| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 377335 = | NA (NA) | 21 (0.150) | 8/164 | NT | NA | noncoding (1/187 nt) | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 377368 = | NA (NA) | noncoding (34/187 nt) | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | REP32 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 4 REP sequences | |||||
Only 100 of 238 total aligned reads displayed.
CGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCAT > NC_000913/377236‑377434 | ctaataagacgcgaaaagcggcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGc > 2:1695700‑M1/99‑100 (MQ=255) cgatctagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGc > 1:3899276‑M1/99‑100 (MQ=255) cgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGcc > 2:4148744/1‑100 (MQ=255) cgcTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGcc > 2:440987/1‑100 (MQ=255) gataagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCt < 1:2054778‑M1/4‑1 (MQ=255) cTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTg < 2:2817196/100‑1 (MQ=255) tCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGa > 1:173252/1‑100 (MQ=255) cAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGa > 2:4000681/1‑99 (MQ=255) aagacgcgcaaagcgtcgcatcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGAt > 2:822747‑M1/94‑100 (MQ=255) aGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATg < 2:2148420/100‑1 (MQ=255) aGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATg < 2:2107791/100‑1 (MQ=255) gcgcCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGc < 1:3664362/100‑1 (MQ=255) cGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACg > 1:3557703/1‑100 (MQ=255) gAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGc < 2:2631458/100‑1 (MQ=255) gAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGc < 1:3446910/100‑1 (MQ=255) agagCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTa < 2:3192895/100‑1 (MQ=255) tcAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgc > 1:2748358/2‑100 (MQ=255) gCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgc > 1:3265052/1‑100 (MQ=255) gCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgc > 1:3156167/1‑100 (MQ=255) cAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgcg < 1:3779185/100‑1 (MQ=255) aGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATgcg < 1:74051/99‑1 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATACGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg > 2:3904390/1‑100 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg > 2:2370915/1‑100 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg > 1:1175450/1‑100 (MQ=255) ggATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGcgcg > 1:2210648/1‑100 (MQ=255) tGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCt > 1:1861525/1‑100 (MQ=255) tcaggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa > 2:3776587‑M1/74‑100 (MQ=255) aaGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa < 1:702631/100‑1 (MQ=255) aaGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTa > 2:2466560/1‑100 (MQ=255) aGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt > 2:4116525/1‑100 (MQ=255) aGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTAt > 2:373808/1‑100 (MQ=255) gacgacCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATc < 2:124379/100‑1 (MQ=255) ggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCa > 2:3761490‑M1/71‑100 (MQ=255) ggcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacctcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCa > 1:337421‑M1/71‑100 (MQ=255) gcatggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATAAGACGCTATGCGCGTCTTATCAg > 1:3490311‑M1/70‑100 (MQ=255) ataatagcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggcctacacttcgcccgtaagccgtagGCCTGATGCGACGCTTTGCGCGTCTTATCAgg > 1:2277589‑M1/69‑100 (MQ=255) atggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:3694722‑M1/68‑100 (MQ=255) atggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:3059180‑M1/68‑100 (MQ=255) acCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGc > 1:4016182/1‑100 (MQ=255) tggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccatgaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGTGTCTTATcaggtc > 1:2827385‑M1/67‑98 (MQ=255) tggcgcacgactgccggatgcggcgtgaacgccttatccggtctacacttcgcccataaaccgtagGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGcc > 2:3852914‑M1/67‑100 (MQ=255) gCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt < 2:725570/100‑1 (MQ=255) gCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGtt > 1:189212/1‑100 (MQ=255) ccGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGttt > 1:1291369/1‑100 (MQ=255) ccGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGttt > 2:573665/1‑100 (MQ=255) cGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTa > 2:2881460/1‑100 (MQ=255) gACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAt > 2:1611542/1‑100 (MQ=255) gACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTAt < 1:2518065/100‑1 (MQ=255) cTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATgg > 1:287683/1‑100 (MQ=255) ttCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATggg < 2:2918627/100‑1 (MQ=255) tCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTAGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGACTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGc > 1:2078401/1‑100 (MQ=255) cAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGc < 2:2378593/99‑1 (MQ=255) cAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCg > 1:1544463/1‑100 (MQ=255) cAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCg > 1:2707650/1‑100 (MQ=255) gTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTAGGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAgt < 2:3305695/100‑1 (MQ=255) tGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAgtg < 2:1948133/100‑1 (MQ=255) gCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAgtgt < 1:486754/100‑1 (MQ=255) ccggatgatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCGGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTa < 1:1485151/97‑1 (MQ=255) tgatgaTTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGAGGCGACGCTAGGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTa < 2:1968539/98‑1 (MQ=255) gatgatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGACTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGAc > 2:1747112/1‑100 (MQ=255) tgatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCg > 1:158552/1‑100 (MQ=255) tgatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCg < 1:2237237/100‑1 (MQ=255) gatTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCgg > 1:1434659/1‑100 (MQ=255) atTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGa > 2:2433736/1‑100 (MQ=255) tttGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGAt > 1:362449/1‑100 (MQ=255) ttGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATa < 1:2425331/100‑1 (MQ=255) tGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATaa > 1:2195349/1‑100 (MQ=255) gATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAg > 1:3364513/1‑100 (MQ=255) gATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAg > 1:126935/1‑100 (MQ=255) aTGTGGTAAACATAGTTAAGTATCGCCCAGATGCTTGATGCGACGCAATGCGCGTCTTCTCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAgg < 2:2498121/100‑1 (MQ=37) aTGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAgg < 2:362449/100‑1 (MQ=255) tgtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGc > 2:1916722/1‑100 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCg > 1:865675/1‑100 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCg < 2:787935/100‑1 (MQ=255) gtgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCg > 2:3568340/1‑100 (MQ=255) tgGTCAACATAGATAAGTCGAGCGCAGCTCGCTGAAGAGACGCGTTGCGCGTCTTCTCAGGCCTCCTGTTTATAGGCGGAGCGTCGAACGGATCAGGCg > 2:3464153/1‑99 (MQ=255) tgGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGt < 1:4148773/100‑1 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGTCGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGt > 2:2586857/1‑99 (MQ=255) ggTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGtt > 1:759042/1‑100 (MQ=255) gTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGTGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTc < 2:2054697/100‑1 (MQ=255) gTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTc < 1:2629043/100‑1 (MQ=255) gTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTc < 2:3215528/100‑1 (MQ=255) aaaCATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGAGGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAc < 2:490500/100‑1 (MQ=255) aaCATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcg > 1:2299076/1‑100 (MQ=255) aCATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgc > 2:1078033/1‑100 (MQ=255) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 2:1149260/100‑1 (MQ=255) cATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgcc > 2:857984/1‑100 (MQ=255) agaGATAAGGCGTGCGCAGATGTCTGATGCGACGCTATGAGGGTCTTATGAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGCCCGGATAAGGCGTTCAcgcc < 2:144812/97‑1 (MQ=18) aTAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccg < 2:3273498/100‑1 (MQ=255) aTAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccg < 2:3154096/100‑1 (MQ=255) aTAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccg < 1:1337694/100‑1 (MQ=255) tAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGGTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccgc < 2:175953/100‑1 (MQ=255) gATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGTCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCAcgccg < 2:2699730/97‑1 (MQ=255) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc > 2:3020095/1‑100 (MQ=255) gTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGc < 1:2578888/100‑1 (MQ=255) cGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAg > 1:1846319/1‑100 (MQ=255) aGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCTTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTgcg < 2:2414687/100‑1 (MQ=255) aGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTgcg < 1:3971969/100‑1 (MQ=255) GCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCAt < 1:1111923‑M1/100‑1 (MQ=255) GCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCAt < 1:1477‑M1/100‑1 (MQ=255) | CGCGCTCAGCGCCGAAGAGCAGGATGAAGACGACCCGTATGCCGACTTCAAAGTGCCTGATGATTTGATGTGGTAAACATAGATAAGTCGTGCGCAGATGCCTGATGCGACGCTATGCGCGTCTTATCAGGCCTACGGTTTATGGGCGAAGTGTAGACCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGGCAGTCGTGCGCCAT > NC_000913/377236‑377434 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |