| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 4240156 | NA (NA) | 12 (0.100) | 6/164 | NT | NA | intergenic (‑101/‑169) | yjbT/psiE | putative periplasmic protein/phosphate starvation inducible protein |
| ? | NC_000913 | = 4240189 | NA (NA) | noncoding (33/37 nt) | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP314 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
Only 100 of 181 total aligned reads displayed.
TTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTT > NC_000913/4240090‑4240288 | ttGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAAT‑GGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGcc < 2:856148/100‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGcc < 2:540660/100‑1 (MQ=255) tGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGcc > 2:2561534/1‑100 (MQ=255) gCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCt > 2:888251/1‑100 (MQ=255) cTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTa > 1:33807/1‑100 (MQ=255) tggtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTAc > 1:2927690/1‑100 (MQ=255) ggtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTTATTTTTTTTCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGTATTCGCCGCCAGGCGCTGCTTATCCGGCCt > 1:2665567/1‑97 (MQ=255) gtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACgg < 1:113475/100‑1 (MQ=255) gtggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACgg < 1:894916/100‑1 (MQ=255) tggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACggg < 2:1460103/100‑1 (MQ=255) ggCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggt > 1:536443/1‑100 (MQ=255) gCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggta < 2:3727114/100‑1 (MQ=255) gCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggta < 2:3704810/100‑1 (MQ=255) tGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtagg > 2:1202339/1‑100 (MQ=255) gggAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggt > 1:1100739/1‑100 (MQ=255) ggAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggta < 1:1693077/100‑1 (MQ=255) ggAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGggtaggta < 2:2089157/100‑1 (MQ=255) ggAATCACCTGAATGGGAGATTTTTGAATTACCGGCTTTGTTGCGGTTTGTCTTGCCGGGTGCGCCGCCAGGCGCGGGTTATCCAGCCTTCGggtaggt > 1:2783846/1‑99 (MQ=255) aTCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTatat > 2:2168014/1‑100 (MQ=255) cACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATcc > 1:1735884/1‑100 (MQ=255) cACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATcc > 2:2254112/1‑100 (MQ=255) cACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATcc < 2:3063921/100‑1 (MQ=255) ccTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACAGGTAGGTATATCCgg > 2:3670896/1‑100 (MQ=255) cTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGc > 2:3192298/1‑100 (MQ=255) tGAATGGGTGATTTTTGATTTATTGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATACGGCCTACGGGTAGGTATATCCg > 1:1087823/1‑97 (MQ=255) aTGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtg < 1:3657077/100‑1 (MQ=255) aTGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtg > 2:1301467/1‑100 (MQ=255) aTGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtg < 2:184177/100‑1 (MQ=255) tGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtgg < 2:3452218/100‑1 (MQ=255) ggTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTtggtg > 2:788003/1‑100 (MQ=255) aTTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg < 2:1750852/100‑1 (MQ=255) ttttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcg > 2:471369/1‑100 (MQ=255) tgtGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAgg < 1:2483006/95‑1 (MQ=255) ttGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGCCCTACGGGTGGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGgcgcg < 1:1996660/100‑1 (MQ=255) gAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCt < 2:202439/100‑1 (MQ=255) aTTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTcc < 1:1379041/100‑1 (MQ=255) ccGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATACGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCaaa > 1:153895/1‑99 (MQ=255) cGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATc < 2:902541/100‑1 (MQ=255) ggCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATcc > 2:685049/1‑100 (MQ=255) ggCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATcc < 2:1031570/100‑1 (MQ=255) gCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCa < 2:2408680/100‑1 (MQ=255) ttGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGt < 1:2461304/100‑1 (MQ=255) ggTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTg > 2:1325412/1‑100 (MQ=255) gTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGa > 1:2887247/1‑100 (MQ=255) tGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGaa > 1:1423361/1‑100 (MQ=255) tGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCACCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGaa < 1:1626623/100‑1 (MQ=255) cGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACa < 1:3192276/100‑1 (MQ=255) tttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACaaaa < 2:2887266/100‑1 (MQ=255) ttGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAAc < 1:3645954/100‑1 (MQ=255) gTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACAt > 2:1669195/1‑100 (MQ=255) cTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccag < 1:2523171‑M2/100‑65 (MQ=255) cTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccag < 2:310843‑M2/100‑65 (MQ=255) cTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATac > 1:2881080/1‑100 (MQ=255) cTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATac > 1:3681523/1‑100 (MQ=255) ttGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATaca < 2:3573624/100‑1 (MQ=255) tGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagca < 2:3251679‑M2/100‑67 (MQ=255) gctggAGGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATAcaca > 1:1669787/4‑100 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaa < 1:1977743‑M2/100‑68 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATAcaca < 1:1467358/100‑1 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATAcaca > 2:3441018/1‑100 (MQ=255) gCCGGATGCGCCGCCAGGCGC‑‑‑‑‑ATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgc < 2:2266672‑M2/100‑73 (MQ=255) ccGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACaa > 1:211435/1‑100 (MQ=255) ccGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACaa > 2:3304133/1‑100 (MQ=255) ngaTGCGCCGCCAGGCGC‑‑‑‑‑ATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaa < 1:1639318‑M2/99‑76 (MQ=255) gATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcg > 1:3283041‑M2/1‑29 (MQ=255) aTGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACaaaaaa > 2:1498246/1‑100 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat < 1:3655286/100‑1 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat < 2:141346/100‑1 (MQ=255) cgccgcCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGACTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAatat > 1:719962/1‑100 (MQ=255) gccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAtata < 1:787999/100‑1 (MQ=255) gccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAtata < 2:3514419/100‑1 (MQ=255) gccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAAtata > 2:2991213/1‑100 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg < 2:1100745/100‑1 (MQ=255) ccgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg < 1:3605821/100‑1 (MQ=255) cgccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAg < 2:2009720/99‑1 (MQ=255) ccAGGCGCGGCTTATCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatc > 2:1977753‑M2/1‑20 (MQ=255) ccAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGAtc > 2:1612157/1‑100 (MQ=255) ggCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCTGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTcc < 1:1971715/100‑1 (MQ=255) ggCGCGGCTTATCCGGCATACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATTCAGGTTGAACAAAAAATAAAAAAATAATATAGATCTcc < 1:2304785/100‑1 (MQ=255) gcgcGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCg < 2:10602/100‑1 (MQ=255) cgcgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGt < 1:2249047/100‑1 (MQ=255) cgcgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGt > 2:2326612/1‑100 (MQ=255) cgcgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGt > 1:2339304/1‑100 (MQ=255) cgGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTca > 1:663155/1‑100 (MQ=255) aTCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctc < 2:398823‑M2/100‑94 (MQ=255) tCCGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctct < 1:3505810‑M2/100‑95 (MQ=255) tCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACAttttt < 2:1351130/100‑1 (MQ=255) ccGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctg > 1:57989‑M2/1‑5 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 1:3445557/100‑1 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg > 2:2183563/1‑100 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 2:3452033/100‑1 (MQ=255) ccGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTg < 2:249213/100‑1 (MQ=255) cGGCaagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctgg < 1:1845794‑M2/100‑97 (MQ=255) ggCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCg < 1:1808917/100‑1 (MQ=255) ggCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAAAAAAACAAAAAAAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGc < 1:3221550/99‑1 (MQ=255) gCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGt > 2:3104235/1‑100 (MQ=255) ccTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAACATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGtt > 1:683954/1‑100 (MQ=255) ccTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGtt > 2:2203117/1‑100 (MQ=255) ccTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGtt > 2:698552/1‑100 (MQ=255) caagacaaaccgcaccaaagccggtaattcaaaaatcacccattcaggtgattcccagccaccagcaatgcgcgaaaaatcgacaatgttcctctggaac > 2:2855622‑M2/1‑1 (MQ=255) | TTGCTGGTGGCTGGGAATCACCTGAATGGGTGATTTTTGAATTACCGGCTTTGGTGCGGTTTGTCTTGCCGGATGCGCCGCCAGGCGCGGCTTATCCGGCCTACGGGTAGGTATATCCGGCTTTGGTGGAGGCGCGCTCCAAATCCAGGTTGAACAAAACATACACAAAAAATATAGATCTCCGTCACATTTTTGCGTT > NC_000913/4240090‑4240288 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |