| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 721,009 | T→A | 16.3% | intergenic (+169/+47) | ybfK → / ← kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 721,009 | 0 | T | A | 16.3% | 471.7 / 71.7 | 177 | intergenic (+169/+47) | ybfK/kdpE | uncharacterized protein/response regulator in two‑component regulatory system with KdpD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (54/94); new base A (16/13); total (70/107) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.54e-02 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 194 total aligned reads displayed.
ATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGC > NC_000913/720910‑721108 | aTCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttatt < 2:3744298/100‑1 (MQ=255) cAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTCTTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattat > 1:1001212/1‑100 (MQ=255) cAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGtatttatt > 2:1271026/1‑98 (MQ=255) aaTCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATttattatt > 2:3225513/1‑100 (MQ=255) cTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGTTAAAAAGCCGTATTTATTATTACg < 2:108440/100‑1 (MQ=255) tAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGc < 2:1883737/100‑1 (MQ=255) tAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGc < 2:917596/100‑1 (MQ=255) atttatttAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGCATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt > 1:2981048/1‑100 (MQ=255) atttatttAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCtt < 2:2454507/100‑1 (MQ=255) tttatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCttt < 2:1205571/100‑1 (MQ=255) tttatttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCttt < 1:1290896/100‑1 (MQ=38) tttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATAGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttat < 2:3342550/100‑5 (MQ=37) ttaATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTAGTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatc < 2:3357067/100‑6 (MQ=37) taATGATGAGCTTTTTATTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatct < 2:15337/100‑7 (MQ=25) taATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatct < 2:3268696/100‑7 (MQ=37) taATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGAATAAAATAAAAAGCTGTATTTATTATTACGGCTttaatt < 2:295079/98‑1 (MQ=255) aaTGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatctt < 1:3597887/100‑8 (MQ=37) aaTGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTAATAATAAATACGGCtttttatct < 1:2244991/99‑7 (MQ=37) atgatgAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATtaata < 2:1811948/100‑1 (MQ=255) atgatgAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATGTTTGTGGGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACCGCTTTAATtaata > 2:1004054/1‑100 (MQ=255) gatgaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATaaa > 1:328875/1‑100 (MQ=255) gaGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAagg > 2:2640022/1‑100 (MQ=255) aGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggc < 1:1411929/100‑1 (MQ=255) ttttACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcaggc < 1:237569/100‑1 (MQ=255) ttttACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAaggcaggc < 1:606352/100‑1 (MQ=255) tACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGt > 2:3521534/1‑100 (MQ=255) tACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGt < 2:11318/100‑1 (MQ=255) aCTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTGTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTa > 1:4054328/1‑100 (MQ=255) tCAGTAATATAAAATATTGAATTTTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTAtt < 2:1744573/100‑1 (MQ=255) cAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTa > 1:2933730/1‑100 (MQ=255) cAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTa > 1:577910/1‑100 (MQ=255) gTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTaa > 2:974802/1‑99 (MQ=255) tataAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAAttn < 1:1867405/100‑2 (MQ=255) ataAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTTAAATTa > 2:777105/1‑99 (MQ=255) aaaaTATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAata > 1:1791345/1‑100 (MQ=255) atatTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTc > 1:1063308/1‑100 (MQ=255) tatTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCa < 1:1574386/100‑1 (MQ=255) tGAATTGTTATTTTTGTTTGTTGTTTAAGATAAATAGCCGTTTTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGTCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg < 2:221875/100‑1 (MQ=255) tGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg < 1:2051533/100‑1 (MQ=255) tGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAg < 1:1169228/100‑1 (MQ=255) tGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTAAGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCaaa < 1:2742936/99‑1 (MQ=255) gAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGc < 2:2703289/100‑1 (MQ=255) aaTTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCa < 2:3175012/100‑1 (MQ=255) ttGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAATATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATa < 2:572783/100‑1 (MQ=255) ttGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCAt < 2:1332561/99‑1 (MQ=255) ttGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATa < 1:97850/100‑1 (MQ=255) ttGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATa < 1:2096559/100‑1 (MQ=255) tATTTTTTTTTTTTTTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTATGTTTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTTTTTAAATTAATAtttatttttt > 2:1428815/1‑87 (MQ=255) tATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAcc > 2:4107172/1‑100 (MQ=255) tATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAAcc < 2:1181294/100‑1 (MQ=255) aTTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCg > 1:3870495/1‑100 (MQ=255) ttttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGAt < 2:4159719/100‑1 (MQ=255) tttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGAt > 1:433070/1‑99 (MQ=255) tttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATa < 2:3752914/100‑1 (MQ=255) tttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATa < 2:726559/100‑1 (MQ=255) tttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATa < 1:3766515/100‑1 (MQ=255) ttGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAg < 1:2181777/100‑1 (MQ=255) gtgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGcc < 2:2200371/100‑1 (MQ=255) tgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCa < 1:2646232/100‑1 (MQ=255) tgtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCa > 1:1234035/1‑100 (MQ=255) tgagttgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCa > 2:1778088/4‑100 (MQ=255) gtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCaa > 2:2867365/1‑100 (MQ=255) gtgtTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCa < 2:470797/99‑1 (MQ=255) tgttgtTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAAt > 1:203069/1‑100 (MQ=255) tgttgtTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAAt < 2:2295466/100‑1 (MQ=255) gttgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATa < 1:694976/100‑1 (MQ=255) tgttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATAcc < 1:1099705/100‑1 (MQ=255) gttTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATAATCCAAGCATAAACCGAGAGCCAATAc > 2:3882185/1‑98 (MQ=255) tttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACGGATAGCCAATa > 2:3434455/1‑96 (MQ=255) tttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg > 1:1527822/1‑100 (MQ=255) tttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCgg < 1:3320257/100‑1 (MQ=255) ttAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGt < 1:3106583/100‑1 (MQ=255) tAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGtt < 1:3406692/100‑1 (MQ=255) tAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGtt < 1:760694/100‑1 (MQ=255) aaGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGttt < 1:1182479/100‑1 (MQ=255) aGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTc < 1:2254589/100‑1 (MQ=255) aGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTc > 1:909157/1‑100 (MQ=255) gATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCa < 1:2561747/100‑1 (MQ=255) aTAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTTAATGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg < 2:2762395/100‑1 (MQ=255) aTAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg > 2:3120107/1‑100 (MQ=255) aTAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg < 1:3616429/100‑1 (MQ=255) aTAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg < 2:3639807/100‑1 (MQ=255) tAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAg < 2:2477405/99‑1 (MQ=255) attaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCCAAGCATAAACCGATAGCCATGACCGGGTTCAGt > 1:1989235/4‑100 (MQ=25) ttaaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTa > 2:451443/3‑100 (MQ=37) aaaaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTaa > 1:1732070/1‑100 (MQ=255) aaaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAAt > 1:880081/1‑100 (MQ=37) aaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCCTAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATg < 1:3976352/100‑1 (MQ=255) aaGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATg < 1:1603834/100‑1 (MQ=255) aaGCCGTAATAATAAATACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATg > 2:1076633/1‑100 (MQ=37) gCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGaa > 1:4078738/1‑100 (MQ=255) tatttattATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATgg > 1:808295/1‑100 (MQ=255) tatttattATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATgg < 2:308742/100‑1 (MQ=255) tttattATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGc > 2:3857989/1‑99 (MQ=255) tttattATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCg > 1:35234/1‑100 (MQ=255) ttattattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGt < 2:1595569/100‑1 (MQ=255) tattattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTTAGTAATGAAATGTCGTg > 2:1976509/1‑100 (MQ=255) ttattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTggg < 2:2217778/100‑1 (MQ=255) tattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTgggc < 2:3554940/100‑1 (MQ=255) tattaCGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTgggc > 1:1747722/1‑100 (MQ=255) | ATCAATCTTAATTTATTTAATGATGAGCTTTTTACTCAGTAATATAAAATATTGAATTGTTATTTTTGTGTGTTGTTTAAGATAAAAAGCCGTATTTATTATTACGGCTTTAATTAATAAAAGGCAGGCTGTATTAAAATTAATATTCAAAGCATAAACCGATAGCCAATACCGGTTTCAGTAATGAAATGGCGTGGGC > NC_000913/720910‑721108 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |