| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 4,332,868 | G→T | 16.2% | R135R (CGC→CGA) | basS ← | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with BasR |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 4,332,868 | 0 | G | T | 16.2% | 495.2 / 81.3 | 192 | R135R (CGC→CGA) | basS | sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with BasR |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (77/84); new base T (17/14); total (94/98) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.58e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.27e-01 | |||||||||||
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
CAGCAGTTCCAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTGCGCGCTTCC > NC_000913/4332769‑4332967 | cagcagTTCCAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAgg > 2:748312/1‑100 (MQ=255) gcagTTCCAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCATTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCg < 2:2168009/100‑1 (MQ=255) gcagTTCCAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCg > 1:11532/1‑100 (MQ=255) ttCCAGATGCAAACGCACCCCAGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTg < 2:349761/100‑1 (MQ=255) ccAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGAc > 1:1469809/1‑100 (MQ=255) ccAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGAc > 1:3518583/1‑100 (MQ=255) cAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGAcc > 1:2791720/1‑100 (MQ=255) cAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGAcc > 1:3066199/1‑100 (MQ=255) cAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGAcc > 1:2404642/1‑100 (MQ=255) cAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGAcc > 2:1554685/1‑100 (MQ=255) aGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCa < 2:2284193/100‑1 (MQ=255) gATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAg > 1:1459609/1‑100 (MQ=255) aTGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGTCGCCTGACCAgc < 1:877780/100‑2 (MQ=255) tGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGa > 1:411889/1‑99 (MQ=255) tGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGAt > 2:1853959/1‑100 (MQ=255) tGCAAACGCACCCCCGACAGTGGCGTTCGTAGTTCGTGCGCGACGTCCGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAgct > 2:3361385/1‑98 (MQ=255) gCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGTCGCCTGACCAgcac < 2:3247159/100‑4 (MQ=255) gCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGTCGCCTGACCAgcac < 2:2805919/100‑4 (MQ=255) gCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGTCGCCTGACCAgcac < 1:1254864/100‑4 (MQ=255) cAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGTCGCCTGACCAgcacg < 1:3645707/100‑5 (MQ=255) cAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGTCGCCTGACCAgcacg < 1:1644126/100‑5 (MQ=255) cAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCg > 2:2036139/1‑100 (MQ=255) aaaCGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGTCGCCTGACCAgcacgc < 2:899412/100‑6 (MQ=255) aaaCGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGt < 1:2119195/100‑1 (MQ=255) aCCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACg < 2:2618634/100‑1 (MQ=255) cccccGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGc > 1:1570257/1‑100 (MQ=255) ccccGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGcc > 1:1805682/1‑100 (MQ=255) ccccGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGcc > 1:3521980/1‑100 (MQ=255) ccccGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGcc < 2:2608193/100‑1 (MQ=255) cccGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCg < 1:710664/100‑1 (MQ=255) cGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGaa < 2:1774716/100‑1 (MQ=255) gCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCCCTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGGCGaaa > 2:190301/1‑100 (MQ=255) naGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCCTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAacc > 2:567679/2‑100 (MQ=255) cAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAacc < 2:2024016/100‑1 (MQ=255) cAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAacc > 2:568024/1‑100 (MQ=255) aGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAacca > 2:2878019/1‑100 (MQ=255) aGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAacca > 2:846445/1‑100 (MQ=255) tGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAaccacc < 2:2566960/100‑1 (MQ=255) gTTCGCAGTTCGTGCGAGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATATAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAGCGCCGAAACCACCGc < 2:2944976/98‑1 (MQ=255) tCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCg < 1:3122343/100‑1 (MQ=255) cAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGAtt < 1:107204/100‑1 (MQ=255) aGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGAttt > 1:2383132/1‑100 (MQ=255) cGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAg < 2:2055162/100‑1 (MQ=255) gTGCGCGACGTCAGCGGTAAACATCCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAgg < 2:3333967/100‑1 (MQ=255) tGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAggg < 2:444637/100‑1 (MQ=255) gcgcGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGt > 1:768248/1‑100 (MQ=255) cgcgACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTg > 1:2775530/1‑100 (MQ=255) aCGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGgcgc < 2:927596/100‑1 (MQ=255) cGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAGCGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGgcgc < 2:1078264/99‑1 (MQ=255) cGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCt > 1:1296005/1‑100 (MQ=255) gTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCtg > 2:1061252/1‑100 (MQ=255) cAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCtgtg < 2:7745/100‑1 (MQ=255) cAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCtgtg < 2:1570249/100‑1 (MQ=255) gCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGaa < 1:2044693/100‑1 (MQ=255) gCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGaa > 2:1479581/1‑100 (MQ=255) cGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCATGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAAt > 1:2216694/1‑100 (MQ=255) ggTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATg < 2:3439765/100‑1 (MQ=255) ggTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATg < 1:2714363/100‑1 (MQ=255) gTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATgg < 1:3197722/100‑1 (MQ=255) tAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGc < 1:3439590/100‑1 (MQ=255) tAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGc < 1:2881281/100‑1 (MQ=255) tAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGc > 2:1451184/1‑100 (MQ=255) tAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGc > 2:535253/1‑100 (MQ=255) tAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGc < 1:1233367/100‑1 (MQ=255) aaaCAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCa < 1:956269/100‑1 (MQ=255) aacaacCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGGGTAACGCCGAAACCACCGCGTCGATGTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCa > 2:3039158/1‑99 (MQ=255) acCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATggg > 2:2087701/1‑100 (MQ=255) ccTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGACACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGGGCTGTGAATGGCAATGGGc > 2:3026733/1‑100 (MQ=255) ccTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGc < 2:3624635/100‑1 (MQ=255) tCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGt < 2:1249323/98‑1 (MQ=255) gTTATCCTGCGTGCTGGTCAGGCGACTGTCTAGATTGTTGAGCGCCGAAACCGCCGCTTCGATTTCGTGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTaa < 1:1943092/99‑1 (MQ=255) gTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAg > 1:983513/1‑100 (MQ=255) gTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAg < 1:557959/100‑1 (MQ=255) tATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGtt > 1:3623594/1‑100 (MQ=255) gttaaacgatcTGGTCAGTCGCCTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTg > 1:1883461/11‑100 (MQ=38) ccAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTc > 2:74347/1‑100 (MQ=255) ccAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTc < 1:2576046/100‑1 (MQ=255) cAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTcg < 2:2685328/100‑1 (MQ=255) cgatcTGGTCAGTCGCCTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTcggcg > 2:1167296/5‑100 (MQ=255) cgatcTGGTCAGTCGCCTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACAGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTcggcg > 1:642375/5‑100 (MQ=255) gatcTGGTCAGTCGCCTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTcggcgg > 1:2859471/4‑100 (MQ=255) gatcTGGTCAGTCGCCTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTcggcgg > 1:293118/4‑100 (MQ=255) gatcTGGTCAGTCGCCTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTcggcgg > 1:309240/4‑100 (MQ=255) gatcTGGTCAGTCGCCTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTcggcgg > 1:46518/4‑100 (MQ=255) gTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTcggcgg < 2:3204314/100‑1 (MQ=255) atcTGGTCAGTCGCCTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGt > 1:1003657/3‑100 (MQ=255) gCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTg < 2:1219156/100‑1 (MQ=255) gCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACAACCGCGTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAAGGGAAATGGGCGTTAAGTTATCGGCGGTg > 2:1731131/1‑100 (MQ=255) cTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTgc < 1:2894814/100‑1 (MQ=255) cTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTgc > 1:2152977/1‑100 (MQ=255) tGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAATTCTCCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGTAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTgc < 1:2272021/99‑1 (MQ=255) tGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTgcg < 1:2341562/100‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGACTGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTgcg > 2:1683230/1‑99 (MQ=255) ggTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTgcgc > 2:1826561/1‑100 (MQ=255) ggTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTgcgc < 1:3417221/100‑1 (MQ=255) ggTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTCGTCGGCGGTgcgc > 1:1376882/1‑100 (MQ=255) tCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTgcgcgc < 1:2681310/100‑1 (MQ=255) ggCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTGCGCGCTTc > 1:3484819/1‑100 (MQ=255) gCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTGCGCGCTTcc < 2:1295149/100‑1 (MQ=255) gCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGCGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTGCGCGCTTcc < 2:309412/100‑1 (MQ=255) | CAGCAGTTCCAGATGCAAACGCACCCCCGCCAGTGGCGTTCGCAGTTCGTGCGCGACGTCAGCGGTAAACAACCTTTCGTTATCCAGCGTGCTGGTCAGGCGACTGACCAGATCGTTTAACGCCGAAACCACCGCTTCGATTTCGAGGGTGGCGCTGTGAATGGCAATGGGCGTTAAGTTGTCGGCGGTGCGCGCTTCC > NC_000913/4332769‑4332967 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |