New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 274347 = | NA (NA) | 13 (0.110) | 6/164 | NT | NA | noncoding (803/1195 nt) | IS5 | repeat region |
? | NC_000913 | 274410 = | NA (NA) | noncoding (740/1195 nt) | IS5 | repeat region |
Only 100 of 241 total aligned reads displayed.
GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274452‑274347 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgccccTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCT > NC_000913/274410‑274508 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 2:917922/1‑100 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG < 1:2542403/100‑1 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 1:2438894/1‑100 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 1:38540/1‑100 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 2:1319610/1‑100 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG < 2:1350914/100‑1 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG < 2:1464894/100‑1 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 1:1526657/1‑100 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 2:2350581/1‑100 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 2:3205811/1‑100 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 2:3279513/1‑100 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG < 2:428889/100‑1 GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGACCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AG > 1:1850271/1‑100 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGC < 1:2890693/100‑1 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGC > 2:781084/1‑100 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGC < 2:3266324/100‑1 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGC < 1:621419/100‑1 CATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGC < 1:846607/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACTAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG > 1:2060438/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG > 2:2491264/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG < 1:97280/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG > 1:1020116/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG > 2:106388/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG > 1:2320451/1‑100 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG < 1:239182/100‑1 ATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG > 2:2058492/1‑100 TGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGC > 2:1205717/1‑100 TGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGC > 1:76144/1‑100 TGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGC < 2:301289/100‑1 TGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCG > 1:143315/1‑99 GGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCC > 2:1258483/1‑100 GGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCC < 1:1589616/100‑1 GGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCC < 2:2643931/100‑1 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGatcgg > 2:2711433/1‑95 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCC < 1:202744/100‑1 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCC < 1:2844642/100‑1 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCC > 2:1647378/1‑100 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCC > 2:2162412/1‑100 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCC > 1:3132118/1‑100 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCC < 2:2425736/100‑1 GAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCC < 1:333830/100‑1 GAGAGGAACAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCC > 1:1254031/1‑100 AGAGGGGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC > 1:530077/1‑100 AGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC < 1:3069207/100‑1 AGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC < 1:2293619/100‑1 AGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC < 2:288866/100‑1 AGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC > 1:2801849/1‑100 AGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC > 1:918251/1‑100 AGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATATGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC < 1:2955480/100‑1 AGAGGAGCAATTTGGCTCGGCCGATGCCGGCTACGAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCCGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC < 1:2744017/100‑1 GCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGTGACAGCCCGAGGCGCTGGCCGAGGTGGGTGTGGACTGGATGATCGC‑C‑T‑AGCGCCC > 1:2078078/1‑93 CTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGCCAAATTG > 1:2233296/1‑100 ACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCT > 1:696855/1‑100 CCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTC > 2:3339373/1‑100 CCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTC > 2:2004321/1‑100 CCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTC > 2:1542580/1‑100 AGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTC > 2:1237770/1‑100 AGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTC > 2:1735289/1‑100 CAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGCGCTGTGGCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGC > 2:860402/1‑100 GCGCCCCTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGAC < 2:2472543/100‑1 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GCATGGAGAGGAGCAATTTGTCTCAGCCGATGCCGGCTACCAAGGGGCGCCACAGCGCGAGGAGCTGGCCGAGGTGGATGTGGACTGGCTGATCGC‑C‑G‑AGCGCCCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/274452‑274347 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgccccTTGGTAGCCGGCATCGGCTGAGACAAATTGCTCCTCTCCATGCAGCAGATTACCCAGCTGATTGAGGTCATGCTCGTTGGCCGCGGTGGTGACCAGGCT > NC_000913/274410‑274508 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |