| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| JC | NC_000913 | 4,215,179 | Δ4 bp | coding (900‑903/930 nt) | metA → | homoserine O‑transsuccinylase |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_000913 | = 4215178 | 7 (0.070) | 114 (1.150) | 77/196 | 0.1 | 94.6% | coding (899/930 nt) | metA | homoserine O‑transsuccinylase |
| ? | NC_000913 | 4215183 = | 6 (0.060) | coding (904/930 nt) | metA | homoserine O‑transsuccinylase | |||||
Only 100 of 124 total aligned reads displayed.
ATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTA > NC_000913/4215079‑4215277 | aTGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGA > 2:1493645‑M1/1‑100 (MQ=255) gATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcg > 2:1020756‑M1/1‑98 (MQ=255) gATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATc > 2:988832/1‑100 (MQ=255) aTCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcgg > 1:1530729‑M1/1‑97 (MQ=255) ccGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggca > 2:1176779‑M1/1‑95 (MQ=255) ccGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggca > 2:412755‑M1/1‑95 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acacCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatcc < 1:1739013‑M1/100‑15 (MQ=255) cacCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatcca > 1:1246194‑M1/1‑85 (MQ=255) acCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaa > 1:1140248‑M1/1‑84 (MQ=255) ccGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaac > 2:1147689‑M1/1‑83 (MQ=255) ccGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaac > 2:1616126‑M1/1‑83 (MQ=255) ccGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaac < 1:10723‑M1/100‑18 (MQ=255) ccGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaac > 2:428467‑M1/1‑83 (MQ=255) cgcgAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacg > 1:2141388‑M1/1‑82 (MQ=255) cgagcgagCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgct > 1:1395666‑M1/1‑80 (MQ=255) cttccgatctcgtagtcacggTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctgg < 1:353116‑M1/90‑23 (MQ=255) agcgagcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctgg < 1:1614269‑M1/100‑23 (MQ=255) cgagcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggat < 1:517695‑M1/100‑25 (MQ=255) cgagcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggat < 1:906507‑M1/100‑25 (MQ=255) gcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaa > 2:781778‑M1/1‑73 (MQ=255) ggCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatct > 1:2221127‑M1/1‑70 (MQ=255) gCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatctt < 2:1664922‑M1/100‑32 (MQ=255) cGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggagatcggaga > 2:353117‑M1/1‑68 (MQ=255) tAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctg < 1:1070446‑M1/100‑35 (MQ=255) tctcaCGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgt < 1:356101‑M1/98‑36 (MQ=255) aGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgt > 2:924241‑M1/1‑65 (MQ=255) gTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtg < 1:969191‑M1/100‑37 (MQ=255) tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtga < 1:714650‑M1/100‑38 (MQ=255) cACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtaga > 2:356102‑M1/1‑62 (MQ=255) ctcttccgatctgtttaccaaCTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatag < 1:841342‑M1/90‑41 (MQ=255) cGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatag > 2:1993294‑M1/1‑60 (MQ=255) cGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatag > 2:1192102‑M1/1‑60 (MQ=255) cGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatag < 2:2000280‑M1/100‑41 (MQ=255) tAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatagtcg > 2:1384538‑M1/1‑57 (MQ=255) aTTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatagtcgat < 1:428466‑M1/100‑46 (MQ=255) ttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatagtcgatcg < 2:2158096‑M1/100‑48 (MQ=255) ttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatagtcgatcg < 2:1530736‑M1/100‑48 (MQ=255) ttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatagtcgatcg < 2:1566564‑M1/100‑48 (MQ=255) ttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatagtcgatcg < 2:30383‑M1/100‑48 (MQ=255) aCTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaaggctggattaatcttctgtgatagtcgatcgtt > 1:1826075‑M1/1‑51 (MQ=255) tGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGAcggcacatgaatccaacgctggattaatcttctgtgatagtcgatcgttaa > 1:627949‑M1/1‑49 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |