| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 3,368,982 | G→C | 17.9% | intergenic (+28/+32) | yhcG → / ← yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 3,368,982 | 0 | G | C | 17.9% | 440.6 / 91.6 | 179 | intergenic (+28/+32) | yhcG/yhcH | DUF1016 family protein in the PD‑(D/E)XK nuclease superfamily/DUF386 family protein, cupin superfamily |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (83/64); new base C (22/10); total (105/74) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.38e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.54e-01 | |||||||||||
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACG > NC_000913/3368883‑3369080 | gatgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTTCAGACAg > 2:283482/1‑100 (MQ=255) tgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtg > 1:2714249/1‑100 (MQ=255) tgaGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAAAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtg > 1:2909785/1‑100 (MQ=255) gagaAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtgt > 2:2474831/1‑100 (MQ=255) gaAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAgtgaga > 2:3347489/1‑97 (MQ=255) gaAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACACTGTCt > 1:1684942/1‑100 (MQ=255) aaaCGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTg < 1:4054019/100‑1 (MQ=255) aaCGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGc > 1:4004225/1‑100 (MQ=255) aaCGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGc > 1:1900751/1‑100 (MQ=255) aCGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACACTGTCTGCa < 1:1574840/100‑1 (MQ=255) cTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAAt > 1:1473738/1‑100 (MQ=255) cTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAAt < 1:95869/100‑1 (MQ=255) cTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACACTGTCTGCAGaa < 1:3132307/99‑1 (MQ=255) tCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATc > 2:3285266/1‑100 (MQ=255) cGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCt < 1:1535978/100‑1 (MQ=255) cGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCt < 1:3335789/100‑1 (MQ=255) gCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCGGACACTGTCTGCAGAAttcg < 2:2561135/100‑4 (MQ=255) cAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCttt > 1:2106205/1‑100 (MQ=255) aGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTa < 1:135796/100‑1 (MQ=255) gATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaa > 1:2785436/1‑100 (MQ=255) gATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACACTGTCTGCAGAAttcgaaa < 2:2459616/100‑7 (MQ=255) atctaCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaa < 1:1996942/96‑1 (MQ=255) aaCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTGAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACg < 1:1625141/100‑1 (MQ=255) aCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTaaaagat > 2:1996939/1‑97 (MQ=255) aCTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGa > 2:3749032/1‑100 (MQ=255) cTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGaa > 1:108193/1‑100 (MQ=255) tCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAAc < 1:3486560/100‑1 (MQ=255) tCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAAc > 2:2626747/1‑100 (MQ=255) tCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAg < 1:2676660/100‑1 (MQ=255) gAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGCACTAAGt > 1:2269737/1‑99 (MQ=255) aaCACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGttt > 2:125120/1‑100 (MQ=255) acagAGGCGGTGCTGGAGGAAGGCTATGGAGGGCGTTAATTTCAGAGGTTTGGAATTCTGAAGACAGTGTCTGCAGAATCTTGAAAACGAACTAAGttt < 2:1165505/99‑1 (MQ=255) acaGGCGGTGCTAGAGGAAAGCTATAGACGCCGCTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTaa > 2:2740669/1‑100 (MQ=255) caGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAg > 2:4047191/1‑100 (MQ=255) caGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAg < 1:1527284/100‑1 (MQ=255) caGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAg > 2:302023/1‑100 (MQ=255) ggCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGcc > 2:352587/1‑100 (MQ=255) cGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCAt < 1:4107366/100‑1 (MQ=255) ggTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCAtt < 1:632476/100‑1 (MQ=255) tGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTaa > 2:2646659/1‑100 (MQ=255) tGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTaa > 2:1111838/1‑100 (MQ=255) tGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTaa < 1:3945627/100‑1 (MQ=255) gCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAACCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTaaa > 1:3810172/1‑100 (MQ=255) cTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAAt > 1:3694579/1‑100 (MQ=255) tAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACCAAGTTTTAAGCCATTAAATc < 2:2566515/100‑1 (MQ=255) agatGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCATAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCa < 2:3885041/100‑1 (MQ=255) agagGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCa < 1:1692638/100‑1 (MQ=255) agagGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCa > 1:699047/1‑100 (MQ=255) gagGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGACTCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCCTTAAATc > 2:3878516/1‑98 (MQ=255) gagGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAg < 2:2895909/100‑1 (MQ=255) ggAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGcc > 1:2404926/1‑100 (MQ=255) ggAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGcc < 2:1900748/100‑1 (MQ=255) ggAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGcc < 1:2071828/100‑1 (MQ=255) ggAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGcc > 1:538532/1‑100 (MQ=255) caataGACGCCGTCAATTTCAGCGGTTTCGAGTTCTGCAGACGGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAAcc > 1:2831721/3‑100 (MQ=255) cTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAAcc > 1:939444/1‑100 (MQ=255) tataGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGTAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCt > 1:501655/1‑100 (MQ=255) taGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGAAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAAACTTc > 1:1982591/1‑100 (MQ=255) aGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTca < 1:2361254/100‑1 (MQ=255) gACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcac > 1:4197968/1‑100 (MQ=255) cGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTcacc < 2:1670715/99‑1 (MQ=255) gTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAAc < 1:3269420/100‑1 (MQ=255) gTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAAc > 1:2996249/1‑100 (MQ=255) tAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCt > 2:3661007/1‑100 (MQ=255) aaTTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtt > 1:1234517/1‑100 (MQ=255) tttCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtttt > 1:785315/1‑100 (MQ=255) tttCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtttt < 1:2022002/100‑1 (MQ=255) tttCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtttt > 2:1429592/1‑100 (MQ=255) tttCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCtttt < 1:3491009/100‑1 (MQ=255) ttCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCttttt < 1:3655186/100‑1 (MQ=255) tCAGCGGTTTCGGATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTa < 1:850096/100‑1 (MQ=255) tCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCGCCACAACCtttttn < 2:1826188/100‑2 (MQ=255) gCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAtc < 2:329252/100‑1 (MQ=255) ggTATCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAtctc < 2:3467346/100‑1 (MQ=255) tttCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAtctctc < 1:1809904/100‑1 (MQ=255) tttCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAAtctctc < 2:538531/100‑1 (MQ=255) tttCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCAATTAAATCAGCATTAACGTTCACCACAACCTTTTTAAtctctc > 1:2012523/1‑100 (MQ=255) tttCGAATTCTGCAGACAGCGTTTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAATCCATAAAATCATCCTTAACCATCACCACAACCTTTTTAAtc > 2:2918328/1‑96 (MQ=255) ttCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTcc > 2:80453/1‑100 (MQ=255) cGAATTCTGCAGACTGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAGTCTCTCCa < 2:3162774/99‑1 (MQ=255) cGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTACAACGAACTAAGTTTTACGACATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAg < 2:129173/100‑1 (MQ=255) aagaTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACAACAACCTTTTTAATCTCTCCAg > 2:3909312/4‑100 (MQ=255) agaTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCa > 2:2601803/3‑98 (MQ=255) gaTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACAACAACCTTTTTAATCTCTTCAGGc > 1:323337/2‑100 (MQ=255) aaTTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATATTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGACTTAACATTCACAAAAACATTTTTAAtatatcaa > 2:2221447/1‑90 (MQ=255) aTTCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTACCCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGc > 1:3787961/1‑99 (MQ=255) ttCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTc > 1:1420141/1‑100 (MQ=255) ttCTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTc > 2:1139436/1‑100 (MQ=255) cTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGGTTTAAGCTATGAAATCTGCTTTAACCTTCACCAAACCCTTTTTAATCGCTCCAGGCTccc > 2:2356028/1‑98 (MQ=255) cTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGc > 2:4187666/1‑100 (MQ=255) cTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGc > 1:2529433/1‑100 (MQ=255) cTGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACAACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCg > 2:2129849/1‑99 (MQ=255) tGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGcc > 1:3042040/1‑100 (MQ=255) tGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGc > 2:655019/1‑99 (MQ=255) tGCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGcc > 1:2154472/1‑100 (MQ=255) gCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCg > 1:1134411/1‑100 (MQ=255) gCAGACACTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCg > 1:3067678/1‑100 (MQ=255) aGACAGTGTCTCCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAACTCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCg < 2:3806171/98‑1 (MQ=255) gACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACa > 1:3879188/1‑100 (MQ=255) cAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAAc < 1:3039778/100‑1 (MQ=255) | GATGAGAAACGACTCGCAGATGAACTCGTTCGAACACAGGCGGTGCTAGAGGAAGGCTATAGACGCCGTTAATTTCAGCGGTTTCGAATTCTGCAGACAGTGTCTGCAGAATCTTTAAAACGAACTAAGTTTTAAGCCATTAAATCAGCCTTAACCTTCACCACAACCTTTTTAATCTCTCCAGGCTCGCCGACAACG > NC_000913/3368883‑3369080 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |