Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,679,430 | Δ1 bp | 15.2% | intergenic (‑63/+34) | yphF ← / ← yphG | putative sugar ABC transporter periplasmic binding protein/DUF4380 domain‑containing TPR repeat protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,679,430 | 0 | G | . | 15.2% | 579.4 / 103.2 | 197 | intergenic (‑63/+34) | yphF/yphG | putative sugar ABC transporter periplasmic binding protein/DUF4380 domain‑containing TPR repeat protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (85/81); new base . (17/13); total (102/95) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.92e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.27e-03 |
Only 100 of 206 total aligned reads displayed.
ATAATAGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGG > NC_000913/2679331‑2679529 | ataataGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAg < 2:2678083/100‑1 (MQ=255) aataGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAgcg > 2:3614395/1‑100 (MQ=255) ataGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAgcgc > 1:490651/1‑100 (MQ=255) ataGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAgcgc > 2:1838821/1‑100 (MQ=255) taGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGcgcg < 1:532887/100‑1 (MQ=255) gATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑Tg > 1:3453855/1‑100 (MQ=255) aTTACGGGTTGTTCTCATTTTTTTTTTTATTTAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGTGCGGCAGCGCG‑TGc > 1:3610/1‑100 (MQ=255) aTTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑Tg > 1:1520212/1‑99 (MQ=255) aTTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGc > 1:2171149/1‑100 (MQ=255) ttACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGTCTCCTGTATGGTTTTTATTAACACCGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGcc < 1:1931297/100‑1 (MQ=255) ttACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGcc < 2:538014/100‑1 (MQ=255) aCGGGTTGTTCTCATTTTTGTAAGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGc < 1:3374571/100‑1 (MQ=255) gttgttCTCATTTTTGTATGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCat < 1:827899/100‑2 (MQ=255) gttgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCaa < 2:4255287/100‑1 (MQ=255) gttgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCat < 1:1194649/100‑2 (MQ=255) ttgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCaaa > 2:4160042/1‑100 (MQ=255) ttgtgCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCaaa < 1:310744/100‑1 (MQ=255) tgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAat > 2:2127661/1‑100 (MQ=255) tgttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatca < 2:2362792/100‑4 (MQ=39) gttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatcac < 2:3345838/100‑5 (MQ=38) gttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatcac < 2:2066954/100‑5 (MQ=38) gttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatcac < 1:4060629/100‑5 (MQ=38) gttCTCATTTTTGTAGGCATAAAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGTCTTATTCTAATTATATTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAata > 1:1660097/1‑100 (MQ=255) ttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatcaca < 2:1476390/100‑6 (MQ=38) ttCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCatcaca < 2:2880378/100‑6 (MQ=38) tctcATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATAtt > 1:1708913/1‑100 (MQ=255) tcATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTAc < 1:2602884/100‑1 (MQ=255) tcATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTAc < 2:1233770/100‑1 (MQ=255) tcATTTTTGTAGGAATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGAAGAGCGGCAGCGCG‑TGCCTCTCAAAGATTAc < 1:855993/100‑1 (MQ=255) cATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACa > 1:3633837/1‑100 (MQ=255) aTTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAg < 2:2033796/100‑1 (MQ=255) aTTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAg < 1:1117545/100‑1 (MQ=255) aTTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAg < 1:1804513/100‑1 (MQ=255) tttttGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATAAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGt > 2:3097767/1‑100 (MQ=255) ttttGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGtt > 2:161075/1‑100 (MQ=255) aGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGAGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAgg > 1:3312386/1‑100 (MQ=255) ngCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAggg > 1:3539489/2‑100 (MQ=255) ggCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAggg < 2:2814539/100‑1 (MQ=255) ggCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAggg > 1:3813301/1‑100 (MQ=255) gCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAGCAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGt < 1:3174422/100‑1 (MQ=255) cATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGtt > 2:3441053/1‑100 (MQ=255) cATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGtt > 2:2275482/1‑100 (MQ=255) tAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTa > 2:908263/1‑100 (MQ=255) tAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCACTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTa > 2:2436628/1‑100 (MQ=255) gCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGa > 1:635538/1‑100 (MQ=255) cctcctGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGan < 1:4366073/100‑2 (MQ=255) cctcctGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGaa < 1:3150294/100‑1 (MQ=255) ctcctGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAAc < 1:2779456/100‑1 (MQ=255) cctGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAAcgc < 2:1344884/100‑1 (MQ=255) gTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGt < 2:939543/100‑1 (MQ=255) gTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGt > 2:823560/1‑100 (MQ=255) gTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCGCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGt < 1:3034922/100‑1 (MQ=255) tAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGtt < 2:3633858/100‑1 (MQ=255) tttttATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTGCAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTaaaaa < 2:1124581/100‑1 (MQ=255) tttttATTAACAACGGCTTATTCTAATTACTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTGCAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTaaaaa < 1:2645865/100‑1 (MQ=255) tttATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATa > 2:794649/1‑100 (MQ=255) tttATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATa < 2:3709911/100‑1 (MQ=255) ttaACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAg > 2:4237999/1‑100 (MQ=255) ttaACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAg < 2:500413/100‑1 (MQ=255) aacaacGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCTCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGc < 1:2255926/100‑1 (MQ=255) acactggCTTATTCTAATGATTTTGTGATGAGCGGCAACGCG‑GGTCGCTGAAATATAACAGTTAATAGTGTTTAGTGAACGCGGTTaaaaa < 1:726741/86‑1 (MQ=255) acaacGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCa > 1:327940/1‑100 (MQ=255) caacGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCAt > 2:4295333/1‑100 (MQ=255) cTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACggt > 2:1035539/1‑100 (MQ=255) ttATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACggtg < 2:2483367/100‑1 (MQ=255) aTTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACggtggt < 2:1737614/100‑1 (MQ=255) ttCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGgtggtg < 2:4344162/100‑1 (MQ=255) ttCTAATTATTTTGGGATTAGCGGCAGCGCT‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGATTAAAAATAAAAGGCATCACggtggt < 1:1676784/99‑1 (MQ=255) tCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGa > 1:3121535/1‑100 (MQ=255) cTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGaa > 1:2415346/1‑100 (MQ=255) tAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGaat < 2:4056552/100‑1 (MQ=255) tAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGaat < 1:3245964/100‑1 (MQ=255) tAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGaat < 2:1315405/100‑1 (MQ=255) attattTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGaataa > 1:1006866/1‑100 (MQ=255) attTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGc > 1:4183390/1‑100 (MQ=255) tatttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCtt > 1:3667250/5‑100 (MQ=38) gtgATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCtt > 1:2923845/1‑100 (MQ=255) atttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCttt > 1:3937529/4‑100 (MQ=39) atttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCttt > 2:3464271/4‑100 (MQ=39) tttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCATTc > 1:1428611/3‑100 (MQ=255) gatgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTc > 1:2205381/1‑100 (MQ=255) gatgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTc > 1:3308726/1‑100 (MQ=255) gatgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTc > 2:302193/1‑100 (MQ=255) ttgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCg > 1:1547337/2‑100 (MQ=255) tgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg < 2:2415357/100‑1 (MQ=255) tgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg < 1:139100/100‑1 (MQ=255) tgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg > 1:3795967/1‑100 (MQ=255) tgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg < 2:3380125/100‑1 (MQ=255) tgaGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCAGCTTTCgg > 1:2578332/1‑100 (MQ=255) tgaGCGGCAGAGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAACAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg < 1:2897156/100‑1 (MQ=255) tgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg > 2:2041427/1‑100 (MQ=255) tgaGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCgg > 1:4206164/1‑100 (MQ=255) aGCGGCA‑CGCGCTGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGcc > 1:1971053/1‑100 (MQ=255) gcagCAGCGCG‑TGCTGATCAAATATTACAGTTAATAGGGTGTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGc < 1:1249988/95‑1 (MQ=255) gCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCa < 2:355569/100‑1 (MQ=255) gCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCa > 2:2616779/1‑100 (MQ=255) cGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCaa < 2:1857177/100‑1 (MQ=255) cAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGcc < 2:3929726/100‑1 (MQ=255) aGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCg > 2:3251961/1‑100 (MQ=255) gcgcG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCgg < 1:962606/100‑1 (MQ=255) | ATAATAGATTACGGGTTGTTCTCATTTTTGTAGGCATAGAGCCTCCTGTAGGGTTTTTATTAACAACGGCTTATTCTAATTATTTTGTGATGAGCGGCAGCGCG‑TGCCGCTCAAATATTACAGTTAATAGGGTTTAGTGAACGCGGTTAAAAATAAAAGGCATCACGGTGGTGAATAATGCCGCTTTCGGCCAAGCCGG > NC_000913/2679331‑2679529 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |