| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,089,854 | A→T | 17.2% | intergenic (‑141/‑142) | yefM ← / → hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,089,854 | 0 | A | T | 17.2% | 329.5 / 55.7 | 140 | intergenic (‑141/‑142) | yefM/hisL | antitoxin of the YoeB‑YefM toxin‑antitoxin system/his operon leader peptide |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (51/64); new base T (8/16); total (60/80) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.70e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTT > NC_000913/2089756‑2089952 | taattaaCTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAAGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTc > 1:1531556/1‑100 (MQ=255) aaCTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTATTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGtcttct > 1:3596698/1‑99 (MQ=255) cttccgatctaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTa < 2:3280676/91‑1 (MQ=255) cTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAg < 1:4256807/100‑1 (MQ=255) cTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAg < 2:1207547/100‑1 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCTAGGTTTCGCTATTTTTGGTGCTATCAGATAAGAGGACAGTCCTCTTAGc > 1:4360493/1‑100 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGc < 2:56557/100‑1 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGc < 1:3527764/100‑1 (MQ=255) tatttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGc < 1:81796/100‑1 (MQ=255) atttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGct < 2:3349479/100‑2 (MQ=255) atttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGct < 2:2462105/100‑2 (MQ=255) atttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGct < 2:2633586/100‑2 (MQ=255) atttattAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCACTTAGct < 2:2315948/100‑2 (MQ=255) atttaatAATTAGTTTGTAGAGCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATGTTTGGTGCCAGCAGGTAAGAGGACTGTCCTCTTAgt < 1:641631/99‑2 (MQ=255) ttttttGATTAGTTTGGAGATCAAGGTATTGTGAGTAAGACGAACAGCCAGGCGTCGCTATCGTTAGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGcc < 1:57840/99‑1 (MQ=255) ttattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGctga < 1:3781482/100‑4 (MQ=255) ttattaATTAGTTTGTAGATCAAGGCATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGctg < 1:2373224/99‑3 (MQ=255) tattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCATGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGccccc < 1:2081369/100‑1 (MQ=255) tattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGccccc < 2:3055865/100‑1 (MQ=255) tattaATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGccccc < 1:578816/100‑1 (MQ=255) attaattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCcct < 1:2750800/100‑1 (MQ=255) tttattaGTTTGTAGATCAAGGTCTTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGcc < 1:2201171/92‑1 (MQ=255) ttaattaGTGTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGATGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCcctc > 1:4265983/1‑100 (MQ=255) taattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCcctcc < 2:1558546/100‑1 (MQ=255) taattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCcctc > 1:3905213/1‑99 (MQ=255) aattaGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTaagatcggaag > 1:3280660/1‑90 (MQ=255) taGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTc < 1:596155/100‑1 (MQ=255) taGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTc < 2:504385/100‑1 (MQ=255) taGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTc < 1:1095271/100‑1 (MQ=255) aGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTcc > 1:1958887/1‑100 (MQ=255) gTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTccc > 2:1872570/1‑100 (MQ=255) gTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTccc > 2:3776547/1‑100 (MQ=255) tttGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTcccc < 2:2274431/100‑1 (MQ=255) gTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCt < 2:2173529/100‑1 (MQ=255) tAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtc > 1:3677834/1‑100 (MQ=255) tAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtc < 1:1260972/100‑1 (MQ=255) tAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtc > 2:3874998/1‑100 (MQ=255) tCAAGGTCTTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcattc > 2:2299756/1‑100 (MQ=255) tCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcattc < 2:4399413/100‑1 (MQ=255) tCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcattc > 2:4103035/1‑100 (MQ=255) cAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcattca < 2:2446181/100‑1 (MQ=255) aaGGTATTGTGAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCGCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcattcat < 1:2894409/100‑1 (MQ=255) aGGTATTGGCAGTGAGACGAAAATCCAGGCCGCGCAATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCtcattcat > 1:1719362/1‑99 (MQ=255) ggTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTa > 1:1087176/1‑100 (MQ=255) aTTGTTAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTGTTGCTGCCATCAGCTAAGTGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTaa < 1:906067/98‑1 (MQ=255) ttGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACa < 1:1800107/100‑1 (MQ=255) aGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTGGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATcc > 1:2964181/1‑100 (MQ=255) aGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATcc > 2:3262303/1‑100 (MQ=255) gagaCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCAtt < 1:3710569/100‑1 (MQ=255) gagaCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCAtt > 1:1228771/1‑100 (MQ=255) agaCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTg < 2:1098903/100‑1 (MQ=255) gaCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGc > 2:2488781/1‑100 (MQ=255) aCGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGcc < 2:2587988/100‑1 (MQ=255) cGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCa < 2:1359719/100‑1 (MQ=255) aaaTCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATaa < 1:4205077/100‑1 (MQ=255) aTCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATaaaa > 2:3189462/1‑100 (MQ=255) ccAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCCTTGCCATaaaaca < 2:2964197/100‑3 (MQ=255) ccAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAata < 2:1110593/100‑1 (MQ=255) aGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAatata < 2:2109298/100‑1 (MQ=255) cTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaa > 2:1807730/1‑100 (MQ=255) tCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaaaa < 1:3492126/100‑1 (MQ=255) gCTATTTTTGGTGGCATCAGCTAAGAGGACACTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATGAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaaaaaa > 2:2960140/1‑100 (MQ=255) gCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaaaaaa > 2:1254035/1‑100 (MQ=255) gCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATaaaaaa > 2:2571197/1‑100 (MQ=255) aTTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCGTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGcc > 1:2432770/1‑100 (MQ=255) tttttGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGccc < 1:957153/100‑1 (MQ=255) ttttGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCt < 2:2497/100‑1 (MQ=255) ttttGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCt < 2:2943563/100‑1 (MQ=255) tGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGc < 2:423762/100‑1 (MQ=255) gTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCtt < 1:2911062/100‑1 (MQ=255) gTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCtt > 2:3665061/1‑100 (MQ=255) gTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCtt > 1:3826597/1‑100 (MQ=255) gCCATCAGCTAAGAGGTCAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATAAATAAAAAAGCCCTTGCTTTc < 1:2577866/100‑1 (MQ=255) gCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTc < 2:635835/100‑1 (MQ=255) ccATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCt < 1:2844471/100‑1 (MQ=255) cATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTa > 2:3844091/1‑100 (MQ=255) aTCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTaa > 2:1376860/1‑100 (MQ=255) aTCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTaa < 1:2003210/100‑1 (MQ=255) aTCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATGAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTaa < 1:2148607/100‑1 (MQ=255) cAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACg < 2:1543764/100‑1 (MQ=255) ggCTAAGAGGACTGTCCTCTTCGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCATTGCTTTCTAACGt > 1:4339580/2‑100 (MQ=255) ggCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGt > 1:3372829/2‑100 (MQ=255) ggCTAAGAGGACGGTCCTCTTAGCACCCTCCTTTCCAAGCTGATTCATTAAACAAAACCATTGCCATAAAATAAACAAAAAAGGCCTAGCTGTCTAACg > 1:1658510/2‑99 (MQ=255) aGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGt < 1:3240495/100‑1 (MQ=255) ncTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTg > 1:2396810/2‑100 (MQ=255) gCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCGTTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTg > 1:2402565/1‑100 (MQ=255) gCTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTg > 1:1745946/1‑100 (MQ=255) cTAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGa > 1:3693902/1‑100 (MQ=255) tAAGAGGACTGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaa > 1:3420225/1‑100 (MQ=255) tAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaa > 2:2104356/1‑100 (MQ=255) tAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaa < 2:1396704/100‑1 (MQ=255) tAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaa > 1:1876855/1‑100 (MQ=255) tAACAGGACTGTCCTCTTAGCCCCTTCTTTTCCCCGCTCATTCATTATACAGTGCCGTTGCCATAATATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTTTTACg < 1:614460/96‑1 (MQ=255) aaGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaaa > 1:449421/1‑100 (MQ=255) aaGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGaaa > 2:2066968/1‑100 (MQ=255) agagGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAg > 1:1072818/1‑100 (MQ=255) gagtaaaGTCCTCTTAACCCACTACTTTCCCAGCTCCTTCATTACACAAATCCATTGCCATAAACTATCTACAAAAGCCCTAACTTTCTAACCTGaaaat > 1:709871/7‑98 (MQ=255) ggACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCCCATTCATTAAACAAACCCATTGCCATAAAATATATAACAAAGCCCTTCCTTTCGAACGTGAAAGTgg > 1:1639377/1‑100 (MQ=255) gACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGt < 2:1234537/100‑1 (MQ=255) cAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGttt > 2:758335/1‑100 (MQ=255) | GTTAATTAACTATTTATTAATTAGTTTGTAGATCAAGGTATTGTCAGTGAGACGAAAATCCAGGCTTCGCTATTTTTGGTGCCATCAGCTAAGAGGACAGTCCTCTTAGCCCCCTCCTTTCCCCGCTCATTCATTAAACAAATCCATTGCCATAAAATATATAAAAAAGCCCTTGCTTTCTAACGTGAAAGTGGTTT > NC_000913/2089756‑2089952 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |