| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 377335 = | NA (NA) | 25 (0.170) | 10/164 | NT | NA | noncoding (1/187 nt) | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 377368 = | NA (NA) | noncoding (34/187 nt) | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | |||||
Only 100 of 274 total aligned reads displayed.
CGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCAT > NC_000913/377236‑377434 | cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATg < 2:835966/100‑1 (MQ=255)cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATg < 2:2786165/100‑1 (MQ=255)cgcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGACTGATGATTTGGTGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATg > 2:4011347/1‑100 (MQ=255) gcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGc > 1:754524/1‑100 (MQ=255) gcgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGc > 2:3489913/1‑100 (MQ=255) ctgataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGc < 2:2292190‑M1/2‑1 (MQ=255) tgataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgagcgccttatccggtctacacttcgcccgtaaaccgtagGcc < 1:4127515‑M1/3‑1 (MQ=255) tgataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGcc > 2:588466‑M1/98‑100 (MQ=255) cgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGcc < 2:753187/100‑1 (MQ=255) cgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGcc < 1:1375481/100‑1 (MQ=255) cgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATATGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGcc < 1:2346924/100‑1 (MQ=255) gcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTTATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCt < 2:3069782/100‑1 (MQ=255) gataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCt > 2:2462047‑M1/97‑100 (MQ=255) cTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTg < 2:2588918/100‑1 (MQ=255) cTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTg < 2:389748/100‑1 (MQ=255) ataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTg > 2:3640367‑M1/96‑100 (MQ=255) ataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTg > 2:1975267‑M1/96‑100 (MQ=255) tCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGa < 2:1910176/100‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGa < 2:683107/100‑1 (MQ=255) cAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGAt > 1:1219986/1‑100 (MQ=255) aGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATg < 2:4256660/100‑1 (MQ=255) gcgcCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGc < 2:2708130/100‑1 (MQ=255) gcCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGa > 1:630325/1‑100 (MQ=255) gcgcaaagcgtcgcatcaggcagtgcgcacgactgccggatgcggcgtgatcgccttatccgggctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGAt > 1:159395‑M1/89‑95 (MQ=255) gAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGc > 2:4208166/1‑100 (MQ=255) gCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgc < 1:87539/100‑1 (MQ=255) cAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgcg < 2:2818805/100‑1 (MQ=255) aGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgcgc > 2:448603/1‑100 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg < 2:1564376/100‑1 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg > 2:1837522/1‑100 (MQ=255) aaGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa > 2:1182068/1‑100 (MQ=255) aaGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa > 2:1790993/1‑100 (MQ=255) aGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt > 2:1652774/1‑100 (MQ=255) aGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt > 2:2551148/1‑100 (MQ=255) gacgacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATc < 1:1462986/100‑1 (MQ=255) gacgacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATc < 2:2336159/100‑1 (MQ=255) gacgacCCGTATGACGACTTCAACGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATGGACAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCCTATc > 1:2715758/1‑100 (MQ=38) ggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATAAGACGCTATGCGCGTCTTATCa > 1:3678755‑M1/71‑100 (MQ=255) gacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAgg < 2:2060085/100‑1 (MQ=255) ataatagcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacacttcgcccgtaagccgtagGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAgg > 1:1192203‑M1/69‑100 (MQ=255) atggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:2928727‑M1/68‑100 (MQ=255) acCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:416856/1‑100 (MQ=255) acCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 2:3260698/1‑100 (MQ=255) acCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:2142491/1‑100 (MQ=255) acCCGTATGCCGACTTCAAAATGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATCGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTAACCAgac > 1:3731008/1‑98 (MQ=38) cccGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATGAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc < 1:2915570/100‑1 (MQ=255) aatagcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacacttcgcccgtaagccgtagGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAGGcc > 2:1313981‑M1/67‑100 (MQ=255) ggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAgg > 1:2505959‑M1/66‑97 (MQ=255) ccGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCt > 2:1388127/1‑100 (MQ=255) gcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:3523939‑M1/63‑95 (MQ=255) aTGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACgg < 2:3455760/100‑1 (MQ=255) tGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTATACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGt < 2:3094100/100‑1 (MQ=255) gCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt < 2:4127543/100‑1 (MQ=255) gCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 2:3847138/1‑100 (MQ=255) ccGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGttt < 2:3935623/100‑1 (MQ=255) cGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTa < 1:240580/100‑1 (MQ=255) aCTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATg < 2:1464235/100‑1 (MQ=255) aCTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATg < 1:4027653/100‑1 (MQ=255) cTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATgg > 1:2667095/1‑100 (MQ=255) cTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATgg > 1:1239346/1‑100 (MQ=255) tCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGc > 1:1801206/1‑100 (MQ=255) cggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGc > 2:1245303‑M1/53‑100 (MQ=255) cAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGc < 1:1967883/99‑1 (MQ=255) cAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCg < 2:340955/100‑1 (MQ=255) aGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAg < 1:894132/100‑1 (MQ=255) gTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAgt < 2:3785129/100‑1 (MQ=255) atgatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGAcc < 1:4222943/100‑1 (MQ=255) gatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCgg < 1:3358911/100‑1 (MQ=255) gatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCgg < 2:2220079/100‑1 (MQ=255) tttGATGTGGTAAACCTAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGAt < 2:4340092/100‑1 (MQ=255) tGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATaa > 1:1096972/1‑100 (MQ=255) aTGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAgg < 2:3160914/100‑1 (MQ=255) aTGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGAAGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGACGCGTAGACCGGATCAgg > 1:2618914/1‑100 (MQ=25) tctgGTAAACATAGATAAGCCGTGCGCAGATGCCTGGTGCGACGCTAGGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAgg < 1:3317580/97‑1 (MQ=21) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATTAGGCg > 1:1744337/1‑100 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCg > 1:3574747/1‑98 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGtt > 1:2766256/1‑100 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGt > 1:726609/1‑99 (MQ=255) aaaCATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGTTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAc < 1:1545402/100‑1 (MQ=255) aaaCATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGCTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAc > 1:426052/1‑100 (MQ=255) aaCATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcg > 2:328904/1‑100 (MQ=255) aaCATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcg < 2:2142499/100‑1 (MQ=255) aCATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgc > 1:1024635/1‑100 (MQ=255) cctAGATAAGTCGCGCGCAGATGCCTGATGCCACGCTATGCGGGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgcc > 2:2972156/3‑100 (MQ=21) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGGTATGCGCGTCTTATCAGGCCGACGGTTTAGGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 1:4395135/100‑1 (MQ=255) aTAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccg < 2:3851644/100‑1 (MQ=255) aaGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCg < 2:4252180/100‑1 (MQ=255) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 2:2882508/1‑100 (MQ=255) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 1:1053115/1‑100 (MQ=255) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc < 2:2121436/100‑1 (MQ=255) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 2:4060229/1‑100 (MQ=255) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 1:3898974/1‑100 (MQ=255) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 1:3293400/1‑100 (MQ=255) cGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAg > 2:3529399/1‑100 (MQ=255) gcAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTg > 1:3112836/1‑100 (MQ=255) aGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTgcg < 2:2514566/100‑1 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGcc < 1:2058512/100‑1 (MQ=255) aTGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGcc < 1:1436958/100‑1 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGcc < 1:4334103/99‑1 (MQ=255) tGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCa > 2:2052272/1‑100 (MQ=255) | CGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCAT > NC_000913/377236‑377434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |