| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,950,955 | Δ1 bp | 16.7% | coding (124/567 nt) | yecD → | isochorismatase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,950,954 | 0 | G | . | 16.7% | 380.8 / 77.1 | 132 | coding (123/567 nt) | yecD | isochorismatase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (51/59); new base . (16/6); total (67/65) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.44e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.75e-01 | |||||||||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
CACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCA > NC_000913/1950855‑1951053 | cACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcg < 1:477706/100‑1 (MQ=255) aCTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcgg < 1:771265/100‑1 (MQ=255) aCTGCGCGGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcgg < 2:327419/100‑1 (MQ=255) cTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcggc > 1:2927646/1‑100 (MQ=255) cTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTAGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTggcagc > 2:285554/1‑100 (MQ=255) tGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGgcggcg < 2:47873/100‑1 (MQ=255) tGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGgcggcg < 2:2146299/100‑1 (MQ=255) tGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGgcggcg < 1:2185193/100‑1 (MQ=255) gcgcTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGa > 1:695270/1‑100 (MQ=255) cgcTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGaa < 1:677702/100‑1 (MQ=255) tggtggTGATCGATTTACAAGTAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAATTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAAtt < 2:1220899/100‑1 (MQ=255) ggtggtGAACGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAAtgt > 2:3409114/1‑98 (MQ=255) tggtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg < 1:2168936/100‑1 (MQ=255) ggtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑c < 1:488175/100‑1 (MQ=255) ggtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑c < 1:3013351/100‑1 (MQ=255) gtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑cg < 1:51878/100‑1 (MQ=255) gtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑cg > 1:3213414/1‑100 (MQ=255) gtgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg‑cg < 2:2692594/100‑1 (MQ=255) tgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCg‑cgc < 2:2604132/100‑1 (MQ=255) tgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCg‑cgc < 1:2053738/100‑1 (MQ=255) gATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTcg < 2:3142088/96‑1 (MQ=255) gATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGcc > 1:2532849/1‑100 (MQ=255) gATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGcc > 1:2688042/1‑100 (MQ=255) gATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGcc < 2:1388084/100‑1 (MQ=255) aTCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTcg‑ccgcca < 2:1370575/100‑6 (MQ=255) tCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAg < 1:3639091/100‑1 (MQ=255) tCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAg < 2:2742287/100‑1 (MQ=255) tCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAg < 1:2157209/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAg > 2:3085433/1‑99 (MQ=255) aTTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCgg < 1:1265457/100‑1 (MQ=255) tttACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGcttc < 1:2215176/100‑4 (MQ=38) ttACAAGAAGGCGTCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTc > 1:2396829/1‑100 (MQ=255) tACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCa > 2:294003/1‑100 (MQ=255) tACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCAACAAAATAACGAAGAGGTAGTTAATCGCGACGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGACAGAGGt > 2:240340/1‑98 (MQ=255) aCAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAg > 2:789372/1‑100 (MQ=255) agGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgtg > 2:145327/1‑100 (MQ=255) ggCCTCTTTCCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgtg < 2:2329471/99‑1 (MQ=255) gacATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgtgt > 1:2452983/3‑100 (MQ=255) cATCTTAGCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgtg < 2:2331769/97‑1 (MQ=255) cATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGttt < 1:2820426/100‑1 (MQ=255) cATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCAGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCAGTGttt > 2:203775/1‑100 (MQ=255) cTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTg > 1:3521595/1‑100 (MQ=255) cTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTg > 1:1227871/1‑100 (MQ=255) ttACCTTTTGCCGGTGGTCCTCATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTgg < 2:2093882/100‑1 (MQ=255) ttACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTgg < 1:789377/100‑1 (MQ=255) tACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGt > 2:3120785/1‑100 (MQ=255) ccTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCTGATGAGGTCGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CCCCAGCGGTCAGCCCGTGTATCTGGTgc > 2:741394/1‑100 (MQ=255) ccTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgc < 1:1000491/100‑1 (MQ=255) ccTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgc > 2:446368/1‑100 (MQ=255) ccTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgc < 1:799075/100‑1 (MQ=255) cTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgcg > 2:3309254/1‑100 (MQ=255) cGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGc < 1:107646/100‑1 (MQ=255) ggtggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCt < 1:3363132/100‑1 (MQ=255) ggtggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCt < 1:3431741/100‑1 (MQ=255) gtggtCGACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCATGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTg < 2:951671/100‑1 (MQ=255) tggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTgg < 1:2914538/100‑1 (MQ=255) tggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTgg < 2:176139/100‑1 (MQ=255) ggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGt > 2:1242140/1‑100 (MQ=255) gtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTc > 1:2343708/1‑100 (MQ=255) gtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTc > 1:3343662/1‑100 (MQ=255) tCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCt > 1:132640/1‑100 (MQ=255) cacaTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGc > 2:3454790/1‑100 (MQ=255) caTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCg < 1:3018208/100‑1 (MQ=255) aTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGa < 2:1005171/100‑1 (MQ=255) tGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTAc > 2:276295/1‑100 (MQ=255) ccGATGAGGTAGTTAATCGCTCCGGGAAGCTGTGGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGAtt < 2:3211091/96‑1 (MQ=255) ccGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGc < 1:209738/100‑1 (MQ=255) ccGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGc > 1:3230571/1‑100 (MQ=255) tGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGaa > 2:2059445/1‑100 (MQ=255) gAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAg < 1:1123137/100‑1 (MQ=255) aGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTTTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGc < 2:1956136/100‑1 (MQ=255) aGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGc < 1:1517925/100‑1 (MQ=255) ggTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCa > 1:699906/1‑100 (MQ=255) aGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGTCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTa < 2:462691/100‑1 (MQ=255) aGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCCGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTa > 2:545443/1‑100 (MQ=255) gTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaa > 2:1910024/1‑100 (MQ=255) ttAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaaa < 1:2102332/100‑1 (MQ=255) tAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGGTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTaaaa > 2:1209970/1‑100 (MQ=255) gcgcCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGcc > 2:1573385/1‑100 (MQ=255) gctgaccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGt > 1:2734730/8‑100 (MQ=37) ctgaccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTc > 1:1094364/7‑100 (MQ=38) gaccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGa > 2:511399/5‑100 (MQ=38) gAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGAt > 1:504204/1‑100 (MQ=255) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 1:1620190/3‑100 (MQ=39) aaGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg < 1:2710726/100‑1 (MQ=255) aaGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg < 1:3235732/100‑1 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 1:2756589/1‑100 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 2:126057/1‑100 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 1:1622442/1‑100 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 1:287904/1‑100 (MQ=255) cTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcgc > 2:922761/1‑100 (MQ=255) cTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcgc > 2:1353773/1‑100 (MQ=255) tGGCGGTGAAATTTCG‑CGCCAGTGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcgc < 1:259663/99‑1 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc > 1:281513/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc < 1:956347/100‑1 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc > 1:367900/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTCCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc < 1:1910034/100‑1 (MQ=255) gcggcgAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCt > 1:3630925/1‑100 (MQ=255) ggcgAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCa > 1:2576192/1‑100 (MQ=255) ggcgAAATTGCG‑CGCCAGCGGTCAGCTCTTGTTTCTGGTGCTCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCa < 2:2047336/100‑1 (MQ=255) | CACTGCGCTGGTGGTGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCA > NC_000913/1950855‑1951053 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |