| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 2,199,587 | G→A | pseudogene (266/948 nt) | yehH → | DUF4132 family pseudogene; defective yehI paralog; molybdate metabolism regulator, first fragment; molybdate metabolism regulator, second fragment 2; yehI' molR mutations have phenotypes and the N‑terminal molR fragment of yehI' may be expressed and may have retained or evolved MolR function |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 2,199,587 | 0 | G | A | 98.8% | 280.6 / ‑4.4 | 82 | pseudogene (266/948 nt) | yehH | DUF4132 family pseudogene; defective yehI paralog; molybdate metabolism regulator, first fragment; molybdate metabolism regulator, second fragment 2; yehI' molR mutations have phenotypes and the N‑terminal molR fragment of yehI' may be expressed and may have retained or evolved MolR function |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/1); new base A (36/45); total (36/46) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.07e-01 | |||||||||||
CGAACGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCGCCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGC > NC_000913/2199491‑2199681 | cGAACGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGcaccg > 1:596390/1‑100 (MQ=255) gAACGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGcaccgc > 2:2335802/1‑100 (MQ=255) aaCGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGcaccgcc < 2:2726693/100‑1 (MQ=255) aaCGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGcaccgcc > 1:2426062/1‑100 (MQ=255) aaCGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGcaccgcc < 1:1320112/100‑1 (MQ=255) cGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGcaccgccgc > 2:510037/1‑100 (MQ=255) tGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTgg < 2:1452871/100‑1 (MQ=255) tGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTgg < 2:2052195/100‑1 (MQ=255) ggTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCg > 1:937873/1‑100 (MQ=255) gTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGc > 2:1654931/1‑100 (MQ=255) ttAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCGCCGCCGCTGGTCGCt < 1:668410/100‑1 (MQ=255) tAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTg < 1:720450/100‑1 (MQ=255) tAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTg < 1:129417/100‑1 (MQ=255) tAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTg < 1:1511676/100‑1 (MQ=255) tAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTg < 1:2361210/100‑1 (MQ=255) tAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTg > 1:62686/1‑100 (MQ=255) ccGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGaa > 1:223675/1‑100 (MQ=255) cGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGaaa < 2:1546091/100‑1 (MQ=255) cGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGaaa < 1:1440644/100‑1 (MQ=255) cTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAAc < 2:2275482/100‑1 (MQ=255) aCAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACtt > 2:475221/1‑100 (MQ=255) aCAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACtt > 2:676098/1‑100 (MQ=255) aaaTTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTcc < 2:1135015/100‑1 (MQ=255) aaaTTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTcc < 1:134790/100‑1 (MQ=255) aaTTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCa > 2:2566794/1‑100 (MQ=255) aTTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAg < 2:2381419/100‑1 (MQ=255) tGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAGACTTCCAGc < 1:2655466/99‑1 (MQ=255) tGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGct < 2:1283826/100‑1 (MQ=255) tGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGct > 1:1193216/1‑100 (MQ=255) tGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGct < 2:2813577/100‑1 (MQ=255) gCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGctc > 2:2337379/1‑100 (MQ=255) gAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTc > 1:1040653/1‑100 (MQ=255) gAAAAAAGATGCGCGGAGGATTGCCACCCCGCCGAAAGCAAGGATGGAATCCTCGATCGTCCCGCACCGCCCCTGGTCGCTGGATCACTTGAAGCTCtt > 1:202873/1‑99 (MQ=255) aaaaaGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCt > 2:757231/1‑100 (MQ=255) aaaGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCTAGCTCTTCCTgg < 1:2647325/100‑1 (MQ=255) aaGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGt < 1:55150/100‑1 (MQ=255) aaGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGt < 2:3052172/100‑1 (MQ=255) aaGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGt < 2:2787983/100‑1 (MQ=255) aaGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGt < 1:1194206/100‑1 (MQ=255) aGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGtt < 1:2260092/100‑1 (MQ=255) ggtGCGCGTACCAACGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTg > 2:2077512/3‑100 (MQ=255) gATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTg < 1:3064388/100‑1 (MQ=255) tGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAg < 2:62686/100‑1 (MQ=255) tGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAg < 2:223675/100‑1 (MQ=255) cgTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATc > 2:1839058/1‑100 (MQ=255) gTACCATCGCCGCCCAGCAGGCAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATcc < 1:1829582/100‑1 (MQ=255) ccATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCt > 2:668196/1‑100 (MQ=255) ccATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCt < 2:1619285/100‑1 (MQ=255) ccATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCt > 2:2963109/1‑100 (MQ=255) ccATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCt > 2:1457279/1‑100 (MQ=255) cATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTg < 1:2688372/100‑1 (MQ=255) tCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGt < 1:1077125/100‑1 (MQ=255) cgccgcCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGTCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTGCCAGCTCTTCCTGGTTGTGCATCCGCTGGtt < 2:2057338/100‑1 (MQ=255) gccgccCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTc > 1:1219176/1‑100 (MQ=255) gccgccCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTc > 2:2484080/1‑100 (MQ=255) gccCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTc < 2:2132657/100‑1 (MQ=255) gccCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTc < 2:18772/100‑1 (MQ=255) cccAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCa < 2:1716116/100‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCa < 1:452732/98‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACt < 1:1778624/100‑1 (MQ=255) cagcagGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACt > 2:2679926/1‑100 (MQ=255) gcagGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACtt < 2:1399408/99‑1 (MQ=255) cagGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTaa > 1:806827/1‑100 (MQ=255) agGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAAc > 1:397412/1‑100 (MQ=255) tAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACccg > 1:1308458/1‑100 (MQ=255) gCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACccgcc > 2:1527803/1‑100 (MQ=255) gCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACccgcc > 2:2124355/1‑100 (MQ=255) gCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACccgcc > 1:907713/1‑100 (MQ=255) aaGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGt > 1:1836549/1‑100 (MQ=255) aaGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGt > 1:157275/1‑100 (MQ=255) cTGGAATCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGa > 1:2657712/1‑100 (MQ=255) cgatctgCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGAttt < 2:1054147/94‑1 (MQ=255) aTCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCGGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTgg < 1:292299/100‑1 (MQ=255) tCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTggg > 2:414193/1‑100 (MQ=255) tCCGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTggg < 2:366539/100‑1 (MQ=255) ccGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTgggg < 2:1836556/100‑1 (MQ=255) cGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTg < 1:1784391/96‑1 (MQ=255) cGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGc > 2:921393/1‑100 (MQ=255) cGCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGc < 1:757229/100‑1 (MQ=255) gCCATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGAtttagatcg > 1:1054143/1‑94 (MQ=255) cATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGtt < 1:676097/100‑1 (MQ=255) cATGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGtt < 1:475219/100‑1 (MQ=255) aTGTGCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGttt < 1:668195/100‑1 (MQ=255) tgtgCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTta > 2:341849/1‑100 (MQ=255) tgtgCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCAATTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTta > 1:1498881/1‑100 (MQ=255) gCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAg > 2:136162/1‑100 (MQ=255) gCCTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAg < 1:2963090/100‑1 (MQ=255) ccTGCACCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAgc > 2:474876/1‑100 (MQ=255) | CGAACGATGCGGTTAACCGCTACAAATTGCTGAAAAAAGATGCGCGTACCATCGCCGCCCAGCAGGTAGCAAGGCTGGAATCCGCCATGTGCCTGCGCCGCCGCTGGTCGCTGGAAAACTTCCAGCTCTTCCTGGTTGAGCATCCGCTGGTTCGTCACTTAACCCGCCGTCTGATTTGGGGCGTTTATAGC > NC_000913/2199491‑2199681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |