| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3621988 | NA (NA) | 7 (0.050) | 4/162 | NT | NA | coding (2797/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 3622011 | NA (NA) | coding (2820/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
CCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGACG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/3621882‑3621988‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccgtgacgGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCAGGCGGTT < NC_000913/3622011‑3621913 CCGCCTCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCC < 2:2034459/100‑1CCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCC > 2:3410400/1‑100CCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCAGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCC > 1:2707340/1‑100 CGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCC > 1:3466063/1‑100 CGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCC > 1:1560074/1‑100 CGCATCCCGTATGCCACAGACCCAGCCGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACACGGACAGCACCCACAGCATGTCGCCGGATAACCGTATCGCCC > 1:1225796/1‑100 CGCATCCCGTATGCAACAGACCCGGCAGGTAACCGACTGCCCGACCCGGAGCTGCACGCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCC > 1:1030545/1‑99 GCACCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCG < 2:1114214/100‑1 CATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 2:3147713/100‑1 CATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 2:1565067/100‑1 CATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 1:3374536/100‑1 CATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 1:334814/100‑1 CATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 2:2276258/100‑1 CATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 2:2907752/100‑1 CATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT > 2:2841191/1‑100 ATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 1:1925027/99‑1 ATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACACCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 1:2342566/99‑1 TCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATTTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTG < 2:2761396/99‑1 TCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGTATAACCTTATCGCCCGTGA > 1:1462809/1‑100 TCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGA > 1:3985193/1‑100 TCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTG < 2:2809868/99‑1 CCCGTATGCCACAGGCCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCGCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGT < 1:1826408/97‑1 CCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGAC > 2:2514279/1‑100 CCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGAC < 2:2145239/100‑1 CCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGAC > 2:1624023/1‑100 CCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGAC > 2:431810/1‑100 CCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGA < 1:3434597/99‑1 CCCGTATACCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCGCAGCATGTGGCCGGATAACCGTATCGCCCGTGAC > 1:2311783/1‑100 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CCGTGACGGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCA > 2:1813991/1‑100 CCGTGACGGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGC > 2:1219093/1‑99 CGTGAGGGTCGTAGCGGGAAAGATGGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCAG < 1:2730938/100‑1 CGTGACGGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCAG > 2:98695/1‑100 CGTGACGGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCAG < 2:2905955/100‑1 CGTGACGGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGATGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCA > 1:3208193/1‑99 gttACGGTCATACCGCTAAAGATAGTGCGCGTAACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCAGG < 1:831179/97‑1 GTGACGGTCATACCGGTAAAGATGCGGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCGGAGGGTGCTGTCCGGGTGGAGCTCCGGGTCGGGCAGG < 1:86010/100‑1 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NC_000913/3621882‑3621988‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccgtgacgGTCATACCGGTAAAGATAGTGCGCGTCACGGGCGATACGGTTATCCGGCCACATGCTGAGGGTGCTGTCCGGGTGCAGCTCCGGGTCGGGCAGGCGGTT < NC_000913/3622011‑3621913 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |