| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 2937381 = | NA (NA) | 20 (0.170) | 10/164 | NT | NA | intergenic (+22/‑87) | fucI/fucK | L‑fucose isomerase/L‑fuculokinase |
| ? | NC_000913 | 2937405 = | NA (NA) | intergenic (+46/‑63) | fucI/fucK | L‑fucose isomerase/L‑fuculokinase | |||||
Only 100 of 210 total aligned reads displayed.
TGGGCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAG > NC_000913/2937282‑2937480 | tGGGCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCtgatgtgatg < 1:438819/100‑1 (MQ=255)tGGGCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCtgatgtgatg < 1:3292110/100‑1 (MQ=255)gccacagtcgagtaccaggataacttcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagg > 1:1040413‑M1/100‑100 (MQ=255) ccacagtcgagtaccaggataacttcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGc < 2:871784‑M1/2‑1 (MQ=255) gCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGccc > 2:1898137/1‑100 (MQ=255) gCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGccc < 2:1471059/100‑1 (MQ=255) cagtcgagtaccaggataacttcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGCCCg > 1:1106376‑M1/96‑100 (MQ=255) cagtcgagtaccaggataacttcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGCCCg > 1:2921914‑M1/96‑100 (MQ=255) agtcgagtaccaggataacttcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGCCCgg > 2:3633765‑M1/95‑100 (MQ=255) agtcgagtaccaggataacttcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGCCCgg > 1:2407723‑M1/95‑100 (MQ=255) gcgcACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGt < 2:3666498/100‑1 (MQ=255) gcACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCg > 2:3126072/1‑100 (MQ=255) cACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGc > 1:641766/1‑100 (MQ=255) cACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGc > 1:334924/1‑100 (MQ=255) ataacttcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGCCCGGTCGCTCCG‑GCTAcc > 2:334776‑M1/81‑100 (MQ=255) tatTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCg > 2:471419/1‑100 (MQ=255) ntGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCggg > 2:3251523/2‑100 (MQ=255) ttcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGcc > 1:2441997‑M1/76‑100 (MQ=255) gAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGcc > 2:2006927/1‑100 (MQ=255) gAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGcc < 1:1976659/100‑1 (MQ=255) tcttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCt > 2:1268539‑M1/75‑100 (MQ=255) cttgtttcataatcgctcctgcaatatagccggataacattgcttatccggctaaccactcttgcttgttcagGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTg > 2:1334136‑M1/74‑100 (MQ=255) aGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTg > 2:749967/1‑100 (MQ=255) ggCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGa > 1:1166242/1‑100 (MQ=255) gCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGaa > 1:2266828/1‑100 (MQ=255) ccAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAAc > 1:2785351/1‑100 (MQ=255) ccAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAAc > 1:2558235/1‑100 (MQ=255) cAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAAca < 1:633522/100‑1 (MQ=255) cAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAAca < 2:223307/100‑1 (MQ=255) aGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAAcaa < 2:2186380/100‑1 (MQ=255) aTTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAAcaagca > 1:3367404/1‑100 (MQ=255) ttACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAAcaagcaa > 1:261803/1‑100 (MQ=255) tACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAAcaagcaag < 1:1863610/100‑1 (MQ=255) ccGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAagag > 2:414260/1‑100 (MQ=255) ccGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAagag < 1:3214080/100‑1 (MQ=255) ccGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAagag > 2:675388/1‑100 (MQ=255) gcgcTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTg < 1:1762576/100‑1 (MQ=255) cacTTGCCAGATCTACGATCCGTCGTACAAGGGTTAATACATTACTGCCTGAGTTGATGCCCGGTCGCTCCT‑GCTACCGGGCCTGACCAAGCAAGAGTgg < 1:1660231/98‑1 (MQ=255) gcTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGt > 1:2533684/1‑100 (MQ=255) gatctccAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGt < 1:2946848/95‑1 (MQ=255) cTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGtt > 2:1446463/1‑100 (MQ=255) cTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGtt > 1:554952/1‑100 (MQ=255) gCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGc > 1:1819171/1‑100 (MQ=255) gCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGc > 1:1798012/1‑100 (MQ=255) ccAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGtagatc > 2:2946868/1‑95 (MQ=255) cAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCg < 1:771070/100‑1 (MQ=255) cAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCg > 1:2637932/1‑100 (MQ=255) cAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCGCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCg < 2:2328580/100‑1 (MQ=255) aGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCgg > 2:1025116/1‑100 (MQ=255) gAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGGCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGa < 1:1804510/100‑1 (MQ=255) aCTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATa < 2:2637947/100‑1 (MQ=255) cGGTGCGTTGTACAAGCGGTAATACATTGCTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCGG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATa < 1:964582/96‑1 (MQ=255) ggTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCaa > 2:2055103/1‑100 (MQ=255) gTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAAt < 1:806187/100‑1 (MQ=255) gTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAAt < 2:3176731/100‑1 (MQ=255) ccGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGt > 1:3648366/1‑100 (MQ=255) cGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGtt > 2:3307745/1‑100 (MQ=255) tGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATc < 2:560612/100‑1 (MQ=255) gTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATcc > 1:3027945/1‑100 (MQ=255) gTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATcc > 1:2825634/1‑100 (MQ=255) tACAAGCGATAATACATTCCTCCTTGCTTTGATGCCAGGCCGCTCCG‑CCTACCGCTCCTGAACAAGCAAGAGGGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTTTCCg > 1:3168959/1‑100 (MQ=255) aCAAGCGTTAATACATTACTCCCTGAAGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCgg > 2:2283034/1‑100 (MQ=255) aGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCta < 1:713771/100‑1 (MQ=255) gCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCtat > 2:2672070/1‑100 (MQ=255) gTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTatat > 2:1162338/1‑100 (MQ=255) aaTACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGc < 2:2852732/100‑1 (MQ=255) aaTACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGc < 2:3353175/100‑1 (MQ=255) tACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCa < 1:3469672/99‑1 (MQ=255) tACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAg > 2:3471731/1‑100 (MQ=255) tACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAg < 2:686495/100‑1 (MQ=255) ttACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGacc < 2:2515846/100‑3 (MQ=255) 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cTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATg < 1:3591062/100‑1 (MQ=255) cTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATg < 1:3126050/100‑1 (MQ=255) tgatgtgatgCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGa < 2:370091/100‑1 (MQ=255) tgatgtgatgCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGa > 2:575780/1‑100 (MQ=255) gatgtgatgCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGaa < 2:790189/100‑1 (MQ=255) tgttcagGCCCGGTAGC‑CGGAGCGACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGaaa < 1:141496‑M1/93‑1 (MQ=255) tgtgatgCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAAc < 1:2006917/100‑1 (MQ=255) 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GCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACaagaag > 1:1909109‑M1/1‑100 (MQ=255) | TGGGCTGCGCACGGCATGGATATTGAAGGCCAGGATTACCGCGCTTGCCAGAACTACGGTCCGTTGTACAAGCGTTAATACATTACTCCCTGATGTGATGCCCGGTCGCTCCG‑GCTACCGGGCCTGAACAAGCAAGAGTGGTTAGCCGGATAAGCAATGTTATCCGGCTATATTGCAGGAGCGATTATGAAACAAGAAG > NC_000913/2937282‑2937480 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |