| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 4,215,179 | Δ4 bp | 100% | coding (900‑903/930 nt) | metA → | homoserine O‑transsuccinylase |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 4215178 | 2 (0.010) | 138 (0.940) | 82/176 | NT | 98.6% | coding (899/930 nt) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
| ? | NC_000913 | 4215183 = | 2 (0.010) | coding (904/930 nt) | metA | homoserine O‑transsuccinylase | |||||
Only 100 of 164 total aligned reads displayed.
CGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCC > NC_000913/4215085‑4215282 | gatccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgacg < 2:662510‑M2/2‑1 (MQ=255)gatccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgacg > 1:132468‑M2/99‑100 (MQ=255)gatccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgacg < 1:357115‑M2/2‑1 (MQ=255) tccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGc < 2:1747161‑M2/4‑1 (MQ=255) ccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGca < 1:3399724‑M2/5‑1 (MQ=255) ccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGca > 2:2228289‑M2/96‑100 (MQ=255) ccgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtgtaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGca < 1:4078361‑M2/5‑1 (MQ=255) cgcaaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGca > 2:2325345‑M2/95‑99 (MQ=255) caaaatacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACAt < 1:492545‑M2/8‑1 (MQ=255) tacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATc < 2:1291898‑M2/13‑1 (MQ=255) tacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATc < 2:1733111‑M2/13‑1 (MQ=255) tacaccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATc < 2:3902490‑M2/13‑1 (MQ=255) caccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCa > 2:2812056‑M2/86‑100 (MQ=255) ccgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAAc > 2:3905403‑M2/84‑100 (MQ=255) cgcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACg > 2:3840522‑M2/83‑100 (MQ=255) gcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGc < 2:3418785‑M2/19‑1 (MQ=255) gcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGc < 1:783731‑M2/19‑1 (MQ=255) gcgagcgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGc < 1:93008‑M2/19‑1 (MQ=255) cgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGAt < 2:1906858‑M2/24‑1 (MQ=255) cgagctggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGAt > 1:1416673‑M2/77‑100 (MQ=255) tggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtc < 1:2918242‑M2/29‑1 (MQ=255) ggcgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtct > 1:59134‑M2/71‑100 (MQ=255) cgtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtcttc < 2:3928303‑M2/32‑1 (MQ=255) gtagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAAtcttct > 2:804032‑M2/68‑100 (MQ=255) tagtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtg < 1:3937624‑M2/34‑1 (MQ=255) agtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgt < 2:4036469‑M2/35‑1 (MQ=255) agtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccagacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgt < 1:3453237‑M2/35‑1 (MQ=255) gtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaagtattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgtg < 2:2209391‑M2/36‑1 (MQ=255) gtcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGCCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgtg < 2:2518821‑M2/36‑1 (MQ=255) tcacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGa < 1:3709139‑M2/37‑1 (MQ=255) cacggtaatttactgtttaccaactggctcaactcttacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt > 2:599300‑M2/63‑100 (MQ=255) cacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt > 2:1292808‑M2/63‑100 (MQ=255) cacggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt > 1:1609718‑M2/63‑100 (MQ=255) cggtaatttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAg < 2:1083147‑M2/40‑1 (MQ=255) atttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGAt < 2:2096821‑M2/45‑1 (MQ=255) atttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGAt < 1:1934883‑M2/45‑1 (MQ=255) ttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCg > 1:103917‑M2/54‑100 (MQ=255) ttactgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCg < 1:1942367‑M2/47‑1 (MQ=255) ctgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAgtcgatagatc > 1:3901444‑M2/51‑95 (MQ=255) ctgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTa > 1:39691‑M2/51‑100 (MQ=255) ctgtttaccaactggctcaactattacgtctaccagatcacgccatacgaCGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTa > 1:2953043‑M2/51‑100 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |