| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_000913 | 932,304 | C→T | intergenic (‑254/‑291) | trxB ← / → lrp | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding/leucine‑responsive global transcriptional regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 932,304 | 0 | C | T | 98.7% | 537.9 / ‑2.9 | 155 | intergenic (‑254/‑291) | trxB/lrp | thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)‑binding/leucine‑responsive global transcriptional regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (2/0); new base T (90/63); total (92/63) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.14e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.76e-01 | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
TCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGT > NC_000913/932207‑932396 | tCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCACTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTg < 1:2067098/100‑1 (MQ=255) cccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTgg > 1:1012079/1‑100 (MQ=255) cccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTgg > 1:1622866/1‑100 (MQ=255) ccGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGgt > 1:3502296/1‑100 (MQ=255) cGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGgtg < 1:3463281/100‑1 (MQ=255) cGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCAAATAAAAAAAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTgg < 1:2714761/98‑1 (MQ=255) gCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGgtgt < 2:1495482/100‑1 (MQ=255) gCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGgtgt > 2:1941940/1‑100 (MQ=255) cTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGtt > 1:892817/1‑100 (MQ=255) tttATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGttt < 1:1662637/100‑1 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGtttt > 1:694245/1‑99 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTg < 1:804328/100‑1 (MQ=255) tataAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTg < 2:1728438/100‑1 (MQ=255) taAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCg > 2:2078200/1‑100 (MQ=255) taAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCg < 2:414754/100‑1 (MQ=255) aaGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGa > 2:1922707/1‑100 (MQ=255) aGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGaa > 1:241386/1‑100 (MQ=255) gCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGaaa < 2:66271/100‑1 (MQ=255) ccGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGaaaa > 2:2599527/1‑100 (MQ=255) tAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTc > 1:2357073/1‑100 (MQ=255) aaaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCg < 2:3133771/100‑1 (MQ=255) aaaTGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCg < 2:2164686/100‑1 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg < 1:1822662/100‑1 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg > 1:1535055/1‑100 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg < 2:86245/100‑1 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg < 1:2981945/100‑1 (MQ=255) tgatgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAgg > 2:2895430/1‑100 (MQ=255) gatgaATAAACGCCCCTGATCATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATTCCTTTGTGTTTTGCGAAAACATTCg < 1:3238447/96‑1 (MQ=255) atgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaa > 1:1519143/1‑100 (MQ=255) tgaATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaag > 2:3398944/1‑100 (MQ=255) aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaagaa > 2:2058289/1‑100 (MQ=255) aaTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGgaagaa > 1:102034/1‑100 (MQ=255) aTAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGaaa > 1:390459/1‑100 (MQ=255) tAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGaaaa > 1:641891/1‑100 (MQ=255) aaaCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGaaaaa < 2:3275452/100‑1 (MQ=255) aCGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGaaaaaca < 2:3263874/100‑3 (MQ=255) acccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACa > 1:1743542/2‑100 (MQ=255) cccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCTATGTTTTGCTTTGACAATCGCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAg < 1:1922692/100‑1 (MQ=255) ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAg < 1:3297377/99‑1 (MQ=255) ccTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGt > 2:1507976/1‑100 (MQ=255) cTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTa > 2:576966/1‑100 (MQ=255) ttAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTc > 2:495709/1‑100 (MQ=255) tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt < 2:2467296/100‑1 (MQ=255) tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt > 1:661998/1‑100 (MQ=255) tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt < 2:3105630/100‑1 (MQ=255) tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt > 2:3186992/1‑100 (MQ=255) tAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt > 2:1692132/1‑100 (MQ=255) ctcttccgatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCt < 1:50323/92‑1 (MQ=255) aaTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCtt > 1:69883/1‑100 (MQ=255) aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTta > 2:3426844/1‑100 (MQ=255) aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTta > 2:3058818/1‑100 (MQ=255) aTGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTta < 2:3096903/100‑1 (MQ=255) tGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAACAACAGTATTCTtat > 2:1974344/1‑100 (MQ=255) tGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTtat > 1:1802775/1‑100 (MQ=255) tGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTtat > 2:777589/1‑100 (MQ=255) aaTATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTatat > 1:3411414/1‑100 (MQ=255) atatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATg < 2:2946508/100‑1 (MQ=255) atatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATg > 1:3104902/1‑100 (MQ=255) atatCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATg > 1:2647994/1‑100 (MQ=255) atCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATgcg > 1:2596554/1‑100 (MQ=255) cTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGCTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCa > 2:807703/1‑100 (MQ=255) ggCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATa > 1:1997252/1‑100 (MQ=255) gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 2:584947/1‑100 (MQ=255) gCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAG‑AAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAAc < 1:2895410/100‑1 (MQ=255) cATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa > 2:1613962/1‑99 (MQ=255) cATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAAc < 2:2648011/100‑1 (MQ=255) aTGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATaa < 2:672473/98‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:2623626/100‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 2:1258441/100‑1 (MQ=255) ttgtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGAAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatg < 1:777586/100‑1 (MQ=255) gtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca < 2:2426411/100‑1 (MQ=255) gtACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgca > 1:2034438/1‑100 (MQ=255) aCTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACcatgcatg > 1:1362972/1‑100 (MQ=255) cTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGt > 1:1754617/1‑100 (MQ=255) tAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTa > 1:971766/1‑100 (MQ=255) aaaaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaaa > 1:523344/1‑100 (MQ=255) aaaaTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTaaa > 2:2805826/1‑100 (MQ=255) aTCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCTAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATAc > 1:1880502/1‑100 (MQ=255) cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCa > 2:2152015/1‑100 (MQ=255) cGATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCa > 2:1340824/1‑100 (MQ=255) gATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt < 2:2411158/100‑1 (MQ=255) gATGTTTTGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCAt > 2:10610/1‑100 (MQ=255) ttttGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGttt > 2:1410229/1‑100 (MQ=255) ttGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTan < 1:3426820/100‑2 (MQ=255) ttGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAc > 1:1833249/1‑100 (MQ=255) tGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAcc < 1:2545031/100‑1 (MQ=255) tGCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTAcc < 2:371800/100‑1 (MQ=255) gCTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCg < 2:272827/100‑1 (MQ=255) cTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGt > 2:3245952/1‑100 (MQ=255) cTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGt > 1:2770226/1‑100 (MQ=255) cTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGt < 1:2343822/100‑1 (MQ=255) cTTTGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACAATGCATGAAAATACCATGATTACCGt > 1:3138061/1‑100 (MQ=255) tttGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTg < 1:1160892/100‑1 (MQ=255) ttGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGc > 2:1206234/1‑100 (MQ=255) tGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCt < 1:2078184/100‑1 (MQ=255) tGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAAACATGCATGTAAATACAATGTTTACCGTGCt > 1:2446975/1‑100 (MQ=255) tGACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGAAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCt < 1:2058274/100‑1 (MQ=255) gACAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTa > 2:1608092/1‑100 (MQ=255) cAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:2752602/1‑100 (MQ=255) cAATCCCTTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGt > 2:2904562/1‑100 (MQ=255) | TCCCGCTTTATAAGCCGATTAAATGATGAATAAACGCCCCTGTTAATGAATATCTGGCATGTTGTACTAAAAATCGATGTTTTGCTTTGACAATCCCCTGGTGTTTTGCGAAAACATTCGAGGAAGAAAAAAAACAGTATTCTTATATGCGCATAACCATGCATGTAAATACCATGTTTACCGTGCTAGT > NC_000913/932207‑932396 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |