| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 526005 | NA (NA) | 16 (0.110) | 9/168 | NT | 100% | coding (2745/4281 nt) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | NC_000913 | = 526027 | 0 (0.000) | coding (2767/4281 nt) | rhsD | Rhs protein with DUF4329 family putative toxin domain; putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
TACAGCGCCACGGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGATAACCGCATCGCGGAGGATGCGCACTATGTCTACCGCCACGATGAATACGGCAGGC > NC_000913/525928‑526126 | tACAGCGCCACGGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGG > 1:1286161‑M2/1‑100 (MQ=255)tACAGCGCCACGGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGG < 2:770313‑M2/100‑1 (MQ=255)tACAGCGCCACGGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGG < 2:770220‑M2/100‑1 (MQ=255)tACAGCGCCACGGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGG > 1:1679651‑M2/1‑100 (MQ=255)tACAGCGCCACGGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGG < 1:1296080‑M2/100‑1 (MQ=255) aCAGCGCCACGGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCCGCCGG < 1:2750802‑M2/99‑1 (MQ=255) gggCAGGCTGGAGAGTCTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtgg > 1:3698746‑M2/1‑89 (MQ=255) cgcACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACCGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacggggtgcggctgtcccg < 1:774216‑M2/100‑31 (MQ=255) gACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcac < 1:1417335‑M2/100‑52 (MQ=255) cccGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGacccgtggcatacggaatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcc < 1:441909‑M2/100‑63 (MQ=255) gCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgt < 2:2259275‑M2/100‑70 (MQ=255) ccACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtg < 2:3696447‑M2/100‑71 (MQ=255) ccACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtg < 2:3149326‑M2/100‑71 (MQ=255) ccACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtg < 1:698612‑M2/100‑71 (MQ=255) ccACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGacccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtg < 1:1003438‑M2/100‑71 (MQ=255) cGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcg < 1:1709586‑M2/100‑74 (MQ=255) cccGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgt < 1:4217735‑M2/100‑78 (MQ=255) cccGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgt < 1:34605‑M2/100‑78 (MQ=255) cccGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgt < 2:2539088‑M2/100‑78 (MQ=255) cccGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgt < 2:694384‑M2/100‑78 (MQ=255) cccGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgagcaccctctccagcctgcccgtggcgcggt < 1:2760439‑M2/100‑78 (MQ=255) ccGGCGGGCAACCGGCTGCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgta < 1:3373111‑M2/100‑79 (MQ=255) gCCGGgtccgttgcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtc > 2:3415495‑M2/1‑5 (MQ=255) gCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtct < 1:2050741‑M2/100‑96 (MQ=255) gCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtct < 2:588825‑M2/100‑96 (MQ=255) gCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcg > 1:3876418‑M2/1‑5 (MQ=255) gCCGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtacaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtct > 1:2959494‑M2/1‑5 (MQ=255) ccGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtctg < 1:1520203‑M2/100‑97 (MQ=255) ccGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtctg > 2:718220‑M2/1‑4 (MQ=255) cGGgtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtctgt > 2:2706928‑M2/1‑3 (MQ=255) gggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtctgtc > 2:461013‑M2/1‑2 (MQ=255) gggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtctgtc < 2:3257872‑M2/100‑99 (MQ=255) gggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtctgtc < 1:1637960‑M2/100‑99 (MQ=255) ggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggtgcgagggtgcgcacactctccagcctgcccgtggcgctgtagccgtattcccgcgtctgtcg > 2:4294226‑M2/1‑1 (MQ=255) ggtccgtggcatacgggatgcggatgtccaggtctggggcgagggtgcgcacacgctccagcctgcccgtggcgcggtagccgtattcccgcgtc < 2:1366156‑M2/95‑95 (MQ=255) | TACAGCGCCACGGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGCGGGCAACCGGCTGCCGGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGTACACTCACAGTGTGGCCGGATAACCGCATCGCGGAGGATGCGCACTATGTCTACCGCCACGATGAATACGGCAGGC > NC_000913/525928‑526126 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |