| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 757,838 | Δ1 bp | coding (150/717 nt) | sdhB → | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 757,838 | 0 | G | . | 98.8% | 368.0 / ‑2.7 | 81 | coding (150/717 nt) | sdhB | succinate dehydrogenase, FeS subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); major base . (47/32); minor base T (1/0); total (48/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GTATGCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGCAC > NC_000913/757744‑757932 | gTATGCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTccgc < 1:399560/100‑1 (MQ=255) aTGCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTccgcc < 1:1094657/99‑1 (MQ=255) gCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCt > 1:2613654/1‑100 (MQ=255) cAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTc > 2:2084244/1‑100 (MQ=255) cAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTc > 1:580/1‑100 (MQ=255) cAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTc > 2:1136911/1‑100 (MQ=255) aGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTcc < 1:1101447/100‑1 (MQ=255) ggATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCt > 2:2575146/1‑100 (MQ=255) cacCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGAAATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTg < 1:2629944/100‑1 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGaa > 1:2303867/1‑100 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGaa > 1:2303644/1‑100 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGaa < 2:1131023/100‑1 (MQ=255) cccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGaa > 1:955674/1‑100 (MQ=255) ccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAg > 1:1341551/1‑100 (MQ=255) ccTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGCATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAg < 1:702336/100‑1 (MQ=255) cTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAgg < 1:2414050/100‑1 (MQ=255) ggAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGgtg > 2:1556404/1‑100 (MQ=255) aaGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGgtgtg > 1:2352066/1‑100 (MQ=255) aGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGgtgtgt > 1:2568180/1‑100 (MQ=255) gCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGtgtgtg < 2:1121579/100‑1 (MQ=255) gCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGtgtgtg < 2:665894/100‑1 (MQ=255) cGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGc < 1:63725/100‑1 (MQ=255) ggATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCGAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGT‑TTTCCGCCGCTCCTGGCGTGAAGGTGGGTGCg > 2:1223413/1‑100 (MQ=255) gAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTc > 2:373328/1‑100 (MQ=255) aaGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTcc > 2:1278930/1‑100 (MQ=255) aGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCg > 2:897599/1‑100 (MQ=255) aGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCg < 1:2551276/100‑1 (MQ=255) ggTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGa > 1:1791664/1‑100 (MQ=255) ggTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGa > 2:293664/1‑100 (MQ=255) gTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGAc < 1:647304/100‑1 (MQ=255) tCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACg < 1:900787/100‑1 (MQ=255) cgcgACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACgg > 2:1182654/1‑100 (MQ=255) cgcgACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACgg < 1:129668/100‑1 (MQ=255) cgcgACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACgg > 2:1629628/1‑100 (MQ=255) cgACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTc < 2:2009768/100‑1 (MQ=255) gACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCt < 1:1467817/100‑1 (MQ=255) tgatgCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAAc < 1:76045/100‑1 (MQ=255) tgatgCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAAc > 2:486883/1‑100 (MQ=255) gatgCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACa > 1:333218/1‑100 (MQ=255) tgctgcTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATg > 1:2515307/1‑100 (MQ=255) gctgctGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAACGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGa < 2:176683/100‑1 (MQ=255) tgctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAAc > 1:1341066/1‑100 (MQ=255) gctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACg > 1:21030/1‑100 (MQ=255) gctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACg > 1:199348/1‑100 (MQ=255) gctgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACg < 2:1341060/100‑1 (MQ=255) cttgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACg < 1:1543728/98‑1 (MQ=255) tgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGc > 1:2571191/1‑100 (MQ=255) tgGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGAC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACgag > 2:1543722/1‑98 (MQ=255) ggATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCa > 2:1154331/1‑100 (MQ=255) ggATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCa < 1:159351/100‑1 (MQ=255) ggATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCa > 2:684386/1‑100 (MQ=255) ggATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCa > 1:619997/1‑100 (MQ=255) aTGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAg > 1:172428/1‑100 (MQ=255) gcTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATg < 1:1136915/100‑1 (MQ=255) tATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTc < 1:1802487/100‑1 (MQ=255) aTCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCt > 1:1399049/1‑100 (MQ=255) tCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTg > 2:1853357/1‑100 (MQ=255) ccAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTgg > 2:958821/1‑100 (MQ=255) ccAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTgg > 2:363081/1‑100 (MQ=255) aGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGcc > 2:1606030/1‑100 (MQ=255) gCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCt > 2:860889/1‑100 (MQ=255) cTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTg < 1:1556410/100‑1 (MQ=255) aaaaGAGAAAGATACCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTa > 2:1747567/1‑100 (MQ=255) aaGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTAt < 1:2183403/100‑1 (MQ=255) aaGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTAtt > 1:100417/1‑100 (MQ=255) aaGAGAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTAtt < 1:712485/100‑1 (MQ=255) agagAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTa > 1:55045/1‑100 (MQ=255) agagAAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTa > 2:593643/1‑100 (MQ=255) agaAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAcc < 2:2287263/100‑1 (MQ=255) gaAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAcgc > 2:1712937/1‑98 (MQ=255) gaAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAccc < 1:1697386/100‑1 (MQ=255) gaAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAccc < 2:1815662/100‑1 (MQ=255) gaAAGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAccc < 1:1182659/100‑1 (MQ=255) aaaGATCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTAcccc > 2:2824723/1‑100 (MQ=255) tCCCAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGAttt > 1:1863825/1‑100 (MQ=255) ccAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCg > 1:2271199/1‑100 (MQ=255) cAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCgg > 1:2557887/1‑100 (MQ=255) cAGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCgg > 2:1832607/1‑100 (MQ=255) aGCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGc < 1:1797941/100‑1 (MQ=255) gCCTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGCa < 2:955671/100‑1 (MQ=255) ccTGTC‑TTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGCAc < 2:172425/100‑1 (MQ=255) | GTATGCAGGATTACACCCTGGAAGCGGATGAAGGTCGCGACATGATGCTGCTGGATGCGCTTATCCAGCTAAAAGAGAAAGATCCCAGCCTGTCGTTCCGCCGCTCCTGCCGTGAAGGTGTGTGCGGTTCCGACGGTCTGAACATGAACGGCAAGAATGGTCTGGCCTGTATTACCCCGATTTCGGCAC > NC_000913/757744‑757932 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |