Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 4,551,422 | T→A | 17.2% | intergenic (‑126/‑214) | gntP ← / → uxuA | fructuronate transporter/mannonate hydrolase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 4,551,422 | 0 | T | A | 17.2% | 357.0 / 65.6 | 152 | intergenic (‑126/‑214) | gntP/uxuA | fructuronate transporter/mannonate hydrolase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (62/63); new base A (14/12); total (77/75) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.30e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.11e-01 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCC > NC_000913/4551323‑4551520 | gttgttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAt < 1:1371022/100‑1 (MQ=255) gttgttAGTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAt < 1:1216930/100‑1 (MQ=255) gttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTg > 2:1913006/1‑100 (MQ=255) gttATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTg > 2:1063893/1‑100 (MQ=255) aTTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTgcag < 2:2847725/100‑1 (MQ=255) ttttGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTgcagc < 1:3325606/100‑1 (MQ=255) ttttGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTgcagc > 1:283253/1‑100 (MQ=255) ttttGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTgcagc < 1:2059198/100‑1 (MQ=255) taggagaaatgttatgtAAATGGGTCAACCATGGTTGCGATGAATGTTACATCCGCTGATCAATAACCATC‑GATTACACTTTGCTGCAAATTgaagc < 2:3098161/89‑1 (MQ=255) tGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaa < 2:1810318/100‑2 (MQ=255) gggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaag < 1:1149669/100‑3 (MQ=255) gggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaag < 2:2858069/100‑3 (MQ=255) gggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaag < 2:2427940/100‑3 (MQ=255) gggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaag < 1:3494020/100‑3 (MQ=255) gggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaag < 1:2667380/100‑3 (MQ=255) ggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGcaacaa > 1:1767608/1‑100 (MQ=255) ggCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaagg < 1:579079/100‑4 (MQ=255) gCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaaggg < 1:1634675/100‑5 (MQ=255) cGATATGTTATGTAAATTGGTCAACAATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGTTCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGcaacaa > 2:2310575/1‑98 (MQ=255) gATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAAcc < 2:1430778/99‑1 (MQ=255) atatGTTCTGTAGATCGGTCAACCCTTGTTGCGATGCATGTCCCATCCTCTGAGCAAGAACCCTC‑GATTCCCCTTTGCTGCAATTTGCATCAACAAcc < 2:3547862/98‑1 (MQ=255) atatGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCAt < 2:1409606/100‑1 (MQ=255) tatgttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATg > 1:940908/1‑100 (MQ=255) tatgttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAAATTGCAGcaaagggtaat < 1:3610911/100‑9 (MQ=39) gttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATgaga > 2:1712478/1‑100 (MQ=255) gttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATgaga > 2:1134871/1‑100 (MQ=255) ttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGagag < 1:810817/100‑1 (MQ=255) ttatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGagag < 1:189646/100‑1 (MQ=255) tatgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGt > 2:361459/1‑100 (MQ=255) tgtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGa > 1:3288665/1‑100 (MQ=255) gtAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCTTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGaa > 2:1533694/1‑100 (MQ=255) tAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGaaa > 1:1907014/1‑100 (MQ=255) aaTTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAAtt > 1:1969858/1‑100 (MQ=255) ggTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTtg < 2:2639458/100‑1 (MQ=255) gTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTTCCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTtg < 2:2020616/99‑1 (MQ=255) gTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTtgt > 2:1166318/1‑100 (MQ=255) gTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTtgt > 1:608060/1‑100 (MQ=255) cAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGa > 2:1598416/1‑100 (MQ=255) cAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGa > 1:2692034/1‑100 (MQ=255) cAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGa > 1:2357151/1‑100 (MQ=255) aTTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTgg > 1:3566358/1‑100 (MQ=255) ttgttgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGt < 2:2745775/100‑1 (MQ=255) tgttgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGtt > 1:2246149/1‑100 (MQ=255) gttgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTa < 1:1134880/100‑1 (MQ=255) gttgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTa < 2:831101/100‑1 (MQ=255) tgCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAAc < 2:2859924/100‑1 (MQ=255) cGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAAc > 2:1398125/1‑98 (MQ=255) cGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCa > 2:2379871/1‑100 (MQ=255) gATGAATGCCCCATACTCTGGACAATAA‑AATCTGAGTACCCTTTGCTACAATTTGCAGCAACAACCAAGAGAGTAAAATTAACGTGATGTGGAAAACCa > 2:3630767/1‑99 (MQ=255) aaTGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTGACCAATTTc > 2:749920/1‑100 (MQ=255) tGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAg < 1:540405/100‑1 (MQ=255) tGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAg < 1:1718213/100‑1 (MQ=255) tGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAg > 1:1516373/1‑100 (MQ=255) tGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAg < 2:1016145/100‑1 (MQ=255) gTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGa > 1:766366/1‑100 (MQ=255) cacaTCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAg < 2:1350976/97‑1 (MQ=255) cacaTCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAAt > 2:3504192/1‑100 (MQ=255) tCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCgg > 2:2145676/1‑100 (MQ=255) ccTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCggg < 1:2219921/100‑1 (MQ=255) ctctGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGt < 2:1019710/100‑1 (MQ=255) ctctGATCAATAACCAGC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATCCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCggg < 2:1282190/99‑1 (MQ=255) nctGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGtt > 1:3623016/2‑100 (MQ=255) ctGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTg < 2:3013047/100‑1 (MQ=255) ctGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTg < 1:1198741/100‑1 (MQ=255) gATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGAc < 2:638572/100‑1 (MQ=255) gATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGAc > 2:635608/1‑100 (MQ=255) aaTAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGt > 1:2042500/1‑100 (MQ=255) aTAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTc < 1:3176001/100‑1 (MQ=255) tAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATCCTTGTGATGTGGTTAACAAATTTCAGAATACGGGTTGa > 2:3328352/1‑93 (MQ=255) aaCCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCtt < 1:2520154/100‑1 (MQ=255) aaCCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCt < 1:1576330/99‑1 (MQ=255) aCCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTa > 2:1008153/1‑100 (MQ=255) ccATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTAc > 2:1928693/1‑100 (MQ=255) ccATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTAc > 1:2383508/1‑100 (MQ=255) cATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTAcc < 2:50071/100‑1 (MQ=255) aTTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAg < 1:2169452/100‑1 (MQ=255) aTTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAg < 2:2160778/100‑1 (MQ=255) ttACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAgg < 2:3594064/100‑1 (MQ=255) ttACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAgg < 1:301902/100‑1 (MQ=255) atggttgttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaaa > 2:1826777/8‑98 (MQ=39) tACCCTTTGCTGCAATTTGCATCAACAACCATGATAGTGAAATTCTTGTGATGTTGTTAACCAATTTCATAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGt < 2:151081/100‑1 (MQ=255) ggttgttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTa > 1:3044300/6‑100 (MQ=255) ggttgttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTa > 2:1172715/6‑100 (MQ=255) aCCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTa > 2:547578/1‑100 (MQ=255) gttgttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCaaaaag > 2:297768/5‑95 (MQ=255) gttgttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAg > 1:2015031/5‑100 (MQ=255) gttgttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAg > 1:3370248/5‑100 (MQ=255) gccTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAg > 2:2153610/2‑100 (MQ=255) tgttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGaa > 1:2603760/3‑100 (MQ=255) cTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGaa < 2:3288785/100‑1 (MQ=255) tttGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAAc > 1:290791/1‑100 (MQ=255) tttGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAAc < 2:934736/100‑1 (MQ=255) gttGCTGCAAATTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAAc > 1:3005575/2‑100 (MQ=255) ttGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACt < 1:129619/100‑1 (MQ=255) gctgcAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTta > 2:1283548/1‑100 (MQ=255) ctgcAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTtat > 1:1428579/1‑100 (MQ=255) tgcAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTtata > 2:3145702/1‑100 (MQ=255) gcAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATAc < 2:1775845/100‑1 (MQ=255) aaTTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGc < 1:1455812/100‑1 (MQ=255) aTTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGcc < 2:1172413/100‑1 (MQ=255) | GTTGTTATTTTGGGCGATATGTTATGTAAATTGGTCAACCATTGTTGCGATGAATGTCACATCCTCTGATCAATAACCATC‑GATTACCCTTTGCTGCAATTTGCAGCAACAACCATGAGAGTGAAATTCTTGTGATGTGGTTAACCAATTTCAGAATTCGGGTTGACATGTCTTACCAAAAGGTAGAACTTATACGCC > NC_000913/4551323‑4551520 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |