| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3620614 | NA (NA) | 35 (0.290) | 10/166 | NT | 100% | coding (1423/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3620635 | 0 (0.000) | coding (1444/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
GTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAGGAAACTGCCCCTGACGGCGATATCACCCGCTACCGTTATGATAATCCACACA > NC_000913/3620536‑3620734 | ttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACg > 1:2632883‑M2/47‑100 (MQ=255)gtgACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACG < 1:3440121‑M2/100‑1 (MQ=255)gtgACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACG > 2:294842‑M2/1‑100 (MQ=255) tgACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACG < 2:1590910‑M2/99‑1 (MQ=255) gggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaac > 1:2491020‑M2/1‑95 (MQ=255) gggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaac > 1:2810749‑M2/1‑95 (MQ=255) gggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaac > 1:446751‑M2/1‑95 (MQ=255) gggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaac > 2:3193022‑M2/1‑95 (MQ=255) ggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGCCCGGT‑GGCTGACGttaact > 1:2569890‑M2/1‑94 (MQ=255) ggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGCCCGGT‑GGCTGACGttaact > 1:2105532‑M2/1‑94 (MQ=255) ggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaact > 2:1871381‑M2/1‑94 (MQ=255) ggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaact > 1:1409448‑M2/1‑94 (MQ=255) ggCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaact > 2:121600‑M2/1‑94 (MQ=255) gCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGCCCGGT‑GGCTGACGttaactg > 1:2868547‑M2/1‑93 (MQ=255) gCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaactg > 2:2834908‑M2/1‑93 (MQ=255) gCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaactg > 2:438937‑M2/1‑93 (MQ=255) ccTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaactgg > 2:2727993‑M2/1‑92 (MQ=255) cTCATCACGCGCATAACCACGCCGTATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGCCCGGT‑GGCTGACGttaactggt > 1:3040087‑M2/1‑91 (MQ=255) cTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaactggt > 1:959637‑M2/1‑91 (MQ=255) tggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTg > 1:452175‑M2/36‑100 (MQ=255) catcaCGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGGC‑CCGGTGGCTGACGttaactggttg > 1:1644701‑M2/1‑89 (MQ=255) ttatagtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCgg > 1:230472‑M2/30‑100 (MQ=255) ttatagtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCgg > 1:2954269‑M2/30‑100 (MQ=255) tagtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATACCCACCACGACCAGTTAACGTCCGCCACCGG‑GCCGGACGGGCTGGCATTGcgcccg > 2:863803‑M2/27‑95 (MQ=255) tagtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGaa > 2:925138‑M2/27‑100 (MQ=255) tagtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGaa > 1:1333646‑M2/27‑100 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCGGGAata > 1:652595‑M2/25‑100 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCGGGAat > 1:2001744‑M2/25‑99 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAata > 1:107914‑M2/25‑100 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAata > 1:447808‑M2/25‑100 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAata > 1:2205656‑M2/25‑100 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAata > 2:2902939‑M2/25‑100 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAata > 2:1837912‑M2/25‑100 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAata > 2:725486‑M2/25‑100 (MQ=255) gtaaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGACTGGAATTGCGCCGGGAata > 1:1394934‑M2/25‑100 (MQ=255) taaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAata > 2:12089‑M2/24‑99 (MQ=255) aaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATatg > 2:302414‑M2/23‑100 (MQ=255) aaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATatg > 2:2952790‑M2/23‑100 (MQ=255) aaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATatg > 2:302402‑M2/23‑100 (MQ=255) aaaacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATatg > 1:2811998‑M2/23‑100 (MQ=255) aacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCGGGAATatgat > 1:3464593‑M2/21‑100 (MQ=255) aacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCGGGAATatgat > 2:1751361‑M2/21‑100 (MQ=255) aacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATatgat > 1:1226146‑M2/21‑100 (MQ=255) aacgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATatgat > 1:335089‑M2/21‑100 (MQ=255) acgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCGGGAATatgatg > 1:2535500‑M2/20‑100 (MQ=255) acgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCGGGAATatgatg > 1:1425147‑M2/20‑100 (MQ=255) acgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGCGCTGAAATTGCGCCGGGAATatg > 2:1275359‑M2/20‑97 (MQ=255) cgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCGGGAATAtgatga > 1:3276689‑M2/19‑100 (MQ=255) cgccgatgccctgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAGCCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAAATACGCCGGGAATAtgatga > 1:2787118‑M2/19‑100 (MQ=255) tgccatcCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTc < 2:335086‑M2/93‑1 (MQ=255) CGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCa < 1:1599857‑M2/100‑1 (MQ=255) GGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAGCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAg < 1:639797‑M2/100‑1 (MQ=255) GGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCCGCCACCGG‑GCCTGACGGACTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAg < 1:2556047‑M2/100‑1 (MQ=255) GGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAg > 1:1379862‑M2/1‑100 (MQ=255) GGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATCGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAg < 2:1948912‑M2/100‑1 (MQ=255) GCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAgg < 1:3496132‑M2/100‑1 (MQ=255) CGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAGGa < 2:2936850‑M2/100‑1 (MQ=255) CGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAGGa < 2:1527846‑M2/100‑1 (MQ=255) CGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAGGa < 1:487494‑M2/100‑1 (MQ=255) CGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAGGa < 2:2849277‑M2/100‑1 (MQ=255) GTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGCCGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAgg > 2:3441798‑M2/1‑98 (MQ=255) GTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAGGaa < 1:1482287‑M2/100‑1 (MQ=255) 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tAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgt < 1:1772662‑M2/100‑77 (MQ=255) tAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgt < 2:1568278‑M2/100‑77 (MQ=255) tAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgt < 1:2095715‑M2/100‑77 (MQ=255) aaCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtc < 1:2373474‑M2/100‑78 (MQ=255) aaCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtc < 1:3054945‑M2/100‑78 (MQ=255) aaCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcccgtgatgaggcccgtc < 1:60719‑M2/100‑78 (MQ=255) aaCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtgggggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtc < 1:2150790‑M2/100‑78 (MQ=255) aaCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggctgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggtgatgcgcgtgatgaggcccgtc < 1:848859‑M2/100‑78 (MQ=255) aaCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggctgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggtgatgcgcgtgatgaggcccgtc < 2:2675398‑M2/100‑78 (MQ=255) aaCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggctgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggtgatgcgcgtgatgaggcccgtc < 1:570714‑M2/100‑78 (MQ=255) aCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtca < 1:1498137‑M2/100‑79 (MQ=255) aCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgaggttatgcgcgtgatgaggcccgtc < 1:341976‑M2/99‑78 (MQ=255) aCGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggctgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggtgatgcgcgtgatgaggcccgtca < 1:1434930‑M2/100‑79 (MQ=255) cGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcac < 1:1436188‑M2/100‑80 (MQ=255) 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gACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtact < 2:1362111‑M2/100‑97 (MQ=255) gACGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtact > 1:827025‑M2/1‑4 (MQ=255) aCGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtactc > 1:3304042‑M2/1‑3 (MQ=255) aCGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtactc > 1:2027774‑M2/1‑3 (MQ=255) cGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtactct < 2:1863339‑M2/100‑99 (MQ=255) cGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtactct < 1:3188424‑M2/100‑99 (MQ=255) cGttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtactct < 1:2294590‑M2/100‑99 (MQ=255) gttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtactctg > 2:2596672‑M2/1‑1 (MQ=255) gttaactggttgtggtggttatagtaaaacgccgatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtactctg < 1:997442‑M2/100‑100 (MQ=255) gttaactggttgtggtggttatagtaaaacgcagatgccctgccatccggcgtggttatgcgcgtgatgaggcccgtcaccacatccgggctgtactctg > 1:823407‑M2/1‑1 (MQ=255) | GTGACGGGCCTCATCACGCGCATAACCACGCCGGATGGCAGGGCATCGGCGTTTTACTATAACCACCACAACCAGTTAACGTCAGCCACCGG‑GCCTGACGGGCTGGAATTGCGCCGGGAATATGATGAATTGGGCCGTCTGATTCAGGAAACTGCCCCTGACGGCGATATCACCCGCTACCGTTATGATAATCCACACA > NC_000913/3620536‑3620734 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |