| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,991,805:1 | +T | 15.0% | intergenic (+46/‑289) | ygeG → / → ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,991,805 | 1 | . | T | 15.0% | 521.1 / 96.8 | 153 | intergenic (+46/‑289) | ygeG/ygeH | SycD‑like chaperone family TPR‑repeat‑containing protein/putative transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (72/58); new base T (9/14); total (81/72) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.77e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
AAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATC > NC_000913/2991706‑2991904 | aaaGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAc < 2:628074/100‑1 (MQ=255)aaaGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAc < 1:1697761/100‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAcc‑‑c < 2:1442669/100‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAc‑‑c < 1:2795832/100‑1 (MQ=255) aaGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAc‑‑c < 1:1319964/100‑1 (MQ=255) aGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑Ca > 2:2277382/1‑100 (MQ=255) gcgcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CAc > 2:2644917/1‑100 (MQ=255) gcgcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CAc < 1:1744768/100‑1 (MQ=255) cgcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATTCTTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTAAAATAATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAc‑‑c < 2:535749/97‑1 (MQ=255) cgcAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACt > 1:372144/1‑100 (MQ=255) cAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACtat > 2:2144722/1‑100 (MQ=255) cATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAAcc < 1:196564/100‑1 (MQ=37) cATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAAcc < 1:63091/100‑1 (MQ=37) tatatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAg < 2:2317273/100‑1 (MQ=37) tatatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAg < 2:753010/100‑1 (MQ=37) tatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATTATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCa < 2:1215234/100‑1 (MQ=25) tatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCa > 1:531380/1‑100 (MQ=255) tatTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCa < 1:870076/100‑1 (MQ=37) ttGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAATCAGCAcc > 2:2517916/1‑100 (MQ=255) ttGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCAcc > 1:1969102/1‑100 (MQ=255) tGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACct > 2:309757/1‑100 (MQ=255) gAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACctc > 1:2519639/1‑100 (MQ=255) aaCTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACctct < 1:2820079/100‑1 (MQ=255) aaCTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACctct < 2:1022508/100‑1 (MQ=255) aCTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCtt > 1:1458608/1‑100 (MQ=255) ctctTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTa < 2:1441097/100‑1 (MQ=255) ctTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATg > 2:2948217/1‑100 (MQ=255) ctTAAACGATAATTCAAAAGCTAATGGTTAAGCAGTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CAGTATAACAAACAACTCTTAt > 2:1100248/1‑99 (MQ=255) tAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGtt > 1:2551130/1‑100 (MQ=255) aaaCGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGttt > 2:284505/1‑100 (MQ=255) aaCGATAATTCAGAGGATGATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGtttt < 1:3073243/100‑1 (MQ=255) aaCGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGtttt > 2:1186002/1‑100 (MQ=255) cttccgatctgaagaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCt < 2:3620733/90‑1 (MQ=255) cGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCt < 1:1488312/100‑1 (MQ=255) aTAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCCTTACAATCATTTGGTTAAATTTAATGGTTATAGTGCAGATAAC‑‑CACTCTAACCAGCACCTCTTATGTTTTGTTa > 2:1733832/1‑100 (MQ=255) tAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTaa < 2:790454/100‑1 (MQ=255) ttCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATc > 1:1378681/1‑100 (MQ=255) ttCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATc < 1:3510731/100‑1 (MQ=255) cAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAg < 2:1916187/100‑1 (MQ=255) cAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAg < 1:2074828/100‑1 (MQ=255) agaTAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGAACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCa < 2:3297271/98‑1 (MQ=255) tAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTa > 1:272705/1‑100 (MQ=255) tAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTa > 1:3243098/1‑100 (MQ=255) tGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTaaaa < 1:1737678/100‑1 (MQ=255) ggCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAAc > 1:1094615/1‑100 (MQ=255) gCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACa > 1:1993283/1‑100 (MQ=255) cTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAg > 2:2041672/1‑100 (MQ=255) tAATCATTACAATCACTTGGTTTGAATTGCTGGTTATAGTTCAGCTAAC‑‑CACTATAACCAACACCTCTTCTGTTTTCTTAAATCATCATCTTa < 2:2498001/93‑1 (MQ=255) tAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCAACTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGt > 2:1457833/1‑100 (MQ=255) aGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTa < 1:1374425/100‑1 (MQ=255) aGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTa > 1:2403019/1‑100 (MQ=255) aGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTa < 2:2090853/100‑1 (MQ=255) aGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTa < 1:743548/100‑1 (MQ=255) ttACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAagag > 2:2578958/1‑100 (MQ=255) aCAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCa > 2:1736125/1‑100 (MQ=255) cAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCAt < 1:2640286/100‑1 (MQ=255) aTCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATAc < 1:90099/100‑1 (MQ=255) tCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACt < 1:3130102/100‑1 (MQ=255) tCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACt < 1:2847796/100‑1 (MQ=255) tGGTTAAATTTGCTGGTTATCGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATaaa > 2:2226364/1‑100 (MQ=255) ggTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAAt < 2:2003088/100‑1 (MQ=255) gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATc > 2:786117/1‑100 (MQ=255) gTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATc > 1:3417091/1‑100 (MQ=255) tcttccgatcTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCa < 2:1456150/91‑1 (MQ=25) aaaTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCatt < 2:58229/100‑1 (MQ=255) aTTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCACACTATAAATCattat > 1:3588966/1‑100 (MQ=255) gtGCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAttt > 1:1566743/2‑100 (MQ=25) gCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAttttt < 2:871321/100‑1 (MQ=255) gCTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTAttttt > 1:710012/1‑100 (MQ=37) cTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTc < 2:1760060/100‑1 (MQ=255) cTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTc > 1:1511716/1‑100 (MQ=37) cTGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTc > 2:2637307/1‑100 (MQ=37) tGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCa > 1:1548816/1‑100 (MQ=37) tGGTTATAGTG‑‑GTTAACTGCACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCa > 1:2524579/1‑100 (MQ=37) ggTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCGGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCaa < 2:106969/100‑1 (MQ=255) ggTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCaa > 1:1000250/1‑100 (MQ=255) ggTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCaa > 2:1499811/1‑100 (MQ=255) ggTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCaa > 2:435891/1‑100 (MQ=255) ggTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCaa > 1:2332760/1‑100 (MQ=255) ggTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCaa > 1:3440470/1‑100 (MQ=255) tataGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGc > 1:102049/1‑100 (MQ=255) aGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGtt < 1:2791495/100‑1 (MQ=255) aGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGtt > 1:2137055/1‑100 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTa > 1:237174/1‑100 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTa > 2:2854960/1‑100 (MQ=255) gTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTa > 1:1831515/1‑100 (MQ=255) tGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTag < 2:41042/100‑1 (MQ=255) cAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTagag > 1:2632491/1‑100 (MQ=255) cAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTagag < 1:1283351/100‑1 (MQ=255) aGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTa < 2:2804728/96‑1 (MQ=255) aGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAgaga > 1:1286310/1‑100 (MQ=255) aGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAgaga > 1:1381755/1‑100 (MQ=255) gTTAAC‑‑CACTATAACTATCACTTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGaa > 2:1319579/1‑100 (MQ=255) gTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGaa > 1:1644793/1‑100 (MQ=255) gTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGaa > 1:3330718/1‑100 (MQ=255) tAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACa > 1:463948/1‑100 (MQ=255) aC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCATCATCTTATAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACaa < 2:434505/99‑1 (MQ=255) c‑‑cACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATc > 1:1446736/1‑100 (MQ=255) c‑‑cACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATc < 1:913539/100‑1 (MQ=255) c‑‑cACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATc > 1:1189076/1‑100 (MQ=255) | AAAGCGCAGGCATATATTGAACTCTTAAACGATAATTCAGAAGATAATGGCTAAGCATTACAATCATTTGGTTAAATTTGCTGGTTATAGTGCAGTTAAC‑‑CACTATAACCAGCACCTCTTATGTTTTCTTAAATCAGCATCTTAAAACAGTTAAGAGCATACTATAAATCATTATTTTTCAATGCGTTAGAGAACAATC > NC_000913/2991706‑2991904 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |