| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,950,966:1 | +C | 17.3% | coding (135/567 nt) | yecD → | isochorismatase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,950,965 | 1 | . | C | 17.3% | 470.7 / 113.3 | 150 | coding (134/567 nt) | yecD | isochorismatase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (59/65); new base C (18/8); total (77/73) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.33e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.54e-02 | |||||||||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
TGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCACCGGCTAAAG > NC_000913/1950869‑1951063 | tgATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGCCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCCGCGAGATATCg‑cgc > 2:3667567/1‑100 (MQ=255) gATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGcc > 1:545161/1‑100 (MQ=255) gATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGcc < 1:3349048/100‑1 (MQ=255) ngATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGc > 1:1695236/2‑100 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 2:283856/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 1:496529/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 1:446794/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 1:3585111/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 2:735125/100‑1 (MQ=255) cGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGc < 1:2090255/100‑1 (MQ=255) gATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCg > 2:1233594/1‑100 (MQ=255) ttACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTc < 2:3722358/100‑1 (MQ=255) tACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCa > 1:3835369/1‑100 (MQ=255) cAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGTGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGc > 1:190163/1‑100 (MQ=255) cAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGc > 1:1877481/1‑100 (MQ=255) cAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGc > 1:4189761/1‑100 (MQ=255) cAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGc > 1:1019702/1‑100 (MQ=255) cAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGcttcccgg < 1:1590239/100‑8 (MQ=37) cAAGAAGGCAGCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGc < 1:178285/100‑1 (MQ=255) aagaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGcc > 2:3406579/1‑100 (MQ=255) aagaagGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGcc < 1:1370575/100‑1 (MQ=255) agaagGCATCTTACCTTTTGGCGGTGGTCCACATACTGCCGATTAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGcc < 2:3963047/99‑1 (MQ=255) taacgCATCGTACCTTTTGCCGGTTGTCCACATACTTCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGccct < 2:4034852/96‑2 (MQ=255) ggCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgtgt < 1:2206023/100‑1 (MQ=255) ggCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgtgt < 2:2786764/100‑1 (MQ=255) gCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGtt < 1:318752/100‑1 (MQ=255) aTCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTc > 2:2252810/1‑100 (MQ=255) aTCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTc < 2:3196221/100‑1 (MQ=255) tACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACCGCCATCGAGGTAGTTAATCGCCCCGCCTAGCTGGCCGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCgtcgtcctg > 2:3294103/1‑91 (MQ=255) ccTTTTGCCGGTGGTCCACGTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgc < 2:1624834/100‑1 (MQ=255) ttttGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTgcgc > 1:674534/1‑100 (MQ=255) tGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGtt > 2:4114009/1‑100 (MQ=255) tGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGtt < 1:714349/100‑1 (MQ=255) ggtggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCt < 2:285671/100‑1 (MQ=255) ggtggtCCACATACTGCCGATGAGGGAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCt < 1:998351/100‑1 (MQ=255) tggtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTgg < 1:1165798/100‑1 (MQ=255) gtCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTc < 2:547501/100‑1 (MQ=255) tCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCt < 2:3029980/100‑1 (MQ=255) tCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCt > 1:1283673/1‑100 (MQ=255) ccACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTgg > 2:437307/1‑96 (MQ=255) ccACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTg > 1:1338178/1‑100 (MQ=255) ccACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTg < 1:1266738/100‑1 (MQ=255) ccACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTg > 1:2367803/1‑100 (MQ=255) cacaTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGc > 2:787102/1‑100 (MQ=255) caTACTGGCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCg < 2:200844/100‑1 (MQ=255) caTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCg < 1:2268980/100‑1 (MQ=255) caTACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCg < 1:3408620/100‑1 (MQ=255) tACTGCCGATGAGGTGGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGAt > 2:3517402/1‑100 (MQ=255) tACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGAt > 1:4011457/1‑100 (MQ=255) tACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCCCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGa > 2:1245872/1‑99 (MQ=255) cTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTa < 1:1090811/100‑1 (MQ=255) tGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTAc > 2:923804/1‑100 (MQ=255) gCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACg > 2:764489/1‑100 (MQ=255) ccGATGAGGTAGTTAATCGCCCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGc < 2:710835/100‑1 (MQ=255) gATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTg > 2:2448209/1‑100 (MQ=255) ggAGGTAGTTAAGCGCGCCGGGAGGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCTGTCAGCCCGTGGCTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGc > 2:1659055/2‑96 (MQ=255) aGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGGCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGc < 2:823054/100‑1 (MQ=255) aGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGc < 1:2448214/100‑1 (MQ=255) aGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGc < 2:2256344/100‑1 (MQ=255) ggTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCa < 1:1453929/100‑1 (MQ=255) tAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCAtt < 2:3940864/100‑1 (MQ=255) aGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTa > 1:786012/1‑100 (MQ=255) aGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTa > 2:3008392/1‑100 (MQ=255) aGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTa < 2:1193749/100‑1 (MQ=255) gTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTATGCTGAAGCATTaa < 1:2842052/100‑1 (MQ=255) aTCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACa < 1:102068/100‑1 (MQ=255) tCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAg < 2:568267/100‑1 (MQ=255) gcCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCgg < 2:1058288/100‑1 (MQ=255) gcCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCgg < 2:1060165/100‑1 (MQ=255) ctgaccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTc > 1:3010217/7‑100 (MQ=38) gggAATCTGGCGGCGAAATTTCG‑TGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCg < 2:3831597/100‑1 (MQ=255) gggAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCg < 2:3435160/100‑1 (MQ=255) ggAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCg > 2:1013845/1‑99 (MQ=255) gaccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGa > 2:2433379/5‑100 (MQ=38) gAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATGACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGAt > 2:2523413/1‑100 (MQ=255) accgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGAt > 2:4148691/4‑100 (MQ=38) accgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGAt > 2:273705/4‑100 (MQ=38) accgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGAt < 2:1684699/97‑1 (MQ=38) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 1:2341857/3‑100 (MQ=39) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 2:3276916/3‑100 (MQ=39) ccgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg > 1:3855001/3‑100 (MQ=39) aaGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATg < 2:190163/100‑1 (MQ=255) cgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgc > 1:217539/2‑100 (MQ=39) cgCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCAGACGATgc > 2:771966/2‑100 (MQ=38) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 1:354541/1‑100 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 1:408297/1‑100 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 2:2729198/1‑100 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATgcg > 2:2686175/1‑100 (MQ=255) gCTGGC‑GCGAAATTTCGCCGCCAGCGGTCAGCCCCTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGACGATgcg > 2:2500569/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc > 1:246145/1‑100 (MQ=255) tGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGcc < 1:565211/100‑1 (MQ=255) ggcggcGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGccc < 2:1338177/100‑1 (MQ=255) cggcgAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTc > 1:179599/1‑100 (MQ=255) ggcgAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCa > 1:3629483/1‑100 (MQ=255) cgAAATTTCG‑CGGCAGCGGTCAGCCCGTGTTGCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCAcc < 2:173883/100‑1 (MQ=255) aaaTTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCACCgg < 1:3832412/100‑1 (MQ=255) aaTTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCACCGGc > 2:1505654/1‑100 (MQ=255) tttCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCACCGGc < 2:1300553/98‑1 (MQ=255) cg‑cgCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCACCGGCTAAAg < 2:623456/100‑1 (MQ=255) cg‑cgCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCACCGGCTAAAg < 1:2369205/100‑1 (MQ=255) | TGATCGATTTACAAGAAGGCATCTTACCTTTTGCCGGTGGTCCACATACTGCCGATGAGGTAGTTAATCGCGCCGGGAAGCTGGCGGCGAAATTTCG‑CGCCAGCGGTCAGCCCGTGTTTCTGGTGCGCGTTGGCTGGTCTGCCGATTACGCTGAAGCATTAAAACAGCCGGTCGATGCGCCCTCACCGGCTAAAG > NC_000913/1950869‑1951063 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |