| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,579,569 | T→C | 16.1% | intergenic (‑227/+64) | yddA ← / ← ydeM | putative multidrug ABC transporter permease/ATPase/putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,579,569 | 0 | T | C | 16.1% | 364.9 / 56.5 | 160 | intergenic (‑227/+64) | yddA/ydeM | putative multidrug ABC transporter permease/ATPase/putative YdeN‑specific sulfatase‑maturating enzyme |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (61/73); new base C (14/12); total (75/85) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.21e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.18e-01 | |||||||||||
Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
TATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCAT > NC_000913/1579470‑1579665 | tATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAAttt > 1:1019793/1‑100 (MQ=255)tATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAAttt > 2:3008030/1‑100 (MQ=255) tGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATg < 1:1802103/100‑1 (MQ=255) tGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATg < 1:1720687/100‑1 (MQ=255) gagaaTCAAGGATATTGCTAATGCCCGGATGCATACCACGTAATCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGt > 1:4179283/4‑100 (MQ=255) gATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGt > 1:1889616/1‑100 (MQ=255) aTAACCAAGGATAGTGCTAATGCGCTGATTCATACCACATAAGCCAGGATTTTAGCAAGGGTAGGGGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTAt < 1:3167691/97‑1 (MQ=255) aTCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAGGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCggg > 2:1172701/1‑100 (MQ=255) aTCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCggg < 1:4335713/100‑1 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGt < 2:947489/100‑1 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGt < 1:1754840/100‑1 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGt < 2:1645295/100‑1 (MQ=255) tCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGt < 1:1224811/100‑1 (MQ=255) cAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTg > 2:3501661/1‑100 (MQ=255) aaGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGTATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTg < 1:916729/99‑1 (MQ=38) aGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGcc < 2:491393/100‑1 (MQ=255) ggATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCt > 1:563317/1‑100 (MQ=255) atatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTACCTTg < 1:3587024/100‑1 (MQ=255) tatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGt > 2:1373168/1‑100 (MQ=255) tatTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGt < 2:4029375/100‑1 (MQ=255) atTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAATGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGtt < 1:3187328/100‑1 (MQ=255) ttGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAGCACCCGACATAAATTCCTGTCGGGTgtttcgtca < 2:2705889/100‑9 (MQ=25) ttGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTa < 1:2263036/100‑1 (MQ=255) cTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAgg < 1:1523218/100‑1 (MQ=255) tAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGt < 1:3293018/100‑1 (MQ=255) aaTGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTc > 2:2903923/1‑100 (MQ=255) aTGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTc < 2:1391972/99‑1 (MQ=255) aTGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCa < 2:2140526/100‑1 (MQ=255) tGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCAt < 2:2794719/100‑1 (MQ=255) gCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATa < 1:941133/100‑1 (MQ=255) cccTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaa > 2:3690681/1‑100 (MQ=255) tGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGCAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaagaa > 1:3711361/1‑100 (MQ=255) gATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATaagaag < 2:270405/100‑1 (MQ=255) aTGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAagg < 2:426098/100‑1 (MQ=255) aTGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAagg < 2:4131649/100‑1 (MQ=255) aTGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAagg < 2:3605552/100‑1 (MQ=255) cATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAGGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAaggagg < 1:1172696/100‑1 (MQ=255) aTACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGc < 2:1846505/100‑1 (MQ=255) tACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCt > 1:1932547/1‑100 (MQ=255) aCCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTa > 2:1700002/1‑100 (MQ=255) gTAAGCCAGGAGTTTCGCAAGAGATGAGGCTGATGACTAAATACCCGACAAAAAGTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAATAAGGAGGCTAAGaa < 1:3527428/99‑1 (MQ=255) tAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATg < 1:1558896/100‑1 (MQ=255) gCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAg < 1:995505/100‑1 (MQ=255) gCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCGTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAg < 2:1081998/100‑1 (MQ=255) ccAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTCAGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGCAGt > 1:4171020/1‑100 (MQ=255) ccAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGt > 2:1535269/1‑100 (MQ=255) ccAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGt > 1:4019508/1‑100 (MQ=255) gATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTaaa < 2:3291529/100‑1 (MQ=255) tttCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAaga < 2:2242376/100‑1 (MQ=255) ttCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagag > 2:2530345/1‑100 (MQ=255) tCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagaga < 2:487224/100‑1 (MQ=255) tCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagag < 1:1439910/99‑1 (MQ=255) cGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagagag > 2:4320062/1‑100 (MQ=255) cGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagagag < 2:2697586/100‑1 (MQ=255) cGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagagag > 1:4258217/1‑100 (MQ=255) gCAAGGGGAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGc > 1:4124586/1‑100 (MQ=255) gCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAagagaac > 1:707987/1‑98 (MQ=255) gCAAGGGAAGATGATGATGACGAAAAACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTAGTTAAGGTCCTAAGAAGTAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGc > 1:1015915/1‑100 (MQ=255) cAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCg > 2:3573436/1‑100 (MQ=255) aGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGtt > 1:3549143/1‑100 (MQ=255) gggAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGtta < 1:3573417/100‑1 (MQ=255) ggAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGttat > 2:11821/1‑100 (MQ=255) gAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGttatt < 2:2000596/100‑1 (MQ=255) gAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGttatt < 2:634120/100‑1 (MQ=255) gatgatgatGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaat < 1:845101/100‑1 (MQ=255) gatgatgatGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaat < 1:4055092/100‑1 (MQ=255) gatgatgatGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaan < 2:3922355/100‑2 (MQ=255) atgatgatgACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatt < 1:4031858/100‑1 (MQ=255) tgatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTattaatta > 2:1124875/1‑100 (MQ=255) gatgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAattat > 2:2837990/1‑100 (MQ=255) atgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAattatt < 2:3959257/100‑1 (MQ=255) tgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATtc < 2:3770741/100‑1 (MQ=255) tgatgaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATtc > 2:331404/1‑100 (MQ=255) gaCGAAACACCCGACAGGAATTTCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCa > 1:2040981/1‑100 (MQ=255) gaCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCa > 2:2754285/1‑100 (MQ=255) aCGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCAt > 1:3357206/1‑100 (MQ=255) cGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCAtt > 2:4034694/1‑100 (MQ=255) aaaCACCCTACAGGAATTTATGTCGGGTGCCGTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCAtt < 1:1422281/98‑1 (MQ=255) aaaCACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTg < 2:3151625/100‑1 (MQ=255) aaCACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGt < 1:331403/100‑1 (MQ=255) acacCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGtt < 2:4229606/100‑1 (MQ=255) acacCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGtt < 2:3119241/100‑1 (MQ=255) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTACGGCCATAAGAAGGAGGATAAGACTGGAGTTAAAAGCGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGt > 1:2409201/1‑98 (MQ=25) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 1:1134056/1‑100 (MQ=38) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 1:2428963/1‑100 (MQ=38) cacCCGACATAAATTCCTGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 1:952075/1‑100 (MQ=38) cacCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt < 2:1034190/100‑1 (MQ=255) cacCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGttt > 2:3215008/1‑100 (MQ=255) acCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGtttt < 2:509540/100‑1 (MQ=255) acCCGACACGAATTTATGTCGGGCGCCTTGTTAAGGCCCTAAGAAGGAGGGTAAGAATGGATTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTCTTCTCCATTTGtttt > 1:4118852/1‑100 (MQ=255) cccGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTg > 1:2775911/1‑100 (MQ=255) ccGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGc < 1:1627682/100‑1 (MQ=255) cGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCa < 2:4382115/100‑1 (MQ=255) cGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCa < 2:1840604/100‑1 (MQ=255) cAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACa > 2:3359914/1‑100 (MQ=255) cAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACa < 1:1646810/100‑1 (MQ=255) cAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACa > 2:918218/1‑100 (MQ=255) ggAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATc > 2:3004671/1‑100 (MQ=255) ggAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATc > 2:837152/1‑100 (MQ=255) aaTTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCa > 2:2702546/1‑100 (MQ=255) | TATTGATAATCAAGGATATTGCTAATGCCCTGATGCATACCACGTAAGCCAGGATTTTCGCAAGGGAAGATGATGATGACGAAACACCCGACAGGAATTTATGTCGGGTGCCTTGTTAAGGTCATAAGAAGGAGGCTAAGAATGGAGTTAAAAGAGAGCGTTATTAATTATTCTCCATTTGTTTTGCAACATCCAT > NC_000913/1579470‑1579665 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |