| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,215,179 | Δ4 bp | 100% | coding (900‑903/930 nt) | metA → | homoserine O‑transsuccinylase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4215178 | 3 (0.020) | 172 (1.100) | 103/176 | NT | 98.3% | coding (899/930 nt) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
| ? | NC_000913 | 4215183 = | 3 (0.020) | coding (904/930 nt) | metA | homoserine O‑transsuccinylase | |||||
Only 100 of 205 total aligned reads displayed.
CCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCC > NC_000913/4215084‑4215282 | tgatccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgac > 2:2792166‑M2/100‑100 (MQ=255) gatccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgacg > 1:511451‑M2/99‑100 (MQ=255) gatccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgacg > 1:291768‑M2/99‑100 (MQ=255) tccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGc < 1:1003114‑M2/4‑1 (MQ=255) tccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGc > 2:643553‑M2/97‑100 (MQ=255) tccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGc < 2:633452‑M2/4‑1 (MQ=255) ccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGca > 2:3442233‑M2/96‑100 (MQ=255) ccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGca > 2:3345340‑M2/96‑100 (MQ=255) cgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGcac < 1:4027596‑M2/6‑1 (MQ=255) cgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGcac < 1:677989‑M2/6‑1 (MQ=255) cgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGcac < 2:2154529‑M2/6‑1 (MQ=255) cgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGcac > 2:150138‑M2/95‑100 (MQ=255) aaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATg < 2:3237657‑M2/9‑1 (MQ=255) aatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGaa < 1:991962‑M2/11‑1 (MQ=255) tacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATc < 2:3988387‑M2/13‑1 (MQ=255) tacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATc < 2:1539831‑M2/13‑1 (MQ=255) acaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATcc < 2:233717‑M2/14‑1 (MQ=255) ccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAAc > 2:836132‑M2/84‑100 (MQ=255) ccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAAc > 1:2374890‑M2/84‑100 (MQ=255) gcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGc < 1:516255‑M2/19‑1 (MQ=255) gagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTg < 1:2453322‑M2/21‑1 (MQ=255) gagcTGGTGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTATGACTACAAAATCAATCCATACG‑TCT‑‑‑GCACATGAATCCAACGCTGGAtt < 1:3285877/100‑1 (MQ=255) agcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTgg > 2:535759‑M2/79‑100 (MQ=255) cgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGAt < 2:2823152‑M2/24‑1 (MQ=255) cgagctggcgtagtaacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGAt > 2:4317726‑M2/77‑100 (MQ=255) gagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGAtt < 1:4081776‑M2/25‑1 (MQ=255) ctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAt < 1:1970152‑M2/28‑1 (MQ=255) ctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactgcctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTaa < 1:2981193‑M2/27‑1 (MQ=255) ggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtct > 2:1116549‑M2/71‑100 (MQ=255) cgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTTGATTAAtcttc > 1:1397945‑M2/69‑100 (MQ=255) cgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtcttc > 2:3569989‑M2/69‑100 (MQ=255) agtcacggtaatttactgttgaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGATGGATTAATCTTCtgt > 1:2564141‑M2/66‑100 (MQ=255) gtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgtg < 1:2949464‑M2/36‑1 (MQ=255) tcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGa < 1:1990562‑M2/37‑1 (MQ=255) cggtagtttactgtttactaactgactcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAg > 1:1535212‑M2/61‑100 (MQ=255) cggtagtttactgtttaccaactggctcaactcttacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACCTGAAACCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATa > 1:564737‑M2/61‑99 (MQ=255) cggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAg > 2:2905916‑M2/61‑100 (MQ=255) cggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAg > 2:2645728‑M2/61‑100 (MQ=255) gtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTc > 1:3887633‑M2/59‑100 (MQ=255) gtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTc < 1:1722022‑M2/42‑1 (MQ=255) gtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTc < 2:3810983‑M2/42‑1 (MQ=255) taatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCg > 2:464789‑M2/58‑100 (MQ=255) atttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCATCTGTGATAGTCGAt > 2:4341660‑M2/56‑100 (MQ=255) atttactgtttaccaactggctcaactagtacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGAt < 1:3169121‑M2/45‑1 (MQ=255) tttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATc < 1:882340‑M2/46‑1 (MQ=255) tactgtttaccaactggctaaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGCCACATGAATCCAAAGCTGAAATACTCTTCTGTGATAGTCGATCGt > 1:3549156‑M2/53‑100 (MQ=255) actgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGtt < 2:326937‑M2/49‑1 (MQ=255) gtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGttacg > 2:2271771‑M2/49‑98 (MQ=255) 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catacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCttttt > 1:3983971‑M2/8‑100 (MQ=255) atacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCtttttt < 1:4217569‑M2/94‑1 (MQ=255) tacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTa > 1:3565299‑M2/6‑100 (MQ=255) tacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTa < 2:4242971‑M2/95‑1 (MQ=255) tacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTa > 1:1773872‑M2/6‑100 (MQ=255) tacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTa > 2:2328177‑M2/6‑100 (MQ=255) cgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTAtt > 1:1459519‑M2/4‑100 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |