| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 228219 = | NA (NA) | 7 (0.060) | 4/166 | NT | NA | noncoding (2461/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | NC_000913 | 228248 = | NA (NA) | noncoding (2490/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 137 total aligned reads displayed.
TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/228323‑228219‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggtGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGTTTAG > NC_000913/228248‑228346 TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG < 1:1458823/100‑1TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG > 2:255497/1‑100TTAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG > 2:132870/1‑100TTAAATGGCGAACAGACATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGG < 1:837858/100‑1 tgAATGGCGAACAGCCAGACCCTTGGGACGTACTTCAGCCCCAGTATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTTGATATGAACTCTTGGG < 1:880973/98‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 1:138505/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:34785/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:1107544/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 2:1351248/1‑100 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG < 2:1206404/100‑1 TAAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCAGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGG > 1:2391920/1‑100 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:2644461/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:3016367/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:3716112/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:567934/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:1561762/100‑1 AAATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC < 1:1051876/100‑1 nATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 1:206062/2‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGCGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGC > 1:1781810/1‑99 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 2:1278387/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 2:1509849/1‑100 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:1527169/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:3666196/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 2:66671/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 1:1055366/100‑1 AATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG > 1:1565379/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG > 2:2164336/1‑100 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:1693253/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:1451338/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 2:1430441/100‑1 ATGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGG < 1:455454/100‑1 ATGGCGAACAGACATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCG < 1:733644/99‑1 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCGAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 1:2006879/1‑100 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 2:468840/1‑100 TGGCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGT > 1:1627927/1‑100 GCGAACAGCCATACCCTTGGGACCTACTTCAGCCCCAGGATGTGATGAGCCGACATCGAGGTGCCAAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTCGGCGG > 1:2823096/1‑97 AAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGTACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTC > 2:618251/1‑100 AAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTC > 2:680747/1‑100 AAACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTC > 1:2156053/1‑100 AACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCG > 2:2047999/1‑100 ACACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCG > 1:255358/1‑99 ACCGCCGTCGATATGAACTCTTGGGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCA > 2:166108/1‑100 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:2890301/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:168429/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG > 1:3324525/1‑100 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:3133054/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:3250404/100‑1 GGCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGG < 2:742275/100‑1 GCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGn < 2:480131/100‑2 GCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGT > 2:375463/1‑100 GCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGT > 2:375464/1‑100 GCGGTGTTTGGCACCTCGATGTCGGCTCATCACATCCTGGGGCTGAAGTAGGTCCCAAGGGTATGGCTGTTCGCCATTTAAAGTGGTACGCGAGCTGGGT > 1:1982983/1‑100 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |