| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1425324 | 117 (1.040) | 7 (0.060) | 7/198 | 13.1 | 5.5% | intergenic (+85/‑53) | trkG/ynaK | Rac prophage; potassium transporter subunit/Rac prophage; conserved protein |
| ? | NC_000913 | = 1425350 | 123 (1.090) | intergenic (+111/‑27) | trkG/ynaK | Rac prophage; potassium transporter subunit/Rac prophage; conserved protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 120 total aligned reads displayed.
TTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTG > NC_000913/1425225‑1425421 | ttttGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCg < 1:2274996/100‑1 (MQ=255) tGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTcc < 2:1731417/100‑1 (MQ=255) gcgcTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTcccc < 2:1886057/100‑1 (MQ=255) gcgcTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTcccc < 2:641060/100‑1 (MQ=255) cgcTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCa < 1:1349052/100‑1 (MQ=255) gcTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAg > 2:2256120/1‑100 (MQ=255) gcTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAg < 2:2139459/100‑1 (MQ=255) cTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGt > 2:2476654/1‑100 (MQ=255) cTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGt < 1:402480/100‑1 (MQ=255) cTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACATTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGt < 1:1721369/100‑1 (MQ=255) ccTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAg < 2:711052/100‑1 (MQ=255) ccTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAg < 2:21523/100‑1 (MQ=255) tAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCagcagcc < 2:683878/100‑2 (MQ=255) tAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCa > 2:2648624/1‑100 (MQ=255) aaTATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCAc > 2:1621095/1‑100 (MQ=255) atatatTGCTGATTTATAATTGTGATTTTAATATTATGTTGACTTACTCATTGATCCCATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACt < 2:1114040/100‑1 (MQ=255) tatatGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTg > 2:1300736/1‑100 (MQ=255) tatGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgc < 2:2429560/100‑1 (MQ=255) tatGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgc < 1:1969872/100‑1 (MQ=255) atGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgct < 2:2154744/100‑1 (MQ=255) atGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgct > 2:2499710/1‑100 (MQ=255) ggCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgctgc > 1:2310538/1‑100 (MQ=255) gCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgctgct > 1:1789818/1‑100 (MQ=255) gCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGgctgct > 1:2714258/1‑100 (MQ=255) cTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGctgctg < 1:1189763/100‑1 (MQ=255) tGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgg < 2:2511662/100‑1 (MQ=255) tGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgg < 1:2322768/100‑1 (MQ=255) gATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTggg > 1:766487/1‑100 (MQ=255) aTTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgggg < 2:950170/100‑1 (MQ=255) aTTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgggg < 1:1285067/100‑1 (MQ=255) aTTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgggg < 1:1346116/100‑1 (MQ=255) aTTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTgggg < 2:2201232/100‑1 (MQ=255) ttATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTg < 2:1622828/100‑1 (MQ=255) ataATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCg < 1:1743137/100‑1 (MQ=255) taATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGt > 2:596255/1‑100 (MQ=255) aaTTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGtt > 1:806196/1‑100 (MQ=255) aaTTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGtt > 2:1708441/1‑100 (MQ=255) aTTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGttt > 1:2489037/1‑100 (MQ=255) gtgAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAt < 2:1789809/100‑1 (MQ=255) gtgAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAt < 1:1447557/100‑1 (MQ=255) gtgAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAt < 1:489977/100‑1 (MQ=255) tgAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAtt < 1:607144/100‑1 (MQ=255) tgAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTAtt < 1:1621101/100‑1 (MQ=255) gAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTc < 2:273399/100‑1 (MQ=255) gAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTc < 2:2173045/100‑1 (MQ=255) gAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGAGTGCGTTTTATTc < 2:1179622/100‑1 (MQ=255) tttAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATa < 1:1562115/100‑1 (MQ=255) tttAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATa < 1:699833/100‑1 (MQ=255) tttAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTCCGTTTTATTCaaa < 1:1911316/100‑3 (MQ=255) tAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATaaa > 1:1706317/1‑100 (MQ=255) aaTATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAg < 1:803990/100‑1 (MQ=255) aaTATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAg > 2:106574/1‑100 (MQ=255) tattatGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCa < 2:600001/100‑1 (MQ=255) attatGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCaa < 2:961090/100‑1 (MQ=255) tatGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAgg < 2:2315180/100‑1 (MQ=255) tGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCt > 1:1557225/1‑100 (MQ=255) tGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCt > 1:2576159/1‑100 (MQ=255) tGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCt > 2:195789/1‑100 (MQ=255) tcttccgatctcaTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTg < 2:1194851/91‑1 (MQ=255) gTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTg < 2:100719/100‑1 (MQ=255) gTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTg < 1:1300742/100‑1 (MQ=255) gTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTg > 2:2317089/1‑100 (MQ=255) gTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTg < 2:2310527/100‑1 (MQ=255) tctcactcaTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATg > 2:1961561/2‑100 (MQ=255) actcactcATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATg > 1:165965/1‑100 (MQ=255) ctcactcaTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATg < 1:2708998/99‑1 (MQ=255) cactcaTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGc > 2:2185970/1‑100 (MQ=255) cactcaTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGc < 2:2535640/100‑1 (MQ=255) cactcaTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGc > 2:1234470/1‑100 (MQ=255) cactcaTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGc < 1:1936951/100‑1 (MQ=255) actcaTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCg > 2:2299410/1‑100 (MQ=255) aTTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGaa > 2:299942/1‑100 (MQ=255) ttGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGaaa > 1:337388/1‑100 (MQ=255) tGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAAt < 1:1119301/100‑1 (MQ=255) gATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAAtt > 2:804244/1‑100 (MQ=255) gATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAAtt < 2:766484/100‑1 (MQ=255) ccAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTaaa < 1:2317100/100‑1 (MQ=255) tACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATa < 2:357915/100‑1 (MQ=255) tACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATa < 2:1095394/100‑1 (MQ=255) tACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATa > 2:1727820/1‑100 (MQ=255) ccTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGt > 1:678307/1‑100 (MQ=255) ccTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGt > 1:154258/1‑100 (MQ=255) aCTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTAt > 1:915429/1‑100 (MQ=255) tACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGcc < 1:1937578/100‑1 (MQ=255) tACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGcc < 1:2059526/100‑1 (MQ=255) cAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGccc < 1:1245495/98‑1 (MQ=255) cAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCAt < 1:776332/100‑1 (MQ=255) aGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCAtt > 2:823424/1‑100 (MQ=255) aGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGAGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCAtt > 1:825378/1‑100 (MQ=255) gCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTa < 1:862632/100‑1 (MQ=255) gCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTa < 1:2499722/100‑1 (MQ=255) ccTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGaa < 1:596258/100‑1 (MQ=255) ccTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGaa > 1:1781048/1‑100 (MQ=255) ccTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGaa > 1:2483495/1‑100 (MQ=255) ccTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGaa > 1:2483543/1‑100 (MQ=255) tCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAAtt > 1:2074629/1‑100 (MQ=255) ccGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTg > 2:354270/1‑100 (MQ=255) ccGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTg < 1:1532185/100‑1 (MQ=255) ccGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTg < 1:2347673/100‑1 (MQ=255) ccGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTg < 1:354274/100‑1 (MQ=255) | TTTTGGCGCTCCTAATATATGGCTGATTTATAATTGTGAGTTTAATATTATGTTGACTCACTCATTGATCCAATACCTAACTTTACCAGCAACACCTCCGTCCCCAGTAGCACTGGCTGCTGGGGTGCGTTTTATTCATAAAGCAAGGCTGTATGAGCGAGAAATTAAAGATAGTCTATCGCCCATTACAAGAATTG > NC_000913/1425225‑1425421 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |