New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 2728214 = | NA (NA) | 53 (0.430) | 11/170 | NT | NA | noncoding (971/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA of rrnG operon |
? | NC_000913 | 2728240 = | NA (NA) | noncoding (945/2904 nt) | rrlG | 23S ribosomal RNA of rrnG operon |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/2728316‑2728214 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgtgTGTCTCCCGTGATAACATTCTCCGGTATTCGCAGTTTGCATCGGGTTGGTAAGTCGGGATGACCCCCTTGCCGAAACAGTGCTCTACCCCCGGAGATGA > NC_000913/2728240‑2728338 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACATGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 2:2218858/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGTTAACGTCCGTC < 2:2795761/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 1:722646/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:2497292/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 1:2731249/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:2362442/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 1:3013240/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 1:62312/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:13854/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:1512823/1‑100 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC < 2:2732523/100‑1 GTTTCGGCAAGGGGGTCATCCCGACTTACCAACCCGATGCAAACTGCGAATACCGGAGAATGTTATCACGGGAGACACACGGCGGGTGCTAACGTCCGTC > 2:2607138/1‑100 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |