| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4586789 | 176 (1.180) | 11 (0.080) | 8/166 | NT | 6.3% | intergenic (‑28/‑160) | hsdR/mrr | endonuclease R Type I restriction enzyme/methylated adenine and cytosine restriction protein |
| ? | NC_000913 | = 4586802 | 165 (1.190) | intergenic (‑41/‑147) | hsdR/mrr | endonuclease R Type I restriction enzyme/methylated adenine and cytosine restriction protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
TTTTCCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4586685‑4586789‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggcctTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGCC < NC_000913/4586802‑4586705 TTTTCCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCG > 2:356438/1‑100TTTTCCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCG < 1:2053541/100‑1TTTTCCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCG < 1:3359297/100‑1 TTCCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGG < 2:4108789/100‑1 TTCCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGG < 2:1257400/100‑1 TCCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCG > 2:1004130/1‑97 CCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC < 2:1420087/100‑1 CCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC < 2:1770968/100‑1 CCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC < 1:184319/100‑1 CCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC > 1:1923936/1‑100 CCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC < 2:1771368/100‑1 CCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC < 1:2770689/100‑1 CCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC < 1:2573406/100‑1 CGCCGCACAGGCGATGGCATAATGGAAGTCGTTGACTCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC < 1:2442520/99‑1 CGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCT < 2:1666349/100‑1 CGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCT > 1:721197/1‑100 GCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC > 2:228534/1‑98 GCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCCGTCCT > 2:2735420/1‑99 cgaACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGTATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCC < 1:4186617/93‑1 AAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCG < 2:3754110/100‑1 AGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGC < 1:3637853/100‑1 AGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGC < 1:1974183/100‑1 GTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCA < 1:2537962/100‑1 AAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAG < 1:251087/100‑1 AAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAG < 2:3116854/100‑1 AGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGC > 1:1103614/1‑100 AGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATGAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAG < 2:1796852/99‑1 GTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCA < 1:886727/100‑1 CAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAAT < 1:356438/100‑1 TGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATC < 2:1103614/99‑1 GGGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCAAAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACT < 2:1255943/98‑1 GGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTAT > 2:3696353/1‑100 GGCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAAGCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTA < 2:3603905/99‑1 GCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATG < 1:3999126/100‑1 GCCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATG < 1:1628210/100‑1 CCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGC < 2:1293867/100‑1 CCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGC < 1:1734824/100‑1 CCTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGC < 1:1253862/100‑1 CTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGCC < 1:996940/100‑1 CTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGCC > 1:3883996/1‑100 CTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGCC > 1:3183179/1‑100 CTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGCC > 1:2445852/1‑100 CTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGCC < 1:2287830/100‑1 CTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGCC > 1:1164050/1‑100 CTTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGAGTAATAACGATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGC < 1:1980774/99‑1 TTTTCCGCCGCACAGGCGATGGCATAAGTGAAGTCGTTGACGCCCTTCAGGAATTCAAAATTGGATTTATTCATCATTGTTATTAATCCATTGCTGTGCGGGCCT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/4586685‑4586789‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gggcctTAAATATTTGGACAGGCCCGCACAGCAATGGATTAATAACAATGATGAATAAATCCAATTTTGAATTCCTGAAGGGCGTCAACGACTTCACTTATGCC < NC_000913/4586802‑4586705 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |