (GAG→AAG) | rpoS | RNA polymerase, sigma S (sigma 38) factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base T (74/87); total (77/87) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.16e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.34e-01 | |||||||||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
TATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAA > NC_000913/2866807‑2866999 | tATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATCTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGtt > 2:2101791/1‑100 (MQ=255) aTCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTa > 1:1830313/1‑100 (MQ=255) tCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTTTTTTTTTTTTATGTCCAGCAACGCGTTTTCGGATTCACTACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTTATTCGCTTGtt > 2:1959714/1‑98 (MQ=255) cTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTTTTTTTTTCTACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAg > 2:3504482/1‑100 (MQ=255) ttCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTACGa > 1:3130157/1‑100 (MQ=255) tCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGAc < 2:2310157/100‑1 (MQ=255) ggACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGaa < 1:1991726/100‑1 (MQ=255) aCCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGc < 1:3928142/100‑1 (MQ=255) ccGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCa > 1:3033091/1‑100 (MQ=255) tctcTTTTTCATCGGCCAGGAGGTCCAGCAACGCGTTTTCAGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATAc < 2:1938694/99‑1 (MQ=255) tctTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGTCGAAGCATACGGc < 2:2436910/100‑1 (MQ=255) tctTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGc > 1:3740904/1‑100 (MQ=255) tttttCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTg > 1:3669941/1‑100 (MQ=255) tttCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGAc < 2:2508209/100‑1 (MQ=255) tCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTTTTTTTTTTTTCCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGGCGAAGCATACGGCTGActt > 2:924567/1‑98 (MQ=255) cATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTAGTTAAGACGAAGCATACGACTGACGtc > 2:1684083/1‑100 (MQ=255) aTCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGtca < 1:1604077/100‑1 (MQ=255) cGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGtcatc < 1:2809546/100‑1 (MQ=255) ggCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGtcatca < 2:2817266/100‑1 (MQ=255) gCCAGGGTGTGCAGCAACGCTTTTTCGGAATCAGCACCTAGCGGGGTGTCTACCGGGGTAATGCGATTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGtcatc < 2:325536/98‑1 (MQ=255) aGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTg < 1:18164/100‑1 (MQ=255) ggATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTgg < 2:1762196/100‑1 (MQ=255) gATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGc < 1:2952003/100‑1 (MQ=255) gATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGc < 2:431787/100‑1 (MQ=255) gATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGc < 1:1318150/100‑1 (MQ=255) aTGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCt > 1:527848/1‑100 (MQ=255) cAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTGATCAACTGGCTTATc > 2:2302836/1‑99 (MQ=255) cAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTggataagcc < 1:2540849/100‑8 (MQ=255) cAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATcc < 1:3151622/100‑1 (MQ=255) cAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATcc < 2:2352029/100‑1 (MQ=255) cAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATcc > 1:1159588/1‑100 (MQ=255) cAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATcc < 1:1961204/100‑1 (MQ=255) cAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATcc < 1:2302848/100‑1 (MQ=255) gCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGATGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAg < 2:2111642/100‑1 (MQ=255) gCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCa < 2:665536/99‑1 (MQ=255) gCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAg > 1:2607963/1‑100 (MQ=255) gCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGATGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAg > 1:3743766/1‑100 (MQ=255) cAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGt > 2:3584526/1‑100 (MQ=255) cAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGt < 2:1509866/100‑1 (MQ=255) aaCGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGtt < 1:2477789/100‑1 (MQ=255) aaCGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGtt < 2:798067/100‑1 (MQ=255) aCGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTg > 1:1910369/1‑100 (MQ=255) cGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACAAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGATAAGCCAGtt < 2:298530/98‑1 (MQ=255) cGCTTTGTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTATCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGc < 1:2190022/100‑1 (MQ=255) gCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGATGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGct > 1:2760044/1‑100 (MQ=255) gCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGATAAGCCAGTTgat < 1:1690484/100‑3 (MQ=255) gCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGATAAGCCAGTTgat < 2:2931680/100‑3 (MQ=255) cTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGATAAGCCAGTTgatg < 2:1990395/100‑4 (MQ=255) tttttCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGATAAGCCAGTTgatga < 1:2927012/100‑5 (MQ=255) ttttCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGATAAGCCAGTTgatgac < 1:3102645/100‑6 (MQ=255) tttCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGc > 1:241464/1‑100 (MQ=255) cGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGAt < 2:63621/100‑1 (MQ=255) cGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGAt > 1:445744/1‑100 (MQ=255) cGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTACTAAACTGGCTTATCCCGTTGCTCTGc > 2:3244017/1‑97 (MQ=255) tcggtagacaccCCGCTGGGTGTCTACCGAGGTAATGCACTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGAtc > 2:2421847/9‑100 (MQ=255) ggAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGAtc < 1:1514033/100‑1 (MQ=255) ggAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGAtc < 1:445900/100‑1 (MQ=255) gAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGAtct < 1:1997498/100‑1 (MQ=255) gAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGAtct < 1:3871916/100‑1 (MQ=255) aTCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATctct < 1:1229719/100‑1 (MQ=255) accaccCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTcc > 1:687489/1‑100 (MQ=255) ccaccCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCg < 2:137665/100‑1 (MQ=255) caccCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGc < 2:1927896/100‑1 (MQ=255) accCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCa > 2:3749148/1‑100 (MQ=255) accCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCAGCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTcc < 1:1439508/97‑1 (MQ=255) cccAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCAc < 1:358643/100‑1 (MQ=255) gCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTgg > 2:2686150/1‑100 (MQ=255) gCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTgg > 1:1409657/1‑100 (MQ=255) gCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTgg > 1:3357312/1‑100 (MQ=255) cGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGt > 2:3446178/1‑100 (MQ=255) cGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGt < 2:933924/100‑1 (MQ=255) cGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGt < 2:1551178/100‑1 (MQ=255) ggggTGTCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCa < 2:506321/93‑1 (MQ=255) gtgtCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCAt < 1:385220/100‑1 (MQ=255) tgtCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATg < 1:2946446/100‑1 (MQ=255) tgtCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATg < 1:175457/100‑1 (MQ=255) gtCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCACCTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATgg > 2:2237328/1‑100 (MQ=255) gtCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATgg < 2:1419800/100‑1 (MQ=255) tCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGt > 2:3499383/1‑100 (MQ=255) tCTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGt < 1:3383370/100‑1 (MQ=255) cTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTc > 1:559754/1‑100 (MQ=255) cTACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCAGCACTTGGTTCATGGt > 1:883995/1‑99 (MQ=255) tACCGAGGTAATGCGCTTGTTGAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTcc > 2:2889126/1‑100 (MQ=255) tACCGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTcc < 2:925928/100‑1 (MQ=255) tACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTcc > 2:103930/1‑100 (MQ=255) ncGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAg > 1:2077976/2‑100 (MQ=255) ccGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAg < 1:364887/100‑1 (MQ=255) cGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGc > 1:823212/1‑100 (MQ=255) cGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGc > 1:1225190/1‑100 (MQ=255) cGAGGTAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGc > 2:1591292/1‑100 (MQ=255) tAATGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTGATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATg < 2:1539281/100‑1 (MQ=255) aTGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGCCGTCATCCCCTGGCTTATCCAGTTGCTTAGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATggg < 2:2149917/100‑1 (MQ=255) aTGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATggg < 2:3669913/100‑1 (MQ=255) tGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGa > 1:471376/1‑100 (MQ=255) tGCGCTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGa > 1:1008894/1‑100 (MQ=255) gcgcTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGAc < 1:3036375/100‑1 (MQ=255) gcgcTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGAc > 1:1578774/1‑100 (MQ=255) cgcTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACa < 2:1983443/100‑1 (MQ=255) gcTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACaa > 2:452505/1‑100 (MQ=255) gcTTGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACaa > 1:3347701/1‑100 (MQ=255) | TATCTTCCGGACCGTTCTCTTTTTCATCGGCCAGGATGTCCAGCAACGCTTTTTCGGAATCACCACCCAGCGGGGTGTCTACCGAGGTAATGCGCTCGTTAAGACGAAGCATACGGCTGACGTCATCAACTGGCTTATCCAGTTGCTCTGCGATCTCTTCCGCACTTGGTTCATGGTCCAGCTTATGGGACAA > NC_000913/2866807‑2866999 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |