| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 1,609,561:1 | +C | 17.6% | coding (1120/1452 nt) | uxaB ← | altronate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 1,609,561 | 1 | . | C | 17.6% | 356.9 / 92.1 | 119 | coding (1120/1452 nt) | uxaB | altronate oxidoreductase, NAD‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (36/62); new base C (9/12); total (45/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.26e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 | |||||||||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
GCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTGACTGCACT > NC_000913/1609463‑1609660 | gCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCTGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCtg‑t > 2:1902032/1‑100 (MQ=255) ccGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCtg‑tg < 1:4038341/100‑1 (MQ=255) ccGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCtg‑tg > 1:3999404/1‑100 (MQ=255) aCGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCA‑CAGCTGCTGGCAgg < 1:1302375/100‑1 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACTCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGa < 1:3499439/100‑1 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGa > 1:1499916/1‑100 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGa < 1:3410823/100‑1 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCA‑CAGCTGCTGGCAggg < 2:3859239/100‑2 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCA‑CAGCTGCTGGCAggg < 2:2570025/100‑2 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCA‑CAGCTGCTGGCAggg < 1:2790478/100‑2 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCA‑CAGCTGCTGGCAggg < 2:148897/100‑2 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCA‑CAGCTGCTGGCAggg < 2:3879811/100‑2 (MQ=255) cGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCATTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGa > 2:414234/1‑100 (MQ=255) cTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATg < 1:230252/100‑1 (MQ=255) cTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCA‑CAGCTGCTGGCAgggca < 1:3277495/100‑4 (MQ=255) tCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGc < 2:3504228/100‑1 (MQ=255) caccacGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCg < 1:2254366/100‑1 (MQ=255) caccacGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCg < 2:2121966/100‑1 (MQ=255) accacGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCgg < 2:1914436/100‑1 (MQ=255) ccacGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCggg < 1:2670608/100‑1 (MQ=255) cacGAGAGAACGCAATCAATGCCGCTGATTCGAACGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCCTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCGGGATGCGGGt < 2:2149220/100‑1 (MQ=255) acGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCATCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTg < 2:2432687/100‑1 (MQ=255) acGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTg < 1:3792882/100‑1 (MQ=255) cGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGc < 1:2533166/100‑1 (MQ=255) aTAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCgg > 2:528903/1‑100 (MQ=255) tAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAATGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGa < 2:1147932/100‑1 (MQ=255) aCGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACtt < 1:2756817/100‑1 (MQ=255) aCGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACtt > 1:3181736/1‑100 (MQ=255) gCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTgg < 1:2113415/100‑1 (MQ=255) gCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTgg < 2:3975675/100‑1 (MQ=255) caatcaatGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGt < 1:257109/100‑1 (MQ=255) caatcaatGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGt > 1:1281684/1‑100 (MQ=255) atcaatGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGGGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCa < 2:2720639/100‑1 (MQ=255) tcaatGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCAt < 1:1644716/100‑1 (MQ=255) atGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATAcc > 2:3393639/1‑100 (MQ=255) atGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATAcc < 2:3504329/100‑1 (MQ=255) atGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATAcc < 1:3253427/100‑1 (MQ=255) ccGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGtt > 1:2793373/1‑100 (MQ=255) cGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTg > 1:4040548/1‑100 (MQ=255) cGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTg < 1:2365592/100‑1 (MQ=255) cGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTACCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCg > 2:3261812/1‑97 (MQ=255) aaTGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAgcg < 2:2915608/100‑1 (MQ=255) aaTGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAgcg < 1:3371935/100‑1 (MQ=255) tGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGcgcg > 2:2139840/1‑100 (MQ=255) tGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGcgcg > 2:3928663/1‑100 (MQ=255) tGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGcgcg > 2:3663488/1‑100 (MQ=255) tGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGcgcg > 1:70436/1‑100 (MQ=255) tGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGcgcg < 2:606611/100‑1 (MQ=255) cGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGAt > 1:591179/1‑100 (MQ=255) cGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGAt < 2:653632/100‑1 (MQ=255) gAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATa > 1:915060/1‑100 (MQ=255) gAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATa < 2:1740905/100‑1 (MQ=255) aaaGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAg < 1:3663507/100‑1 (MQ=255) gTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGAca < 2:2431250/100‑1 (MQ=255) gTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGAca < 2:3178595/100‑1 (MQ=255) ggCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTTCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGAcagcag < 2:4001239/100‑1 (MQ=255) ggCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGAcagcag < 1:1801033/100‑1 (MQ=255) ggCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGAcagcag < 2:3724657/100‑1 (MQ=255) ccGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATg > 2:3835973/1‑100 (MQ=255) ccGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATg > 1:3662824/1‑100 (MQ=255) ccGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATg < 1:2242382/100‑1 (MQ=255) ggAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCt < 2:4089615/100‑1 (MQ=255) aGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTaa < 2:1540473/100‑1 (MQ=255) aGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTaa < 1:2404839/100‑1 (MQ=255) aGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTaa < 1:3671301/100‑1 (MQ=255) gtgtGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGATGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTa > 2:4012966/1‑98 (MQ=255) tgtgCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTaa < 2:568746/98‑1 (MQ=255) tgCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGt < 2:3721294/99‑1 (MQ=255) ccGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACg < 1:1722930/100‑1 (MQ=255) cGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACgg > 1:487057/1‑100 (MQ=255) cGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACgg > 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catcctgccA‑CAGCTGCTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAAc > 1:2065203/4‑100 (MQ=255) catcctgccA‑CAGCTGCTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAAc > 1:1044551/4‑100 (MQ=255) gccctgccAGCATCTG‑TGGCAGGATGCGTGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACg < 2:2904988/100‑1 (MQ=255) gccctgccAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGaaa < 2:902960/98‑1 (MQ=255) gccctgccAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACg < 1:248450/100‑1 (MQ=255) tcctgccA‑CAGCTGCTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGc > 1:87574/2‑100 (MQ=255) ccctgccAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGc > 1:278536/1‑100 (MQ=255) cctgccAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGcc > 1:1691203/1‑100 (MQ=255) cctgccA‑CAGCTGCTGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGGCATACCGTTGAGCGCGAGAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTAGGGGTTACGGAAACGcc > 2:2444220/1‑100 (MQ=255) tgccAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCg > 1:2618270/1‑100 (MQ=255) tgccAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCg < 2:1350124/100‑1 (MQ=255) gccAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCgg < 2:1158306/100‑1 (MQ=255) gccAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCgg < 2:278536/100‑1 (MQ=255) cagcagCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTg > 1:545406/1‑100 (MQ=255) cagcagCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTg < 1:154093/100‑1 (MQ=255) cagcagCTG‑TGGCAGGAGGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTg < 2:2308024/100‑1 (MQ=255) gcagcTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGTGTTACGGAAACGCCCGGTGAc < 2:487954/100‑1 (MQ=255) gcagcTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTGAc > 1:1093396/1‑100 (MQ=255) agcTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTGACTg < 2:505849/100‑1 (MQ=255) agcTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTGACTg < 1:1278822/100‑1 (MQ=255) g‑tgGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTGACTGCACt < 2:1499913/100‑1 (MQ=255) g‑tgGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTGACTGCACt > 1:1431143/1‑100 (MQ=255) | GCCGTTACGCTCACCACGATAGAACGCAATCAATGCCGCTAATGCGAAAGTAAGGCGCGCCGGAAGTGTGCCGTTTGCCTTCTGCCCTGCCAGCAGCTG‑TGGCAGGATGCGGGTGCGGAACTTGGTCATACCGTTGAGCGCGATAGACAGCAGCTGATGCTTAATGTACGGGTTACGGAAACGCCCGGTGACTGCACT > NC_000913/1609463‑1609660 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |