| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 730068 = | 30 (0.190) | 11 (0.070) | 7/168 | NT | 28.0% | coding (486/4194 nt) | rhsC | Rhs protein with putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | 3619655 = | NA (NA) | coding (464/4236 nt) | rhsB | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
TGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > NC_000913/729969‑730167 | aaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccag < 1:1190385‑M1/1‑1 (MQ=255)aaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccag > 2:1083961‑M1/100‑100 (MQ=255)aaccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccag > 1:2531675‑M1/100‑100 (MQ=255) accgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGc < 2:1645488‑M1/2‑1 (MQ=255) ccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGcc > 2:704120‑M1/98‑100 (MQ=255) ccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGcc > 2:1605534‑M1/98‑100 (MQ=255) ccgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGcc < 1:1569714‑M1/3‑1 (MQ=255) cgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagtttttccggcagcgcttgctagagtgcggccaGCCg < 1:2368171‑M1/4‑1 (MQ=255) cgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGc < 2:928888‑M1/2‑1 (MQ=255) cgagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCg > 1:3042392‑M1/97‑100 (MQ=255) cgagcagccaccacggcccctgcggactgtgtgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGcc > 1:631249‑M1/97‑99 (MQ=255) gagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg > 1:1751306‑M1/96‑100 (MQ=255) gagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg > 2:1966711‑M1/96‑100 (MQ=255) gagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg < 1:783023‑M1/5‑1 (MQ=255) gagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg > 1:156085‑M1/96‑100 (MQ=255) gagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg > 1:4097213‑M1/96‑100 (MQ=255) gagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg > 1:2791086‑M1/96‑100 (MQ=255) gagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg > 2:480949‑M1/96‑100 (MQ=255) gagcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg > 1:3236160‑M1/96‑100 (MQ=255) gagcagcaaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCgg < 1:3099366‑M1/5‑1 (MQ=255) gcagccaccacggcccctgcggactgtttgtcgccagataacgatgcggacttaagcggagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGccgggg > 2:3703053‑M1/94‑98 (MQ=255) gagttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCgtggt < 2:3742945‑M1/65‑1 (MQ=255) ttcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgc < 1:2009749‑M1/68‑1 (MQ=255) tcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgct < 2:2928986‑M1/69‑1 (MQ=255) tcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgct < 1:100141‑M1/69‑1 (MQ=255) tcttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgct < 2:2097636‑M1/69‑1 (MQ=255) tcttccggcagcgcctgccagagtgcggcc‑‑‑GGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTc < 2:694660‑M1/70‑1 (MQ=255) ttccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgctgc < 2:3304458‑M1/71‑1 (MQ=255) tccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgctgct < 2:916735‑M1/72‑1 (MQ=255) tccggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGgctg < 2:29632‑M1/70‑1 (MQ=255) cggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCg < 2:2541196‑M1/74‑1 (MQ=255) ggcagcgcctgccagagtgcggccaGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGgtggctgcccg < 1:111130‑M1/74‑4 (MQ=255) gCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGc > 2:2461384/1‑100 (MQ=11) cTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCt < 2:1383590/100‑1 (MQ=31) tGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTg > 1:1000414/1‑100 (MQ=32) ggCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTgg > 1:1873947/1‑100 (MQ=33) ggCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTgg < 2:4273610/100‑1 (MQ=32) gCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTgg < 1:3617226/99‑1 (MQ=32) gCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTgg > 1:3188952/1‑99 (MQ=33) gCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgt > 1:1338680/1‑100 (MQ=33) gCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgt > 2:3914234/1‑100 (MQ=33) gCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgt > 2:3272869/1‑100 (MQ=33) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg > 2:2747848/1‑100 (MQ=32) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg > 2:2780594/1‑100 (MQ=33) ccGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtg > 2:3735882/1‑100 (MQ=32) cGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGgtgt > 2:3110510/1‑100 (MQ=33) gCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACCCCGCTGAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGtgtg < 1:4380644/100‑1 (MQ=16) cACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGa > 2:287394/1‑100 (MQ=33) aCTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAg < 2:3212758/100‑1 (MQ=33) aCTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACGCCGCTTAAGTCCGCAGCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAg < 1:1482547/100‑1 (MQ=12) ttccggcagcgcctGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGc < 2:2273427‑M1/86‑1 (MQ=255) ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGtgtg < 1:4380918/97‑1 (MQ=33) ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGc > 1:92961/1‑100 (MQ=33) ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGc > 2:2225007/1‑100 (MQ=33) ctctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTAGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGc > 1:183099/1‑100 (MQ=17) tctGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCg < 2:4367216/100‑1 (MQ=33) ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGt > 2:3397727/1‑100 (MQ=33) ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGt > 2:2648656/1‑100 (MQ=33) ggCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGt > 2:1754440/1‑100 (MQ=33) gCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGGGAGCGGGTg > 1:3269415/1‑100 (MQ=17) aGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGcc > 1:4251588/1‑100 (MQ=33) aGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGcc < 2:908077/100‑1 (MQ=33) ggCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCg > 2:4094557/1‑100 (MQ=33) gcgcTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCg < 1:1166872/99‑1 (MQ=32) cgcTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGa < 1:2144722/100‑1 (MQ=33) cTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAg > 1:64024/1‑100 (MQ=32) cTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAg < 2:696349/100‑1 (MQ=33) GCCGGAAGAGCTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCg > 2:1368248‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCg > 1:3601330‑M1/1‑100 (MQ=255) GCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCg < 2:3285730‑M1/100‑1 (MQ=255) | TGAGGACGGTTACAGCCGCAGCGAGTCACTGTGGCTGGTGCGCGGCGGCGTGGCGAAACTGGATGAAGGTCACCGGCTGGCCGCACTCTGGCAGGCGCTGCCGGAAGAACTCCGCTTAAGTCCGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGCTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > NC_000913/729969‑730167 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |