New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 226398 = | NA (NA) | 12 (0.120) | 10/166 | NT | NA | noncoding (640/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
? | NC_000913 | 226415 = | NA (NA) | noncoding (657/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
ATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/226502‑226398 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttaagTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > NC_000913/226415‑226513 ATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTATCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAG > 1:1130282/1‑100 ATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAG > 2:2204615/1‑100 ATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAG < 1:1613340/100‑1 ATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAG < 2:2506159/100‑1 ATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGAGCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAG < 2:1028001/100‑1 TTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGT < 1:175275/100‑1 TAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTT < 1:2656001/100‑1 TAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTT < 2:2151060/100‑1 TAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTT > 2:2827811/1‑100 TAGTCGGTTCGGTCCGCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGTCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTT < 1:1033549/100‑1 TAGGCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCCACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTT < 2:417972/100‑1 AGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTA < 2:2525776/100‑1 AGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTA > 1:2861575/1‑100 AGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTA > 2:1078691/1‑100 AGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTA > 2:2300994/1‑100 AGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTA < 1:1131941/100‑1 AGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTA < 2:4527/100‑1 AGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTA > 1:1410524/1‑100 AGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTCAAC‑GCCCAGTTA > 1:2974560/1‑100 nTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTA > 1:1029248/2‑99 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACTCAACCTTCAACCTTCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA < 2:1460340/100‑1 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTTGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 1:955745/1‑100 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 2:338783/1‑100 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 1:493448/1‑100 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA < 1:2771200/100‑1 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 1:131173/1‑100 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA < 2:1341480/100‑1 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 2:70267/1‑100 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA < 2:2213799/100‑1 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 1:1725172/1‑100 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 1:196435/1‑100 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA < 1:1920125/100‑1 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA < 2:2794133/100‑1 GTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGCTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 2:1339233/1‑100 GTCGGTTCGGTCCACCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAA > 1:2108382/1‑100 TCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAAG < 1:2515466/100‑1 TCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAAG < 2:2612924/100‑1 TCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAAG < 1:1119316/100‑1 TCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAAG < 1:689228/100‑1 TCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAAG < 2:3082399/100‑1 TCGGTTCGGTCCTCCAGTGAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAAG < 1:2496450/100‑1 CGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑TGGGCGTTAAGTTGCAG < 1:2486361/100‑1 GTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCCACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑CCCCAGTTAAGcatcggtt > 2:897551/1‑92 GTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAACTGGGC‑GTTAAGTTGCAGGG < 1:1997516/100‑1 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TTAAGTTGCACGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAAAACTAACTGGAGGACCGAACAGACTAATGTTGAAA > 2:295812/1‑100 TAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAA > 2:747731/1‑100 TAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAA > 2:2808940/1‑100 TAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAA < 2:844818/100‑1 TAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAA < 1:219639/100‑1 TAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAA < 2:2082201/100‑1 TAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGATGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAA > 2:1885061/1‑100 TAAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGAGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAA < 2:1997499/100‑1 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAA < 1:1675036/100‑1 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAA < 2:215133/100‑1 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAA > 1:832696/1‑100 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAA < 1:945527/100‑1 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAA < 1:281889/100‑1 AAGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGAACTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAA > 1:2951001/1‑100 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAgt < 1:2113141/100‑3 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAAT > 1:1100394/1‑100 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAAT > 1:733339/1‑100 AGTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGAAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAAT > 1:951004/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT < 2:2112630/100‑1 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT < 1:2607261/100‑1 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 2:1384089/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT < 2:1183054/100‑1 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 1:366595/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 1:288632/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 2:537194/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 1:2129195/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 1:942789/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 1:1891601/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 2:2491762/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > 1:1993856/1‑100 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT < 1:2020576/100‑1 GTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAAT > 2:724653/1‑99 ATTAGTCGGTTCGGTCCTCCAGTTAGTGTTACCCAACCTTCAACCTGCCCATGGCTAGATCACCGGGTTTCGGGTCTATACCCTGCAACTTAAC‑GCCCAGTTAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/226502‑226398 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gttaagTTGCAGGGTATAGACCCGAAACCCGGTGATCTAGCCATGGGCAGGTTGAAGGTTGGGTAACACTAACTGGAGGACCGAACCGACTAATGTTGAAAAATT > NC_000913/226415‑226513 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |