New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 4624213 = | 170 (1.290) | 4 (0.030) | 4/168 | NT | 2.7% | coding (577/645 nt) | ytjB | SMP_2 family putative membrane‑anchored periplasmic protein |
? | NC_000913 | 4624245 = | 131 (1.060) | coding (545/645 nt) | ytjB | SMP_2 family putative membrane‑anchored periplasmic protein | |||||
Rejected: Frequency below cutoff threshold. |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
CACTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAT > NC_000913/4624146‑4624344 | cACTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTACGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCg > 1:1905343/1‑100 (MQ=255) ctctTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTCGCAGCGTg > 2:1397959/1‑100 (MQ=255) tctTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGc < 1:2059764/100‑1 (MQ=255) ccactaacattttacgcctgatgttgctgctctcactggcaatcggtgtagtgctgacccgcacGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGc > 1:1940736‑M1/65‑100 (MQ=255) ctTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCg < 2:1552705/100‑1 (MQ=255) ttttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCgg < 1:1182523/100‑1 (MQ=255) ttttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCgg < 1:129267/100‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 2:2884443/100‑1 (MQ=255) tttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg < 2:70192/100‑1 (MQ=255) ctaacattttacgcctgatgttgctgctctcactggcaatcggtgtagtgctgacccgcacGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCggg > 1:3043754‑M1/62‑100 (MQ=255) ttttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGt > 2:894903/1‑100 (MQ=255) tttCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTc < 2:1660356/100‑1 (MQ=255) acattttacgcctgatgttgctgctctcactggcaatcggtgtagtgctgacccgcacGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCa > 2:1525438‑M1/59‑100 (MQ=255) tctcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAg > 1:1402033/1‑100 (MQ=255) ctcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAg > 2:952504/1‑99 (MQ=255) ctcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGc > 2:1216750/1‑100 (MQ=255) tcGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCaaca > 1:404656/1‑97 (MQ=255) cGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGTGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCAc < 2:1338810/100‑1 (MQ=255) cGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCAc > 1:1453781/1‑100 (MQ=255) gCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACt < 1:414374/100‑1 (MQ=255) tcttcctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAACACTacac < 2:404658/100‑1 (MQ=255) cttcctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCCGCACTACAcc > 2:835710/1‑100 (MQ=255) cttcctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACAcc < 2:2440657/100‑1 (MQ=255) ttcctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCg > 1:2504722/1‑100 (MQ=255) ctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGAtt < 1:835705/100‑1 (MQ=255) ctcttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGAtt < 1:2542675/100‑1 (MQ=255) cttccGGCACCGGTGTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGGAGCAGCGTGCGAGTCAGCACTACACCGAtt < 1:942097/98‑1 (MQ=255) ttccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGcc < 2:3328408/100‑1 (MQ=255) tccGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGTGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCa > 1:1669351/1‑100 (MQ=255) cGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGt < 2:527230/100‑1 (MQ=255) ggCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTg > 2:1512334/1‑100 (MQ=255) ggCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTg < 1:413640/100‑1 (MQ=255) cACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTgag < 2:696865/100‑1 (MQ=255) ccGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGagag > 2:1062680/1‑100 (MQ=255) ccGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGagag > 1:3219636/1‑100 (MQ=255) ccGGTTTGCTGGCCGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCACCGGGTTCGTTTACGCTGTAGCATCGTGCGGGTCGGCACTACACAGATTGCCAGTga > 1:575183/1‑97 (MQ=255) ggTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagca > 2:3690795/1‑100 (MQ=255) ggTTTGCGGGCGGTCAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGCAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagca < 1:1709976/100‑1 (MQ=255) gctttGCTGGCGGCTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGCTTGcc > 1:3121052/3‑90 (MQ=255) gTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGagcag < 1:3690767/100‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAgcagca > 2:3149547/1‑100 (MQ=255) ttGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAgcagca < 2:2916810/100‑1 (MQ=255) ttGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGACGGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCATGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAgcagca < 1:3531981/100‑1 (MQ=255) gCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAAc < 1:3493643/100‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACa < 1:3730830/100‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACa < 2:504237/100‑1 (MQ=255) cTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACa > 2:1097398/1‑100 (MQ=255) ggCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATc > 1:2352753/1‑100 (MQ=255) cGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAg > 2:66855/1‑100 (MQ=255) ggTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAgg < 2:3400820/100‑1 (MQ=255) ggTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAgg < 1:823075/100‑1 (MQ=255) ttAACATGTAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGGGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACTCCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCg < 1:300744/100‑1 (MQ=255) ttAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCg > 2:230262/1‑100 (MQ=255) aaCAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTa > 1:3665858/1‑100 (MQ=255) aCAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaa > 2:3724409/1‑100 (MQ=255) aCAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaa > 1:1495923/1‑100 (MQ=255) cAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaaa > 1:626320/1‑100 (MQ=255) aGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTaaaa < 1:3178287/100‑1 (MQ=255) ggAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAAt > 1:2683570/1‑100 (MQ=255) aGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGtt < 1:1270781/100‑1 (MQ=255) aGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGtt < 1:230260/100‑1 (MQ=255) cGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtg < 1:2919485/100‑1 (MQ=255) cGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtg > 2:1746563/1‑100 (MQ=255) gATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtgg < 1:1035532/100‑1 (MQ=255) ttGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtggtg < 1:2832537/100‑1 (MQ=255) ttGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgtggtg < 2:3178423/100‑1 (MQ=255) tgctgcCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGgtgt < 2:265063/100‑1 (MQ=255) cgctgctacagggtaaacgcacccgctggcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGAAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAgaggtg > 1:1298709‑M2/34‑99 (MQ=255) GCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGtt < 2:2079095‑M1/100‑1 (MQ=255) CTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTa < 2:1927733‑M1/100‑1 (MQ=255) CTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTa < 1:3198616‑M1/100‑1 (MQ=255) CTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTa > 2:2128028‑M1/1‑100 (MQ=255) CCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATcc < 2:3125692‑M1/100‑1 (MQ=255) CCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATc < 2:1196520‑M1/99‑1 (MQ=255) cAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCa < 2:1164309/100‑1 (MQ=255) gggTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTg < 2:781735/100‑1 (MQ=255) ggTGCGTTTACCCTGTAGCAACGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGt > 1:2280392/1‑100 (MQ=255) tGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTg < 2:2504736/100‑1 (MQ=255) gCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTgg < 1:1369774/100‑1 (MQ=255) cGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTggg < 1:736609/100‑1 (MQ=255) gTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGc > 2:2657046/1‑100 (MQ=255) tACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTc > 1:2996469/1‑100 (MQ=255) aCCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCg < 2:2352767/100‑1 (MQ=255) cccTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCg > 2:199114/1‑99 (MQ=255) cccGGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACCCCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCgn < 1:652770/100‑2 (MQ=255) cTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTg > 2:2083946/1‑100 (MQ=255) cTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTg > 2:3187261/1‑100 (MQ=255) tGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTgg < 1:952499/100‑1 (MQ=255) tGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTgg > 1:1594728/1‑100 (MQ=255) gTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGc < 2:3065938/100‑1 (MQ=255) gTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGc < 1:2482946/100‑1 (MQ=255) tAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCg > 2:1280618/1‑100 (MQ=255) gcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAGAACGTTAGTTGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAg > 1:2621951‑M2/6‑100 (MQ=255) gcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTgggctgcggagatcgg > 1:2450793‑M2/6‑93 (MQ=255) gcagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAg < 2:2046694‑M2/95‑1 (MQ=255) cagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGc > 1:2192447‑M2/5‑100 (MQ=255) cagcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGGGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTgg < 1:3098827‑M2/91‑1 (MQ=255) agcTTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTTGGAGCAGCAGCATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCTCCTGTTGTGCTTCTTTGGCGAGc > 1:3354319/1‑99 (MQ=255) agcGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCg < 1:1097392‑M2/97‑1 (MQ=255) gTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAt < 1:2757206/100‑1 (MQ=255) | CACTCTTTTTTCTCGCTTTCTTCCTCTTCCGGCACCGGTTTGCTGGCGGTTAACAGGAAGGGCGATTGCTGCCAGCGGGTGCGTTTACCCTGTAGCAGCGTGCGGGTCAGCACTACACCGATTGCCAGTGAGAGCAGCAACATCAGGCGTAAAATGTTAGTGGTGTTATCCACCTGTTGGGCTTCGGTGGCGAGCGTAT > NC_000913/4624146‑4624344 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |