| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 4602596 = | 155 (1.180) | 6 (0.050) | 4/168 | NT | 4.0% | coding (263/771 nt) | yjjP | DUF1212 family inner membrane protein |
| ? | NC_000913 | 4602621 = | 139 (1.120) | coding (238/771 nt) | yjjP | DUF1212 family inner membrane protein | |||||
| Rejected: Frequency below cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 190 total aligned reads displayed.
GTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACTTTC > NC_000913/4602522‑4602720 | gtgctgacaactattaaagatgggcaatgcctgacatcgacacgtaaaaatcacgatcgcggcattaatatgcATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGc > 2:39402‑M1/74‑100 (MQ=255) tgctgacaactattaaagatgggcaatgcctgacatcgacacgtaaaaatcacgatcgcggcattaatatgcATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCa > 2:829485‑M1/73‑100 (MQ=255) aaTGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCa < 1:1766944/100‑1 (MQ=255) aTGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCat > 2:2075849/1‑100 (MQ=255) ctgacaactattaaagatgggcaatgcctgacatcgacacgtaaaaatcacgatcgcggcattaatatgcATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGcatn > 1:2631814‑M1/71‑99 (MQ=255) ggCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCatat > 2:395469/1‑100 (MQ=255) ggCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCatat > 2:2373801/1‑100 (MQ=255) ggCTGAATTTGGCCAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTACTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCatat > 1:2303356/1‑100 (MQ=255) gCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATAtt < 1:279079/100‑1 (MQ=255) cTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTa > 2:1039601/1‑100 (MQ=255) tGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTaa < 2:2187919/100‑1 (MQ=255) gAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTaaa > 1:2187909/1‑99 (MQ=255) gAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAAt > 1:193345/1‑100 (MQ=255) gAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAAt < 1:1509208/100‑1 (MQ=255) aaTTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATg < 1:455502/100‑1 (MQ=255) aaTTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATg < 2:3633996/100‑1 (MQ=255) aTTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGc < 2:121511/100‑1 (MQ=255) aaaTCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCg < 1:932677/100‑1 (MQ=255) aaaGCGTTTTTCTACGCCTTTGTAATCCAGCACATGATTCTCCGCAAGAATCACACTGTGCTGTACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCg < 1:3266516/100‑1 (MQ=255) aTCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTg > 1:1703027/1‑100 (MQ=255) aTCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTg < 2:3224680/100‑1 (MQ=255) cGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGAt > 1:2366441/1‑100 (MQ=255) tttCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGAttt < 1:1132754/100‑1 (MQ=255) tctcTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGAttttt > 2:1351668/1‑100 (MQ=255) tctcTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGAttttt < 2:3190407/100‑1 (MQ=255) ctctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTa > 2:564711/1‑100 (MQ=255) tctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAc > 1:2266123/1‑100 (MQ=255) tctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAc < 1:3717713/100‑1 (MQ=255) ctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAc > 1:2923757/1‑99 (MQ=255) ctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACg > 2:3438154/1‑100 (MQ=255) ctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACg < 2:98009/100‑1 (MQ=255) ctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACg > 1:2022597/1‑100 (MQ=255) ctACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACg > 1:229640/1‑100 (MQ=255) tACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgt > 1:2947624/1‑100 (MQ=255) tACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgt > 1:667546/1‑100 (MQ=255) aCGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCTCATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgtg < 2:2629631/100‑1 (MQ=255) aCGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgtg < 2:820250/100‑1 (MQ=255) cGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgtgt > 1:3430292/1‑100 (MQ=255) cGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgtgt > 2:1085551/1‑100 (MQ=255) cGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACgtgt > 1:829473/1‑100 (MQ=255) gCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTc < 2:1478301/100‑1 (MQ=255) gTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTc > 2:3390951/1‑100 (MQ=255) aTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGCATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAgg < 1:3452265/100‑1 (MQ=255) aTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAgg < 1:1717326/100‑1 (MQ=255) aTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAgg > 2:1885261/1‑100 (MQ=255) aTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAgg > 2:483287/1‑100 (MQ=255) aTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAgg > 2:2385871/1‑100 (MQ=255) aTCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAgg > 1:3419504/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCa > 2:3393672/1‑100 (MQ=255) ccAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCa < 2:193347/100‑1 (MQ=255) cagcagATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCAt > 2:3504777/1‑100 (MQ=255) agcagATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCAtt > 1:2331233/1‑100 (MQ=255) gatgatGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGccc > 2:1156639/1‑100 (MQ=255) tgatgCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCAt > 1:690032/1‑100 (MQ=255) atgCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCt > 2:2232834/1‑100 (MQ=255) tgCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCtt < 1:2403112/100‑1 (MQ=255) tgCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCtt < 2:2283556/100‑1 (MQ=255) tgCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCtt > 1:2510637/1‑100 (MQ=255) gCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCttt < 2:3055516/100‑1 (MQ=255) gCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCttt < 1:3347671/100‑1 (MQ=255) cTCCGCAAGCATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTa < 2:1515429/100‑1 (MQ=255) tCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTaa < 1:1418346/100‑1 (MQ=255) tCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTaa < 1:1039596/100‑1 (MQ=255) ccGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAAt > 1:2097363/1‑100 (MQ=255) ccGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAAt > 2:3724286/1‑100 (MQ=255) ccGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAAt < 1:2829880/100‑1 (MQ=255) cGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATa < 2:1732741/100‑1 (MQ=255) gCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAg > 2:3166451/1‑100 (MQ=255) gCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAg < 2:2981112/100‑1 (MQ=255) taatatgcatgtggtgactgaagtccagcacatGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTAAGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGt > 1:165627‑M2/34‑100 (MQ=255) gAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGt < 1:79849/100‑1 (MQ=255) aatatgcatgtggtgactgaagtccagcacatGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGt > 1:1444431‑M2/33‑99 (MQ=255) cacaATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGCTCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGc > 2:880231/1‑100 (MQ=255) acaATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCa > 2:652444/1‑100 (MQ=255) gcatgtggtgactgaagtccagcacatGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCCTCTTTAATAGTTGTCAGCAc > 1:1528168‑M2/28‑100 (MQ=255) caATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCAc < 1:3483368/100‑1 (MQ=255) GTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATg > 2:212969‑M1/1‑100 (MQ=255) GTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATg > 2:529742‑M1/1‑100 (MQ=255) TGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATgg < 2:3174241‑M1/100‑1 (MQ=255) TGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATgg > 1:597434‑M1/1‑100 (MQ=255) cTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCg > 1:1674882/1‑100 (MQ=255) ggACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGtt > 1:2345318/1‑100 (MQ=255) gACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTc > 2:1855054/1‑100 (MQ=255) aCTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCg > 1:2666513/1‑100 (MQ=255) cTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGa > 2:2657546/1‑100 (MQ=255) ttCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGaa < 2:895206/100‑1 (MQ=255) tCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAag > 1:3148529/1‑100 (MQ=255) tCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAag < 2:374363/100‑1 (MQ=255) tCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAag < 2:224548/100‑1 (MQ=255) cAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAag > 1:475411/1‑99 (MQ=255) aGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAagag < 1:1302068/100‑1 (MQ=255) aGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAagag < 2:2173609/100‑1 (MQ=255) gTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAgaga < 2:3373524/100‑1 (MQ=255) caccacATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATa < 1:1362659/100‑1 (MQ=255) accacATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGGATTGCCCCTCTTTAATAGGTGTCAGAACGATGGAGTTCGAcgag > 2:3563628/1‑96 (MQ=255) cacaTGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTAAGGCATTGACCATCATTAATAGTTGTAAGAACTATGGCATTCGACGAGATAgta > 2:1616439/1‑98 (MQ=255) catGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACt > 2:483338‑M2/4‑100 (MQ=255) catGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACt > 2:1152895‑M2/4‑100 (MQ=255) catGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCACTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACt > 1:2762890‑M2/4‑100 (MQ=255) gCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACTTTc < 2:3298870/100‑1 (MQ=255) | GTAATGGCTGAATTTGGCTAAATCGTTTCTCTACGCCTTTGTAATCCAGCAGATGATGCTCCGCAAGAATCACAATGTGCTGGACTTCAGTCACCACATGCATATTAATGCCGCGATCGTGATTTTTACGTGTCGATGTCAGGCATTGCCCATCTTTAATAGTTGTCAGCACTATGGCGTTCGAAGAGATAGAACTTTC > NC_000913/4602522‑4602720 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |