| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,798,235 | A→T | 15.5% | intergenic (+28/+4) | waaL → / ← waaU | O‑antigen ligase/lipopolysaccharide core biosynthesis |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,798,235 | 0 | A | T | 15.5% | 391.5 / 59.0 | 154 | intergenic (+28/+4) | waaL/waaU | O‑antigen ligase/lipopolysaccharide core biosynthesis |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (72/58); new base T (14/10); total (86/68) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.27e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
ATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTA > NC_000913/3798136‑3798333 | aTTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTaa > 1:3260126/1‑100 (MQ=255)aTTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTaa < 1:1030604/100‑1 (MQ=255) ttCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTaaa > 1:3615980/1‑100 (MQ=255) ccAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAATAATAAAATTAATTAGGAATAAAGAAATTTAAGAAATGAGTTaaaa > 2:3086176/1‑99 (MQ=255) ccAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAAc < 1:2315008/100‑1 (MQ=255) ccAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAAc > 2:1691882/1‑100 (MQ=255) ccAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAAc > 1:534674/1‑100 (MQ=255) ccAATTATCATTATATCCGCTATAGGCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAAc < 2:770167/100‑1 (MQ=255) cAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACt > 2:1317907/1‑100 (MQ=255) aaTTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAATAAGTGAGTTAAAACTc > 2:844757/1‑100 (MQ=255) aaTTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTc < 2:534672/100‑1 (MQ=255) aTTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCa < 1:444216/100‑1 (MQ=255) tCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCActtc < 1:1112762/100‑1 (MQ=255) cATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCActtct < 1:1132260/100‑1 (MQ=255) cATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCActtct < 1:1822789/100‑1 (MQ=255) aTTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCActtctt > 2:1103374/1‑100 (MQ=255) aTTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCActtctt > 2:2278438/1‑100 (MQ=255) aTTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCActtctt > 1:2292204/1‑100 (MQ=255) ttATATCCGCTATAGTCCTCTTACTAGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTa < 2:2897219/100‑1 (MQ=39) ttATATCCACTATAGTCCACTTACTCATCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTCAGTTAAAACTCACTTCTTa < 2:923259/100‑1 (MQ=255) atatCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTaaa < 1:1758794/100‑3 (MQ=255) tCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCta < 2:689085/99‑1 (MQ=255) cctatataGTCCTCTTACTCATCATTAATATTCGTAACGATCCGATTAATTAAGAATAAACGAGTTTAAGAAGTGAGTTAAATCTCACTTCTTATc < 2:1617058/92‑1 (MQ=255) ctcTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAAGAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACATGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATAc < 2:3477513/98‑1 (MQ=255) cGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATAc < 1:3558338/100‑1 (MQ=255) cGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATAc > 1:1248636/1‑100 (MQ=255) tataGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAAc < 1:2042057/100‑1 (MQ=255) tataGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCAATTATTATTTATACaa > 2:2105755/1‑99 (MQ=255) tactctTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAAt < 1:1879496/98‑1 (MQ=255) tctTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAAtctc > 2:3240558/1‑100 (MQ=255) ctTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATctct > 1:965607/1‑100 (MQ=255) tACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCttt < 2:726263/100‑1 (MQ=255) ctctTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAATAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTAc < 2:2888797/100‑1 (MQ=255) cGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTg < 2:1840135/100‑1 (MQ=255) gTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGa > 2:3424248/1‑100 (MQ=255) tCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGaa < 1:3392312/100‑1 (MQ=255) tCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGaa < 1:3023224/100‑1 (MQ=255) cATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAGTAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAAt > 2:2179099/1‑100 (MQ=255) cATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGa > 2:40405/1‑98 (MQ=255) cATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAAt > 1:236266/1‑100 (MQ=255) atCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTaaa < 1:1571288/100‑1 (MQ=255) atCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTaaa < 2:3315381/100‑1 (MQ=255) tCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAg < 2:3253090/100‑1 (MQ=255) tCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAg < 1:167603/100‑1 (MQ=255) tCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAg < 1:2417790/100‑1 (MQ=255) cGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGACCTGAATTAAAACTCAAGTATTAGCTATACAAATTAATCTCTTTATTGCAtaaatagaa > 2:3572117/1‑90 (MQ=255) cGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGt < 1:427222/100‑1 (MQ=255) gTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAAATCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGt > 1:154201/1‑99 (MQ=255) tAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGttt > 1:3375362/1‑100 (MQ=255) acaatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCa < 1:2179113/100‑1 (MQ=255) acaatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCa < 1:3424273/100‑1 (MQ=255) acaatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCa < 2:2573403/100‑1 (MQ=255) acaatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTATTATCTATACAACTTAATTTCTTTAATAAATTAGTTAAAGtttaa > 2:3509564/1‑98 (MQ=255) caatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAg < 2:1537369/100‑1 (MQ=255) aatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGt < 2:1464147/100‑1 (MQ=255) aatacaatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGt > 1:913952/1‑100 (MQ=255) caatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCg > 1:2363408/1‑100 (MQ=255) caatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCg > 2:3258121/1‑100 (MQ=255) caatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCg < 2:1428527/100‑1 (MQ=255) caatTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCg < 1:2191895/100‑1 (MQ=255) ttaattaaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGata < 1:3258356/100‑1 (MQ=255) ttaattaaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGata < 2:43647/100‑1 (MQ=255) taattaaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGatat > 2:1036552/1‑100 (MQ=255) attaaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCt > 1:160471/1‑100 (MQ=255) taaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCttt > 1:156961/1‑100 (MQ=255) aaGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCtttt > 1:2244192/1‑100 (MQ=255) gAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTAc > 1:3095589/1‑100 (MQ=255) aTAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAAGCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCg < 1:2793662/100‑1 (MQ=255) aaaCAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGta > 1:814738/1‑100 (MQ=255) aaaCAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGta < 1:3316897/100‑1 (MQ=255) tgtatagatAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTATATATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGtat > 2:1941028/9‑100 (MQ=37) aaCAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTAACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACAGAATTAGTTAAAGTATAAGTATCGATATCTTTTa > 2:3122313/1‑94 (MQ=255) aCAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTGATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGtatn < 1:1342579/100‑2 (MQ=255) tatagatAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTatat > 1:1068972/7‑100 (MQ=38) atagatAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATg > 1:1928914/6‑100 (MQ=38) gTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCTTATATGtt > 2:2430065/1‑100 (MQ=255) gTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGtt > 2:13176/1‑100 (MQ=255) tttAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGCATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTg > 1:2716852/1‑100 (MQ=255) gatAAGAAGTGAGTTTTAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTg > 2:140677/3‑100 (MQ=255) ttAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTgg < 2:1248628/100‑1 (MQ=255) tAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATTTATACAACTTAATCTCTTTACTGTATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTggg < 2:226136/100‑1 (MQ=255) tAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTggg > 1:3121367/1‑100 (MQ=255) aagaagTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTgggg < 1:1354000/100‑1 (MQ=255) aagaagTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTgggg > 1:2003954/1‑100 (MQ=255) agacgTGAGTTAAAAATCACTTCTTATCTATAAAAATTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTACAGTATCGATATTTTTTCTCATATATGtt > 2:1188023/1‑95 (MQ=255) agaagTGAGTTTTAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGa > 2:2785992/1‑100 (MQ=255) agaagTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGa > 2:3064882/1‑100 (MQ=255) agaagTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGa > 1:746964/1‑100 (MQ=255) agaagTGAGGTTTAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTAATGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTAACGTATCTGTTgcgg > 2:833732/1‑99 (MQ=255) gaagTGAGTTTTAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGAt > 1:1760599/1‑100 (MQ=255) gaagTGAGTTTTAACGCACTGCTTATCTAGACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGAGAt > 1:1584793/1‑100 (MQ=255) aagTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATa < 1:1887285/100‑1 (MQ=255) gTGAGTTTTAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACt > 1:2578438/1‑100 (MQ=255) tGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGTATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACt < 2:1595901/99‑1 (MQ=255) tGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTa > 1:2285875/1‑100 (MQ=255) gTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTAttt < 1:2420945/100‑1 (MQ=255) gTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTAttt > 2:456842/1‑100 (MQ=255) gTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTAttt > 2:3081279/1‑100 (MQ=255) tAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTTAATTAGTTCAAGTGTCAGTATCGATCTCTTTTACCGTATATGTTGGGTATACTATTTg > 2:2212118/1‑99 (MQ=255) aaatCTCACTTCTTATCTATACTACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCCTATATGTTGCGGATACTATTTTta < 2:3393879/100‑1 (MQ=255) | ATTCCAATTATCATTATATCCGCTATAGTCCTCTTACTCGTCATTAATAATCGTAACAATACAATTAATTAAGAATAAACAAGTTTAAGAAGTGAGTTAAAACTCACTTCTTATCTATACAACTTAATCTCTTTACTGAATTAGTTAAAGTTTCAGTATCGATATCTTTTACCGTATATGTTGGGGATACTATTTGTA > NC_000913/3798136‑3798333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |