| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,143,998 | C→T | G124S (GGT→AGT) | rne ← | endoribonuclease; RNA‑binding protein;RNA degradosome binding protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,143,998 | 0 | C | T | 98.4% | 217.8 / NA | 65 | G124S (GGT→AGT) | rne | endoribonuclease; RNA‑binding protein;RNA degradosome binding protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base T (34/29); total (34/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.69e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
CCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACACATC > NC_000913/1143902‑1144094 | ccAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGc > 2:226999/1‑100 (MQ=255) cAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGcc < 2:1133109/100‑1 (MQ=255) aGTGCTTCTTGTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCa < 2:1885013/100‑1 (MQ=255) cttcttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACt < 2:1632050/100‑1 (MQ=255) ttcttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTg > 1:1279989/1‑100 (MQ=255) tcttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACtag > 1:1632062/1‑98 (MQ=255) tcttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGa < 2:1137709/100‑1 (MQ=255) cttTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGAGGGTTGTTCGGCATCAGAACACGATAGCTACTCGACCGGCTGAt > 1:369427/1‑100 (MQ=255) ttttAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGAt < 2:512092/99‑1 (MQ=255) tttAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATaa > 2:365796/1‑100 (MQ=255) tCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAggtgg < 2:9663/100‑1 (MQ=255) tCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAggtgg < 2:1610130/100‑1 (MQ=255) cGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAggtggt < 1:1136905/100‑1 (MQ=255) ggTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGtt > 1:1523268/1‑100 (MQ=255) ggTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGtt < 2:22881/100‑1 (MQ=255) ggTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTTGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGc < 1:1228760/100‑1 (MQ=255) ggTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGc < 2:1135591/100‑1 (MQ=255) gtcgtcGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGcc > 2:1079987/1‑100 (MQ=255) gtcgCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCcgcg > 2:1548455/1‑100 (MQ=255) tcgCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCgcgc > 1:1862477/1‑100 (MQ=255) tCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTttgt > 1:480125/1‑100 (MQ=255) gATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTttgttg > 2:480443/1‑100 (MQ=255) aTACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGc > 1:975145/1‑100 (MQ=255) cGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCcgc > 1:801393/1‑100 (MQ=255) ggCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCcgcg < 2:1763929/100‑1 (MQ=255) cGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACACGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCcgcg < 1:416067/98‑1 (MQ=255) agaAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGctct > 1:947350/1‑100 (MQ=255) gaAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCtctt > 2:1319661/1‑100 (MQ=255) aaTGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCtcttct < 2:777822/100‑1 (MQ=255) aaTGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCtcttct < 1:1319667/100‑1 (MQ=255) aTGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTcttctt > 1:209301/1‑100 (MQ=255) ccACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTAt > 2:528527/1‑100 (MQ=255) cACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATc < 2:947348/100‑1 (MQ=255) aCCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCg > 1:1183388/1‑100 (MQ=255) cgcgcgcgGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATc > 1:1421290/1‑100 (MQ=255) cgcgcgcgGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATc < 2:975143/100‑1 (MQ=255) cgcgcgcgGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATc < 1:226998/100‑1 (MQ=255) gcgcgcgGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCt < 1:1687583/100‑1 (MQ=255) ctcgcgGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTg < 2:1198947/98‑1 (MQ=255) gcgcgGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGa < 1:1016664/100‑1 (MQ=255) cgcgGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGag > 1:1198952/1‑99 (MQ=255) gttgttCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATg < 1:1079992/100‑1 (MQ=255) ttgttCGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGa < 2:873918/100‑1 (MQ=255) cGGCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTcc > 2:714408/1‑100 (MQ=255) gCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTg < 2:2000283/100‑1 (MQ=255) gCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTg < 1:714409/100‑1 (MQ=255) gCATCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTg > 1:599216/1‑100 (MQ=255) cgatctgAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTg < 1:1692416/94‑1 (MQ=255) aTCAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGAGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGAc > 1:1417502/1‑100 (MQ=255) cAGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCt < 1:1473454/100‑1 (MQ=255) aGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCtt > 1:135753/1‑100 (MQ=255) aGAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCATGACCtt > 2:1284463/1‑100 (MQ=255) gAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGagatcg > 2:1692404/1‑95 (MQ=255) gAACCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTc > 1:1507464/1‑100 (MQ=255) aaCCAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCa < 1:365795/100‑1 (MQ=255) ccAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACg > 2:216884/1‑100 (MQ=255) cAGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGc < 2:136611/100‑1 (MQ=255) aGATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCa > 1:668560/1‑100 (MQ=255) gATAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCaa > 2:601078/1‑100 (MQ=255) aTAGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAac < 2:668560/100‑1 (MQ=255) tAGCTACTCGCCAGACTGACAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAaca < 2:17124/100‑1 (MQ=255) aGCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAacac > 2:987328/1‑100 (MQ=255) gCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAAcaca > 1:767158/1‑100 (MQ=255) gCTACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAAcaca > 1:1140425/1‑100 (MQ=255) tACTCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACACATc > 2:1270673/1‑100 (MQ=255) | CCAGTGCTTCTTTTAATTCGGTACGGTCGTCGCCTTCGATACGGCGAGAAATGCCACCCGCGCGCGGGTTGTTCGGCATCAGAACCAGATAGCTACCCGCCAGACTGATAAAGGTGGTTAATGCCGCGCCTTTGTTGCCGCGCTCTTCTTTATCGATCTGAACAATGACTTCCTGACCTTCACGCAACACATC > NC_000913/1143902‑1144094 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |