| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 480,236 | C→G | 15.1% | E25Q (GAG→CAG) | hha ← | modulator of gene expression, with H‑NS |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 480,236 | 0 | C | G | 15.1% | 481.9 / 69.7 | 178 | E25Q (GAG→CAG) | hha | modulator of gene expression, with H‑NS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (83/66); new base G (10/17); total (94/84) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.40e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.10e-01 | |||||||||||
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
ATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTC > NC_000913/480138‑480334 | aTTCATGGTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTcc < 1:1371381/100‑1 (MQ=255) ttCATGGTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCa > 1:2155982/1‑100 (MQ=255) aTGGTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATTACACGCTCCAGCg < 1:2670697/100‑1 (MQ=255) aTGGTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGcn < 2:180087/100‑2 (MQ=255) aTGGTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCg < 2:2030535/100‑1 (MQ=255) ggTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGAGAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCgtg > 2:2147930/1‑100 (MQ=255) gTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATGCGTATTGATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCg > 2:3575987/1‑97 (MQ=255) gTCAATTCAGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTTAGTAAAATACCGCCAGTTCATGTACTGCTAAGTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCgtgt > 2:3551472/1‑100 (MQ=255) tCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTc < 1:1798575/100‑1 (MQ=255) cAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCa < 2:117478/100‑1 (MQ=255) cAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCa > 2:2744699/1‑100 (MQ=255) cAATTCGGCGAGGCGGTGATATGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATGCGTATTTATGTTACTCGATAACACGCTACAg > 2:891340/1‑93 (MQ=255) aaTTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGGAGCgtgttat < 1:1516832/100‑4 (MQ=255) aTTCGGCGAGGTGGTGATCTGCTGCGAAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGAGAATTCGTATTTATTTTTCGCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAAt < 2:3381881/100‑1 (MQ=255) aTTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTTACTAAAATATCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGGAGCgtgttatc < 2:3353804/100‑5 (MQ=255) aTTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGGAGCgtgttatc < 1:98361/100‑5 (MQ=255) aTTCGGCGAGGCGCTGATCTGGGGCTTAGTAAAATACCGACAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGGAGCgtgttatc < 2:368638/100‑5 (MQ=255) tCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAATACGCTCCAGCGTGTCAATTg < 1:3713552/100‑1 (MQ=255) tCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGGAGCgtgttatcga < 2:1208746/100‑7 (MQ=255) tCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGGAGCgtgttatcga < 1:1643887/100‑7 (MQ=255) tCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGGAGCgtgttatcga < 2:1662350/100‑7 (MQ=255) cGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGGAGCgtgttatcgag < 2:2310539/100‑8 (MQ=255) ggCGTGGCTGTGAGCTGCGGCTTAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATACCACGCTGGAGCgtgttatcgag < 2:2283484/99‑8 (MQ=255) ggCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTc > 1:1435191/1‑100 (MQ=255) gCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATTCCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTGTAGCgtgttatcg < 2:1238299/96‑6 (MQ=255) cGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTg > 1:3948022/1‑100 (MQ=255) cGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTg < 2:2264799/100‑1 (MQ=255) cGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTg > 1:1771402/1‑100 (MQ=255) attctgTGATGTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATGATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCt < 2:525471/92‑1 (MQ=255) ggTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAacg > 1:241509/1‑100 (MQ=255) gTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAacga > 1:973819/1‑100 (MQ=255) gTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAacg > 2:3241206/1‑99 (MQ=255) gATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAacgacg > 1:1719228/1‑100 (MQ=255) gATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAacgacg > 1:3502955/1‑100 (MQ=255) gATATGCGGCTGGGTAAAATACCGCCAGTTCATTATGTGAGAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCGGCGTGTCAATTGTCTGGCAacgacg < 1:1935752/100‑1 (MQ=255) aTCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGt > 1:189998/1‑100 (MQ=255) cTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATCATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACTCTCCAGCGTGTCCATTTTCTGGCAACGACGt > 2:2631694/1‑98 (MQ=255) cTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTaa > 1:240477/1‑100 (MQ=255) tGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTaaa > 1:959201/1‑100 (MQ=255) cGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACg > 1:3171522/1‑100 (MQ=255) cGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACg > 2:3928724/1‑100 (MQ=255) tGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCAtt < 1:1017993/100‑1 (MQ=255) tGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGCCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCAtt < 1:1533579/100‑1 (MQ=255) aGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTaa > 1:1258924/1‑100 (MQ=255) gTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTATCTGGCAACGACGTAAACGCATTa > 2:1878989/1‑98 (MQ=255) aTACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATc < 1:2141366/100‑1 (MQ=255) tACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCg < 2:2873799/100‑1 (MQ=255) aCCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCgg > 2:521542/1‑100 (MQ=255) ccGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGt > 1:752841/1‑100 (MQ=255) ccGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGt < 2:722387/100‑1 (MQ=255) cGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGtt > 2:93960/1‑100 (MQ=255) gCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCgg > 2:3779738/1‑97 (MQ=255) gCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGttt > 1:1577147/1‑100 (MQ=255) gCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGGCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACCCATTAAATAATCGGttt > 2:3291316/1‑100 (MQ=255) gTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGt > 2:1947741/1‑100 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGtt < 2:344577/100‑1 (MQ=255) ttCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGtt < 2:189998/100‑1 (MQ=255) tCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTa < 2:1579738/100‑1 (MQ=255) tCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTa > 2:2968458/1‑100 (MQ=255) cATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGtt < 2:644452/98‑1 (MQ=255) aTTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTaaa > 1:711458/1‑100 (MQ=255) tATCTGATAATTCGGATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCCGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAgg < 2:2427936/100‑1 (MQ=255) aTCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGt > 1:1725953/1‑100 (MQ=255) tGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGtttt > 1:951552/1‑100 (MQ=255) aaTTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCgg < 1:3311609/100‑1 (MQ=255) ttCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGAc < 1:3447603/100‑1 (MQ=255) ttCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGAc < 1:1046630/100‑1 (MQ=255) ttCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGAc < 1:3294692/100‑1 (MQ=255) tCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACa < 1:455290/100‑1 (MQ=255) atttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACt < 2:1792245/100‑1 (MQ=255) atttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACt > 1:889814/1‑100 (MQ=255) atttatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACt < 2:3129677/100‑1 (MQ=255) tatttTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTATGGCAACGACATAAACGCAATAAATAATCGGTTTTCGCTAAAAGCTTTTCGGAAATACtt > 2:733191/1‑98 (MQ=255) tttttCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTAc > 2:12013/1‑100 (MQ=255) ttttCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTAcc < 1:1000335/100‑1 (MQ=255) tttCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCt > 1:467540/1‑100 (MQ=255) agacaattgacacGCTGGAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTa > 2:3140633/10‑100 (MQ=255) tctcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTAt < 1:2295736/100‑1 (MQ=255) gacaattgacacGCTGGAGCGTGTTAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTCAATAATCGGTTTTCGTTAAAGATTTTTCGGACATACTTCTACCTAt > 2:649940/9‑100 (MQ=37) ctcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATg > 2:1079464/1‑100 (MQ=255) ctcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATg > 1:1908004/1‑100 (MQ=255) ctcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATg > 2:552202/1‑100 (MQ=255) ctcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATg > 1:3124439/1‑100 (MQ=255) tcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATgg > 2:1824775/1‑100 (MQ=255) tcGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATgg > 1:1197284/1‑100 (MQ=255) cGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTATAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGt < 2:2588498/100‑1 (MQ=255) cGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGt > 1:2430025/1‑100 (MQ=255) cGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGt > 1:1102943/1‑100 (MQ=255) cGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGt > 1:3034469/1‑100 (MQ=255) attgacacGCTGGAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGtt > 1:3075827/5‑100 (MQ=255) attgacacGCTGGAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGtt > 2:2193557/5‑100 (MQ=255) attgacacGCTGGAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGtt > 1:2872942/5‑100 (MQ=255) aTAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTg < 2:425138/100‑1 (MQ=255) aTAACACACTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCTGACATACTTCTACCTATGGTTg < 2:1475346/100‑1 (MQ=255) tgacacGCTGGAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGt > 1:3640655/3‑100 (MQ=255) tAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGt < 1:2986852/100‑1 (MQ=255) acacGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGtaa > 2:3811145/1‑100 (MQ=255) acacGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGtaa > 1:625095/1‑100 (MQ=255) acacGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGtaa > 2:690360/1‑100 (MQ=255) tCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTc < 2:486097/100‑1 (MQ=255) | ATTCATGGTCAATTCGGCGAGGCGGTGATCTGCGGCTGAGTAAAATACCGCCAGTTCATTATCTGATAATTCGTATTTATTTTTCTCGATAACACGCTCCAGCGTGTCAATTGTCTGGCAACGACGTAAACGCATTAAATAATCGGTTTTCGTTAAAGGTTTTTCGGACATACTTCTACCTATGGTTGTAATAATTC > NC_000913/480138‑480334 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |