New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4602596 = | 155 (1.040) | 8 (0.060) | 4/168 | NT | 5.2% | coding (263/771 nt) | yjjP | DUF1212 family inner membrane protein |
? | NC_000913 | 4602621 = | 146 (1.040) | coding (238/771 nt) | yjjP | DUF1212 family inner membrane protein | |||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 182 total aligned reads displayed.
AAGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCAC > NC_000913/4602497‑4602693 | gatcttACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACaa < 2:466979/95‑1 (MQ=255) aGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAt < 1:1549375/100‑1 (MQ=255) aGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAt > 1:2566287/1‑100 (MQ=255) ggCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAtg > 1:3977933/1‑100 (MQ=255) agttctatctcttcgaacgccatagtgctgacaactattaaagatgggcaatgcctgacatcgacacgtaaaaatcacgatcgcggcattaatatgcAtg < 1:3063463‑M1/3‑1 (MQ=255) gCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAAtgt > 1:3416644/1‑100 (MQ=255) tACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACaaagatc > 1:466980/1‑95 (MQ=255) tACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGc < 1:436547/100‑1 (MQ=255) cAGCCATCTTAGATAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTg < 2:716129/99‑1 (MQ=255) aGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGa > 1:1007344/1‑100 (MQ=255) gCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGAc < 1:1937058/100‑1 (MQ=255) gCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGAc < 1:2023243/100‑1 (MQ=255) gCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGAc < 1:4158011/100‑1 (MQ=255) ccATCTTGGGTAACGTAATGGCTGACTTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACt > 2:3388140/1‑100 (MQ=255) ccATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACt < 2:3977906/100‑1 (MQ=255) aTCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTc > 2:2905093/1‑100 (MQ=255) tCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCa < 1:41658/100‑1 (MQ=255) cTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAg < 1:2886210/100‑1 (MQ=255) tGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTc > 1:628007/1‑100 (MQ=255) ggTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATGTAGCAGAGGAGGCTCCGGAAGAAGCACAAGGTGCTGGACTTCAGGca > 2:2892700/1‑99 (MQ=255) ggTAACGCAATCGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTcac > 2:2194745/1‑100 (MQ=255) gTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTcacc < 2:3262962/100‑1 (MQ=255) gTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTcacc < 2:2504818/100‑1 (MQ=255) tAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTcacca < 1:1749300/100‑1 (MQ=255) cGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACAt > 1:2905239/1‑100 (MQ=255) gTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATg < 1:1671793/100‑1 (MQ=255) tAATTGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGc < 2:1874475/100‑1 (MQ=255) tgctgacaactattaaagatgggcaatgcctgacatcgacacgtaaaaatcacgatcgcggcattaatatgcATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCa > 1:1266607‑M1/73‑100 (MQ=255) tGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCata < 1:2116523/100‑1 (MQ=255) ggCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCatat > 2:228150/1‑100 (MQ=255) ggCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCatat > 2:2638908/1‑100 (MQ=255) gacaactattaaagatgggcaatgcctgacatcgacacgtaaaaatcacgatcgcggcattaatatgcATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATAtt > 1:499426‑M1/69‑100 (MQ=255) cTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTa > 1:675537/1‑100 (MQ=255) tGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTaa < 1:941808/100‑1 (MQ=255) aaTTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATg < 2:3571394/100‑1 (MQ=255) ctattaaagatgggcaatgcctgacatcgacacgtaaaaatcacgatcgcggcattaatatgcATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGc > 1:550282‑M1/64‑100 (MQ=255) aTTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGc < 2:3421448/100‑1 (MQ=255) aTTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGc > 1:2780892/1‑100 (MQ=255) tGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCcgc < 1:1072993/100‑1 (MQ=255) tGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCcgc < 1:1650145/100‑1 (MQ=255) tGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAAAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCcgc < 1:3476031/100‑1 (MQ=255) gCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGa > 1:864575/1‑100 (MQ=255) cTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGAt > 1:3580080/1‑100 (MQ=255) tAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATc > 1:1083131/1‑100 (MQ=255) naaaTCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATc > 2:1603597/2‑100 (MQ=255) aaaTCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGAGGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATc < 2:3305203/99‑1 (MQ=255) aTCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTg > 1:3487671/1‑100 (MQ=255) aTCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTg > 1:3135280/1‑100 (MQ=255) tCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGa < 1:2484032/100‑1 (MQ=255) cGTTTGTCAACGCTTTGGTAATCCATCATATGATCCTCCGCAACAATCATAATGTGCTCGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATc < 2:3773098/95‑1 (MQ=255) cGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGAt > 2:2839154/1‑100 (MQ=255) ttCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGAtttt < 2:941978/100‑1 (MQ=255) tctcTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGAttttt < 2:3938088/100‑1 (MQ=255) tctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCGCCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAc > 1:3523265/1‑100 (MQ=255) tctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAc > 1:4165468/1‑100 (MQ=255) ctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAc > 1:902588/1‑99 (MQ=255) ctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACg < 2:1969223/100‑1 (MQ=255) ctACGCCTTTGTAATCCAGCACATGAGGCTCCGCAAGAATCACAATGTCCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACg < 2:3854842/100‑1 (MQ=255) tACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgt > 1:1794052/1‑100 (MQ=255) tACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACg < 2:281607/99‑1 (MQ=255) aCGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAAGGCCGCTATCGTGATTTTTACgtg < 1:1727368/100‑1 (MQ=255) cGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgtgt > 2:143066/1‑100 (MQ=255) gCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTc < 1:744677/100‑1 (MQ=255) cTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCg > 1:1424360/1‑99 (MQ=255) cTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGa < 2:2725162/100‑1 (MQ=255) cTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGa > 2:3666785/1‑100 (MQ=255) tttGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGAt < 2:3275542/100‑1 (MQ=255) ttGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATg < 2:3754717/100‑1 (MQ=255) ttGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATg < 2:1592997/100‑1 (MQ=255) ttGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATg < 1:3892821/100‑1 (MQ=255) gTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTc > 1:1978069/1‑100 (MQ=255) aaTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAg > 1:2126016/1‑100 (MQ=255) aaTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAg < 1:3752570/100‑1 (MQ=255) aaTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAg < 2:1994505/100‑1 (MQ=255) aaTCCAGCAGATGATGCCCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAg < 2:3364142/100‑1 (MQ=255) ccAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCa < 1:97493/100‑1 (MQ=255) ccAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCa > 1:209426/1‑100 (MQ=255) cagcagATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCa < 1:2700492/99‑1 (MQ=255) cagcagATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCAt > 2:1798370/1‑100 (MQ=255) agATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGcc < 2:3416628/100‑1 (MQ=255) agATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGcc < 2:2849709/100‑1 (MQ=255) atgatgCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCa < 1:1855127/100‑1 (MQ=255) gatgCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATc < 1:3122628/100‑1 (MQ=255) cTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTa < 2:2474712/100‑1 (MQ=255) cTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTa > 1:2427537/1‑100 (MQ=255) cTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTa < 2:1081801/100‑1 (MQ=255) tCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTaa > 2:845295/1‑100 (MQ=255) ccGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAAt < 1:1447905/100‑1 (MQ=255) cagCAAGAATCACCATGTGCTGGACTTCAGTAACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAAt > 1:2829148/3‑100 (MQ=255) gCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAg < 2:1396533/100‑1 (MQ=255) gCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAg < 2:2910949/100‑1 (MQ=255) aaGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGtt > 1:1310428/1‑100 (MQ=255) aGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTg < 1:2283402/100‑1 (MQ=255) aGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTg < 1:1421588/100‑1 (MQ=255) aTCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCa > 2:3016070/1‑100 (MQ=255) cacaATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGc < 2:1213010/100‑1 (MQ=255) acaATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCa > 1:2342998/1‑100 (MQ=255) caATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCAc > 2:1827865/1‑100 (MQ=255) caATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCAc < 1:3177123/100‑1 (MQ=255) caATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGCGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCAc > 2:3515683/1‑100 (MQ=255) | AAGGCTACCAGCCATCTTGGGTAACGTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCAC > NC_000913/4602497‑4602693 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |