| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,767,507 | (C)7→8 | intergenic (+152/‑203) | rnlB → / → yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,767,500 | 1 | . | C | 95.6% | 391.0 / 12.0 | 117 | intergenic (+145/‑210) | rnlB/yfjP | CP4‑57 prophage; uncharacterized protein/CP4‑57 prophage; 50S ribosome‑binding GTPase family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (2/3); new base C (52/56); total (57/60) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.30e-01 | |||||||||||
Only 100 of 131 total aligned reads displayed.
TGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCT > NC_000913/2767402‑2767594 | tGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑c < 2:2324301/100‑1 (MQ=255) atatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑ccc < 2:2252083/100‑1 (MQ=255) atatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑ccc < 2:3008624/100‑1 (MQ=255) tatTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTG‑CCGGCTCAGGAAAACGTCTTCCCCAGTACACCCCCGACCGTATTT‑‑cccc > 2:1260529/1‑100 (MQ=255) atTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACTCCCCCTCACAATATA‑CTGCATAAGGAACACATATTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑ccc > 1:2223171/1‑98 (MQ=255) ttAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑cccccc < 2:971509/100‑1 (MQ=255) ttAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACACCCGCTCAAAGCGTC‑GTGCAGAGGAGCCACGTTATCGACAGAGCACCAAAGACTAAAGTT‑‑ccacca > 2:1167476/1‑99 (MQ=255) aaCTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑cccccccc < 2:2995909/100‑2 (MQ=255) tGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCCCAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑CCCCCCC‑ctt < 1:70545/98‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAAc < 2:2514851/100‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAAc < 2:417735/100‑1 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACATTTTCCCCTGTGCACAAACGACTACATAT‑‑cccaaatcccaa > 2:2095921/1‑88 (MQ=255) ccAATATGATCAAATAGCATTAACACCCCCTCCCAA‑GTCACTGCATAGGACTCCCCCTTTCCCCTGTGCATACACAACTAACTTTA‑CCTTCCC‑TTTaact > 1:2262983/1‑98 (MQ=255) atGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTtctc < 1:1013660/100‑1 (MQ=255) tGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAAGCAACACGTTTCCCCCTGTGCATCCACGCCCAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTtctc > 1:2822159/1‑99 (MQ=255) gATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCaa < 2:2634571/100‑1 (MQ=255) gATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCaa < 1:3058832/100‑1 (MQ=255) aTAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGt < 2:296831/100‑1 (MQ=255) tAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTc < 2:3039757/100‑1 (MQ=255) gCATTAACCCCCCCTTACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCAc < 2:3009636/100‑1 (MQ=255) aTTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCa < 2:1155251/100‑1 (MQ=255) cccccgcTGACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTTAACTTCTCAATTACGGCACCAAtttt > 1:310509/1‑100 (MQ=255) ccccTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 2:1870040/100‑1 (MQ=255) ccccTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTg < 2:495383/100‑1 (MQ=255) ccTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGa < 2:458724/100‑1 (MQ=255) cTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaa > 1:1616923/1‑100 (MQ=255) tCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGaaa > 2:87715/1‑100 (MQ=255) cacaACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGGACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAAt > 1:1640276/1‑100 (MQ=255) acaACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATc < 2:650520/100‑1 (MQ=255) caACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATcc < 2:551181/100‑1 (MQ=255) aaCGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTTAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCt < 1:18277/100‑1 (MQ=255) aCGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTTAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATTATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa < 1:1193962/100‑1 (MQ=255) cGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTat > 1:2500297/1‑100 (MQ=255) cGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAACTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTa < 2:2635767/99‑1 (MQ=255) gatcttGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTat < 2:1796090/95‑1 (MQ=255) gTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatg > 1:3011688/1‑100 (MQ=255) tC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatga < 2:88025/100‑1 (MQ=255) cTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg > 1:1683206/1‑100 (MQ=255) cTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg > 1:541166/1‑100 (MQ=255) cTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatg < 1:1381274/97‑1 (MQ=255) cTGCATAGCGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTatgatg < 1:2808878/100‑1 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc > 1:391664/1‑100 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc < 2:392909/100‑1 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc > 2:36802/1‑100 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc < 1:2951075/100‑1 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc < 2:333752/100‑1 (MQ=255) tGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTA‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGc < 1:2951846/100‑1 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc < 2:268694/100‑1 (MQ=255) gCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGcc < 2:268972/100‑1 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt > 1:457907/1‑100 (MQ=255) tAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCttt > 2:929004/1‑100 (MQ=255) aGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTc > 1:1060917/1‑100 (MQ=255) aGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTc > 2:1564978/1‑100 (MQ=255) aGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTc > 1:1802376/1‑100 (MQ=255) gggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 2:1978522/1‑100 (MQ=255) gggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 2:2579551/1‑100 (MQ=255) gggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTcc > 2:137128/1‑100 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc > 1:128763/1‑100 (MQ=255) ggAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc < 1:927559/100‑1 (MQ=255) gAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTGCCCCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTccc < 1:517955/100‑1 (MQ=255) gAACACGTTTGCCCCTGTGCACCCACGACTAATTTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCg < 2:778763/100‑1 (MQ=255) aaCACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCgg < 2:2670760/100‑1 (MQ=255) acacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGt > 2:1777962/1‑100 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACTACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa < 1:2920367/100‑1 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAGATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTa > 2:466556/1‑100 (MQ=255) cacGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCgg > 1:2674262/1‑98 (MQ=255) cattttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 2:2063977/3‑100 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaag > 1:174510/1‑99 (MQ=255) cGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTaaa > 1:1964439/1‑100 (MQ=255) gTTTTCCCCTGTGCACCCTCGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAAt < 2:2095573/100‑1 (MQ=255) gTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAAt > 1:689133/1‑100 (MQ=255) ttttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑CCCCCCCATTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATg < 2:2151438/100‑1 (MQ=255) ttCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGACGCCTTTCCCGGTAAATGGt < 2:78021/100‑1 (MQ=255) tCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTg < 2:1693773/100‑1 (MQ=255) ccccTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGc < 1:2551468/100‑1 (MQ=255) ccTGTGCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCtg > 2:2235934/1‑100 (MQ=255) gtgCACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGa > 1:1101470/1‑100 (MQ=255) gCACCCACGACTAAATTT‑‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGtt > 2:2629368/1‑100 (MQ=255) cACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGa > 1:265540/1‑97 (MQ=255) cACCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAgn < 2:1385477/99‑2 (MQ=255) aCCCACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTc < 2:170353/100‑1 (MQ=255) cccATGATTATATTTC‑CCCCCCC‑TCTTAACTTCTCAATAAGGTCACCATTTTTCTGGAAATACTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTACTGTGAGTTCa < 1:325904/100‑1 (MQ=255) cccACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa > 2:2524730/1‑100 (MQ=255) cccACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCa > 2:1270257/1‑100 (MQ=255) ccACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAg > 2:1237888/1‑100 (MQ=255) cACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGa > 2:2997850/1‑100 (MQ=255) cACGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGa > 2:1984148/1‑100 (MQ=255) cGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa > 1:90570/1‑100 (MQ=255) cGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa > 1:1251363/1‑100 (MQ=255) cGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa > 1:2791410/1‑100 (MQ=255) cGACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGaaa > 1:2264792/1‑100 (MQ=255) gACTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAg > 2:2842362/1‑100 (MQ=255) aCTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAg < 1:1739489/99‑1 (MQ=255) aCTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGa < 2:312848/100‑1 (MQ=255) cTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt < 1:2063969/100‑1 (MQ=255) cTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt > 1:2475646/1‑100 (MQ=255) cTAAATTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGAt > 1:2593711/1‑100 (MQ=255) aaaTTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTc > 2:1818523/1‑100 (MQ=255) aaaTTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTc > 1:1732280/1‑100 (MQ=255) aaaTTTC‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTc > 2:1415428/1‑100 (MQ=255) | TGATATTAACTTGTCCAATATGATCAAATAGCATTAACCCCCCCTCACAACGTC‑CTGCATAGGGAACACGTTTTCCCCTGTGCACCCACGACTAAATTT‑‑CCCCCCC‑TTTAAACTTCTCAATAATGTCACCAATTTTCTGGAAATCCTATGATGCCTTTCCCGGTAAATGGTGCTGTGAGTTCAGAAAGATTCT > NC_000913/2767402‑2767594 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |