| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 72136 = | NA (NA) | 7 (0.060) | 6/164 | NT | NA | noncoding (1/85 nt) | REP7 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP7 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences |
| ? | NC_000913 | 72169 = | NA (NA) | noncoding (34/85 nt) | REP7 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | REP7 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 2 REP sequences | |||||
Only 100 of 156 total aligned reads displayed.
GGTGGCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCATACTAACCC > NC_000913/72037‑72235 | aaggcgagtgcttcggcactattggggattacgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagg > 2:2716860‑M1/100‑100 (MQ=255) aggcgagtgcttcggcactattggggattacgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGc > 2:1788024‑M1/99‑100 (MQ=255) tggCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGc > 1:475516/1‑99 (MQ=255) ggcgagtgcttcggcactattggggattacgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGcc < 1:1396962‑M1/3‑1 (MQ=255) ggcgagtgcttcggcactattggggattacgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGcc < 1:1589956‑M1/3‑1 (MQ=255) ggCGCTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCt < 2:790010/100‑1 (MQ=255) cgagtgcttcggcactattggggattacgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTg > 1:124331‑M1/96‑100 (MQ=255) cgagtgcttcggcactattggggattacgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTg > 1:1535929‑M1/96‑100 (MQ=255) cgagtgcttcggcactattggggattacgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTg > 2:3055007‑M1/96‑100 (MQ=255) cgagtgcttcggcactattggggattacgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTg > 2:450394‑M1/96‑100 (MQ=255) cgcTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGa > 2:818987/1‑100 (MQ=255) cgcTGGTGGTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGa > 1:1346610/1‑100 (MQ=255) tggtggTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGc < 1:2856477/100‑1 (MQ=255) tggtggTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGc < 2:688120/100‑1 (MQ=255) tggtggTGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGc < 1:1586234/100‑1 (MQ=255) ggtggtGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATg < 1:444435/98‑1 (MQ=255) ggtggtGTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCg > 1:2204988/1‑100 (MQ=255) gtggtgTTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGa > 2:2092865/1‑100 (MQ=255) tgtTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGTCTGATGCGACGCt > 2:2953187/1‑100 (MQ=255) tgtTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCt > 1:480450/1‑100 (MQ=255) gtTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGc < 1:2509317/98‑1 (MQ=255) gtTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCtt > 1:3274321/1‑100 (MQ=255) gtTAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCtt > 2:2398965/1‑100 (MQ=255) tAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc > 2:1901171/1‑100 (MQ=255) tAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc > 2:1900896/1‑100 (MQ=255) tAATTCGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGc < 1:2850049/100‑1 (MQ=255) cGCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGt > 2:3103150/1‑100 (MQ=255) gCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTc > 2:229214/1‑100 (MQ=255) gCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTc > 2:2628581/1‑100 (MQ=255) gCCACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTc > 1:19751/1‑100 (MQ=255) cACCCGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCtt < 1:1015464/100‑1 (MQ=255) cccGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTAt > 1:227539/1‑100 (MQ=255) ccGTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATc > 1:590379/1‑100 (MQ=255) gTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAg < 1:2550097/100‑1 (MQ=255) gTTGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAg > 2:1568692/1‑100 (MQ=255) gTTGATGCCGGTGTATAGCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAg < 1:2997201/100‑1 (MQ=255) ttGATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAg < 1:869596/99‑1 (MQ=255) cgggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAgg > 2:2503673‑M1/69‑100 (MQ=255) ggttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGcc > 2:1396967‑M1/67‑100 (MQ=255) gATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGcc > 1:1090174/1‑100 (MQ=255) gATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGcc > 1:411227/1‑100 (MQ=255) gATGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGcc < 1:2127569/100‑1 (MQ=255) gttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCt > 1:249220‑M1/66‑100 (MQ=255) aTGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCt > 1:953440/1‑100 (MQ=255) ttagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:1730472‑M1/65‑100 (MQ=255) tGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTa < 2:2772639/100‑1 (MQ=255) tGCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTa > 1:2826219/1‑100 (MQ=255) tagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTAc > 1:465885‑M1/64‑100 (MQ=255) tagtatgcactgtcggatgcggcgtgaacgccttatccgacctacgggtagtgcgttttgtagGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTAc > 2:2424831‑M1/64‑100 (MQ=255) gCCGGTGTATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTAc < 1:2122297/100‑1 (MQ=255) tgtATATCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGACTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAAc > 1:2451000/1‑100 (MQ=255) tataTCGATATTTTGGGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGc < 1:1672149/100‑1 (MQ=255) tataTCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGc > 1:3233152/1‑100 (MQ=255) tataTCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGc < 1:2426882/100‑1 (MQ=255) tataTCGATATTATGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGc > 2:2193980/1‑100 (MQ=255) tatCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCAc > 2:691526/1‑100 (MQ=255) atCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACt > 2:3028688/1‑100 (MQ=255) atCGATATTTTGCGTAAAGTGGTTGGGGTTTAGGAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACt > 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2:2124696/1‑100 (MQ=255) ggAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 1:762738/1‑100 (MQ=255) ggAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 2:1103266/1‑100 (MQ=255) ggAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCa > 2:1170040/1‑100 (MQ=255) ggAGATAGTCTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTGCACGCCGCa > 2:3004565/1‑100 (MQ=255) cTTGTGCGGGTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGt > 2:1977548/1‑100 (MQ=255) tgtgCGGGTTGCCTAATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCATACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGAATCCGACa < 1:1472805/96‑1 (MQ=255) gtgtgggTTGCCTGATGCGACGCTTGCCGCGTCTTATCAGGCCTACAAAACGCACTACCCGTAGGTCGGATAAGGCGTTCACGCCGCATCCGACAGTGCa < 2:1086256/96‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |