| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1040546 | NA (NA) | 14 (0.100) | 8/158 | NT | NA | noncoding (4/36 nt) | REP89 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP89 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | NC_000913 | = 1040578 | NA (NA) | noncoding (36/36 nt) | REP89 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP89 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
TGGTATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGgcctgatgcg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1040448‑1040546‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAACAAAATG < NC_000913/1040578‑1040471 TGGTATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGG > 2:2587522/1‑100 GGTATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGC > 1:4149239/1‑100 GTATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCC < 2:3320768/100‑1 GTATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCCCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGC < 2:1433304/99‑1 TATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCT > 2:2826877/1‑100 ATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTG > 2:1235995/1‑100 ATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTG > 2:886552/1‑100 ATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTG > 2:3804099/1‑100 TTTACTTTGGTTCGTCGGCATTATGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGA > 1:2555667/1‑100 TACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATG > 1:1648870/1‑100 TACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATG < 1:629614/100‑1 TACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATG < 2:2547149/100‑1 TACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATG < 2:1437842/100‑1 ACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGC > 2:1877208/1‑100 ACTTTGGTTCGTCGGCATATTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCACGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATG > 1:2106850/1‑99 TTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATC < 1:1510130/100‑1 TGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCA < 2:3223457/100‑1 GTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAG < 2:3675855/100‑1 GTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAG < 1:629747/100‑1 TTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGG < 1:1325810/100‑1 TTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGG < 2:4251808/100‑1 TTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTCGGTATGGTTGGACCCGCGTCTTAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGG < 1:3517344/100‑1 TGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGC < 1:3661583/100‑1 TGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGG < 1:2619071/99‑1 GATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGC < 1:671444/99‑1 GATGTGTTCGCGCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGG < 1:2388232/98‑1 TCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAAC < 2:3498090/100‑1 CACACTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTT < 1:4199474/100‑1 TGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGGCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTC < 1:2626839/97‑1 GCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCA < 1:247318/100‑1 CCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAA < 2:3023721/100‑1 CTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAAC > 2:1430243/1‑100 CTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAAC > 1:4207244/1‑100 TGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGACCAGCCATACAAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAACAAA < 1:1000899/99‑1 GCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTCACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAACAAAAT < 2:3092585/100‑1 CGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAACAAAATG > 1:2323931/1‑100 CGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAACAAAATG > 2:4114404/1‑100 CGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAACAAAATG > 2:2317604/1‑100 TGGTATTTACTTTGGTTCGTCGGCATTTTGTTGATGTGTTCGCTCTCCACCCTTGTGTTGGTATGGCTGGACCCGCGTCTGAAAAGTTAACGAACGTAGgcctgatgcg‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1040448‑1040546‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GCCTGATGCGATGCTAATGCGCCGCATCAGGCCTACGTTCGTTAACTTTTCAGACGCGGGTCCAGCCATACCAACACAAGGGTGGAGAGCGAACACATCAACAAAATG < NC_000913/1040578‑1040471 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |